小弟想做一个跨膜蛋白的分子动力学,具体问题是:无法建出一个合适厚度的双分子层,满足蛋白的跨膜要求。另外,用VMD将蛋白与膜放在一块后,不知道应保存为哪种类型的文件。后期的MD也不会:cry:。初学乍练,完全没方向。想找一个高手请教,愿散尽家财!
几类重要蛋白质的分子动力学模拟研究,同源模建,抑制剂,分子动力学模拟,对接模式。酶是大分子蛋白的一种,它是由活细胞产生并具有催化功能的蛋白质。由于计算机技术的日益发展,计算机模拟方法被广泛应用于 …
蛋白质分子动力学模拟. rogerzhanglijie 2012-10-18 09:58:59 7505 收藏 8. 分类专栏: 分子动力学 文章标签: diagnostics reference file velocity input crash. 分子动力学 专栏收录该内容. 47 篇文章 7 订阅. 订阅专栏. 1.系统的准备:. 假设有一个PDB文件含有500多个残基并且构成两条链 ...
自己做了一个膜蛋白的同源模建(同源性不算很高),又做了动力学模拟,蛋白的体系还是比较大的,加起来能有1000多个氨基酸。请问这样的文章能投个什么杂志?影响因子2-3之间。最好能给几个例子,求高手给个方向,谢谢!
蛋白质体系分子动力学模拟的前沿进展——从介科学角度重新审视. 任瑛 徐骥. 【摘要】: 蛋白质是生命的物质基础,是生命活动的主要承担者,对蛋白质时空多尺度结构及其控制机制的深入理解是探索生命起源、病理认知及新药开发的基础.受实验表征手段及时空 ...
基于分子动力学模拟的胶原分子力学特性研究[J].医疗卫生装备,2018,39(3):1-5. 6 刘雨.TET蛋白家族在人类肿瘤疾病中的作用[J].临床医药文献杂志(电子版),2018,5(30):192 7 张驰,刘丹丹,刘建中.
Gromacs分子动力学模拟主要可以分为以下几个步骤,不同的体系步骤可能略有不同。在开始之前,先简单了解一下预平衡: 分子动力学模拟的最终目的是对体系进行抽样,然后计算体系的能量,各种化学键,成分分析等等。打个比方说,我们有一个蛋白质,我们想将它放入一种溶液中(可能是水,也 ...
分子动力学模拟研究蛋白质序列—功能关系. 【摘要】: 蛋白质是生物体内主要的功能执行者,几乎参与所有的生命活动。. 虽然DNA-mRNA-蛋白质的信息传递方向早已为大家所知,但是还有很多细节都不清楚。. 尤其是少数残基的差异对蛋白质在溶液中稳定性的影响,对 ...
小弟想做一个跨膜蛋白的分子动力学,具体问题是:无法建出一个合适厚度的双分子层,满足蛋白的跨膜要求。另外,用VMD将蛋白与膜放在一块后,不知道应保存为哪种类型的文件。后期的MD也不会:cry:。初学乍练,完全没方向。想找一个高手请教,愿散尽家财!
几类重要蛋白质的分子动力学模拟研究,同源模建,抑制剂,分子动力学模拟,对接模式。酶是大分子蛋白的一种,它是由活细胞产生并具有催化功能的蛋白质。由于计算机技术的日益发展,计算机模拟方法被广泛应用于 …
蛋白质分子动力学模拟. rogerzhanglijie 2012-10-18 09:58:59 7505 收藏 8. 分类专栏: 分子动力学 文章标签: diagnostics reference file velocity input crash. 分子动力学 专栏收录该内容. 47 篇文章 7 订阅. 订阅专栏. 1.系统的准备:. 假设有一个PDB文件含有500多个残基并且构成两条链 ...
自己做了一个膜蛋白的同源模建(同源性不算很高),又做了动力学模拟,蛋白的体系还是比较大的,加起来能有1000多个氨基酸。请问这样的文章能投个什么杂志?影响因子2-3之间。最好能给几个例子,求高手给个方向,谢谢!
蛋白质体系分子动力学模拟的前沿进展——从介科学角度重新审视. 任瑛 徐骥. 【摘要】: 蛋白质是生命的物质基础,是生命活动的主要承担者,对蛋白质时空多尺度结构及其控制机制的深入理解是探索生命起源、病理认知及新药开发的基础.受实验表征手段及时空 ...
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Gromacs分子动力学模拟主要可以分为以下几个步骤,不同的体系步骤可能略有不同。在开始之前,先简单了解一下预平衡: 分子动力学模拟的最终目的是对体系进行抽样,然后计算体系的能量,各种化学键,成分分析等等。打个比方说,我们有一个蛋白质,我们想将它放入一种溶液中(可能是水,也 ...
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