咱们从一篇已经发表的SCI论文来开始实用GEO数据库挖掘。文章之前介绍过,传送门如下这一系列的内容只有一个目的:帮助知友从零开始,学会使用GEO数据库的SCI写作。文章methods中GEO的描述Microarraydatasets
目前GEO数据库中共包含了近11万个数据集,约290万个标本,是一个极其庞大的巨无霸型公共数据库。临床医生可以从该网站上免费下载与自己研究方向相似的数据来进行分析,并撰写论文。
后者GEO数据库全称是GeneExpressionOmnibusdatabase,是由美国NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,论文中涉及到的基因表达检测的数据几乎都提交到了这个数据库。GEO除了二代测序数据,还包含芯片测序、单细胞测序数据,样本数据
从课题设计,工具使用,再到零代码,一键分析,原始数据下载,再到论文写作,不得不说,这个由一群医生创建的生信平台,实在是太懂广大科研gou了。02中文版GEO数据库相比TCGA主要存储高通量(二代测序)数据的样本数据,GEO数据库全称GeneExpressionOmnibusdatabase,是由美国NCBI创建并维护...
05你们要的GEO数据库来啦!快进来学习吧,资料在简介小陈医生想躺平3149播放·12弹幕...【21.3.27酸谈】常用数据库、生信写作思路,临床医生如何用公共数据库发SCI...
中文版GEO数据库.相比TCGA主要存储高通量(二代测序)数据的样本数据,GEO数据库全称GeneExpressionOmnibusdatabase,是由美国NCBI创建并维护的基因表达数据库。.它创建于2000年,论文中涉及到的基因表达检测的数据几乎都提交到了这个数据库。.GEO除了二代测...
两天一夜教您用R语言挖掘TCGA、GEO等公共数据库发表文章10月16-17日,免费查看详细内容。9.19-20线上临床预测模型类论文主题培训班9.19-20线上肠道菌与代谢研究课题设计、实验数据分析
这周我们有个老师特地给我们推荐了一个专门针对GEO数据分析的综合在线工具--BART,这个工具最近发表在BMCBioinformatics上,是一个从CELL或expression表达矩阵输入到可视化分析、富集分析的综合分析平台。对于那些生信还没入门的同学来说,该工具的...
这篇3+分文章带你学会多数据库分析免疫浸润.今天和大家分享的是2020年3月发表在JournalofCancer(IF:3.182)上的一篇文章,“TheimmuneinfiltrationinclearcellRenalCellCarcinomaandtheirclinicalimplications:AstudybasedonTCGAandGEOdatabases”,作者使用GEO和TCGA数据集研…
ARCHS4数据库是一个把GEO数据库的一些人和鼠的二代测序的数据进行统一流程前期分析的数据库。通过分析,最终把原始的fastq的数据转换为了表格数据。这样我们就可以使用了。数据库的使用很简单,我们只需要在数据检索的地方检索想要查看的数据集就
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目前GEO数据库中共包含了近11万个数据集,约290万个标本,是一个极其庞大的巨无霸型公共数据库。临床医生可以从该网站上免费下载与自己研究方向相似的数据来进行分析,并撰写论文。
后者GEO数据库全称是GeneExpressionOmnibusdatabase,是由美国NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,论文中涉及到的基因表达检测的数据几乎都提交到了这个数据库。GEO除了二代测序数据,还包含芯片测序、单细胞测序数据,样本数据
从课题设计,工具使用,再到零代码,一键分析,原始数据下载,再到论文写作,不得不说,这个由一群医生创建的生信平台,实在是太懂广大科研gou了。02中文版GEO数据库相比TCGA主要存储高通量(二代测序)数据的样本数据,GEO数据库全称GeneExpressionOmnibusdatabase,是由美国NCBI创建并维护...
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中文版GEO数据库.相比TCGA主要存储高通量(二代测序)数据的样本数据,GEO数据库全称GeneExpressionOmnibusdatabase,是由美国NCBI创建并维护的基因表达数据库。.它创建于2000年,论文中涉及到的基因表达检测的数据几乎都提交到了这个数据库。.GEO除了二代测...
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