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GEO数据库使用教程及在线数据分析工具.GEO数据库全称GENEEXPRESSIONOMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。.它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说只要是目前已经发表的论文，论文中...
GEO的数据集有不同的平台，比如本文的GEO数据就涉及GPL570,GPL96,GPL11154这个3个平台，一般来说，同一个平台的数据合并分析的效果较好，所以作者选择合并GSE77298和GSE82107这两个数据集，因为它们都来自GPL570平台。
GEO数据下载：网页下载和使用GEOquery包GEO数据库里的数据是免费的，可以直接在线下载。但是，在下载数据之前你要了解GEO数据库的4个概念和4个数据存放类型：GSE数据编号(Series)GPL数据编号(GEOplatforms)GSM数据编号(Samples)GDS数据编号(Datasets)一篇文章可以有一个或者多个GSE(Series)数据集，一个GSE里面...
先给大家分享5个最权威、数据最全的正规官方数据网站，写论文时非常有帮助。.链接地址：国家数据链接地址：中华人民共和国国家统计局>>统计数据链接地址：中国互联网数据平台.链接地址：统计数据-中华人民共和国商务部网站.链接地址：数据分析...
Datasets(数据集)GEO数据集（GDSxxx）是GEO样本数据的精选集。一个GDS记录代表了一个在生物学和统计学上可比较的GEO样本的集合，并构成了GEO数据可视化和分析工具的基础。GDS内的样本来自同一个平台，它们共享一组共同的探针集。
读完这100篇论文，你也是大数据高手！.PayPal高级工程总监AnilMadan写了这篇大数据的文章，一共有100篇大数据的论文，涵盖大数据技术栈，全部读懂你将会是大数据的顶级高手。.当然主要是了解大数据技术的整个框架，对于我们学习大数据有莫大好处。.开源...
各位下午好！由于之后我们可能需要向NCBI或者GEO上上传大批量数据，而采用FTP工具会经常因为网络不稳定的原因出现问题。现在在服务器安装了lftp工具，可以自动快速的上传数据（在服务器上可直接输入lftp-h查看帮助文档）。具体使用方法如下：首先生成一个lftp运行的脚本run.lftp，并放在上…
本文用于记录如何向论文作者申请其所用数据集与源码。[日常]如何向论文作者索要源码与数据集没头脑的自留地2019-03-0312:55:3422425收藏65
利用SRA号从NCBI下载测序原始数据生物或医学中涉及高通量测序的论文，一般会将原始测序数据上传到公开的数据库，上传方式见测序文章数据上传找哪里；并在文章末尾标明数据存储位置和登录号,如ThedatafromthisstudywasdepositedinNCBI…
使用机器学习连接TCGA和GEO数据首先，作者用SVM支持向量机，将488例具有完整卵巢癌分子分型的TCGA数据作为训练集，将422例前人已经预测完毕的带分子分型的基因表达数据作为验证集，建立机器学习预测模型。
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GEO的数据集有不同的平台，比如本文的GEO数据就涉及GPL570,GPL96,GPL11154这个3个平台，一般来说，同一个平台的数据合并分析的效果较好，所以作者选择合并GSE77298和GSE82107这两个数据集，因为它们都来自GPL570平台。
GEO数据下载：网页下载和使用GEOquery包GEO数据库里的数据是免费的，可以直接在线下载。但是，在下载数据之前你要了解GEO数据库的4个概念和4个数据存放类型：GSE数据编号(Series)GPL数据编号(GEOplatforms)GSM数据编号(Samples)GDS数据编号(Datasets)一篇文章可以有一个或者多个GSE(Series)数据集，一个GSE里面...
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使用机器学习连接TCGA和GEO数据首先，作者用SVM支持向量机，将488例具有完整卵巢癌分子分型的TCGA数据作为训练集，将422例前人已经预测完毕的带分子分型的基因表达数据作为验证集，建立机器学习预测模型。
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