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9. 能量最优化后首先保持蛋白质不动，对蛋白质周围水环境进行动力学模拟，该过程称为位置限制性分子动力学，对溶剂分子进行平衡计算，可以使溶剂分子填补空间： gmx grompp -f nvt.mdp -c em.gro -p topol.top -o nvt.tpr 运行： gmx mdrun -deffnm nvt
做分子动力学方面的研究，现在有哪些杂志接收这类的文章？ 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。 欢迎协助我们监督管理，共同维护互联网健康，违规、侵权举报等事项，请邮件联系 wangxiaodong2@tal.com 处理（点此查看侵权举报方式） ...
基于分子动力学算法的材料拉伸虚拟仿真实验设计 1. 引言 材料力学是材料类、土木类、机械类等本科专业的专业基础课程 [1] [2]，其中材料力学性能主要研究材料在承受载荷时变形断裂规律并由此评定材料的力学性质，并获得材料力学性能指标，如屈服强度、拉伸强度、伸长率及收缩率等，以此 ...
基于分子模拟技术的变压器油纸绝缘老化研究综述[J].绝缘材料,2018,51(5):7-17. 被引量：6 4 王煜烨,汤爱涛,潘荣剑,潘复生.分子动力学在镁及镁合金微观塑性变形中的应用进展[J].材料导报,2019,33(19
摘要 采用分子动力学方法,在相同的全原子模型、聚合度及温度和压力条件下,对天然橡胶(NR)、杜仲橡胶[反式-1,4-异戊二烯橡胶(TPI)]和顺丁橡胶(BR)分子模型的拉伸行为进行模拟,研究拉伸过程中分子模型的应力-应变、能量、均方位移和均方回转半径的变化。 。结果表明:NR分子模型与TPI分子模型的拉伸 ...
自己做了一个膜蛋白的同源模建（同源性不算很高），又做了动力学模拟，蛋白的体系还是比较大的，加起来能有1000多个氨基酸。请问这样的文章能投个什么杂志？影响因子2-3之间。最好能给几个例子，求高手 …
摘要： 综述了分子动力学模拟技术的发展,介绍了分子动力学的基本原理,有关的有限差分技术,势函数的发展,初始条件和边界条件的选取,平衡态系综及其调控,感兴趣量的提取,分子动力学的特别用途以及与其他计算方法的结合.最后还指出了分子动力学模拟方法本身进一步研究的方向.
做的分子动力学模拟计算的，写了一篇文章，毕业要求是EI，但是导师让看看能不能试试发好点的，就想知道下面这几个期刊的投稿评审周期大概要多久——1.化学学报2.物理学报3.物理化学学报4.含能材料，，，或者大家有没有知道相对好投的周期短点的期刊，谢谢！
为了研究孪晶间距的大小对纳米钨力学性能及变形机理的影响,利用分子动力学对不同孪晶间距的孪晶钨进行了单轴拉伸模拟。使用近邻列表技术(CNA)和位错分析方法(DXA)对拉伸过程中纳米钨的变形失效过程和微结构演化进行了表征分析,从而揭示孪晶间距对纳米钨力学性能影响微观机理。
分子动力学模拟研究钯金属团簇的熔化行为 来源期刊 北京化工大学学报（自然科学版） 学科 物理学 年，卷（期） 2007,3 关键词 分子动力学 多体作用势 钯 壳对称 纳米团簇 所属期刊栏目 化学与化学工程 研究方向 页码范围 225-229 页数 5页 分类号 O414.13
9. 能量最优化后首先保持蛋白质不动，对蛋白质周围水环境进行动力学模拟，该过程称为位置限制性分子动力学，对溶剂分子进行平衡计算，可以使溶剂分子填补空间： gmx grompp -f nvt.mdp -c em.gro -p topol.top -o nvt.tpr 运行： gmx mdrun -deffnm nvt
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基于分子动力学算法的材料拉伸虚拟仿真实验设计 1. 引言 材料力学是材料类、土木类、机械类等本科专业的专业基础课程 [1] [2]，其中材料力学性能主要研究材料在承受载荷时变形断裂规律并由此评定材料的力学性质，并获得材料力学性能指标，如屈服强度、拉伸强度、伸长率及收缩率等，以此 ...
基于分子模拟技术的变压器油纸绝缘老化研究综述[J].绝缘材料,2018,51(5):7-17. 被引量：6 4 王煜烨,汤爱涛,潘荣剑,潘复生.分子动力学在镁及镁合金微观塑性变形中的应用进展[J].材料导报,2019,33(19
摘要 采用分子动力学方法,在相同的全原子模型、聚合度及温度和压力条件下,对天然橡胶(NR)、杜仲橡胶[反式-1,4-异戊二烯橡胶(TPI)]和顺丁橡胶(BR)分子模型的拉伸行为进行模拟,研究拉伸过程中分子模型的应力-应变、能量、均方位移和均方回转半径的变化。 。结果表明:NR分子模型与TPI分子模型的拉伸 ...
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为了研究孪晶间距的大小对纳米钨力学性能及变形机理的影响,利用分子动力学对不同孪晶间距的孪晶钨进行了单轴拉伸模拟。使用近邻列表技术(CNA)和位错分析方法(DXA)对拉伸过程中纳米钨的变形失效过程和微结构演化进行了表征分析,从而揭示孪晶间距对纳米钨力学性能影响微观机理。
分子动力学模拟研究钯金属团簇的熔化行为 来源期刊 北京化工大学学报（自然科学版） 学科 物理学 年，卷（期） 2007,3 关键词 分子动力学 多体作用势 钯 壳对称 纳米团簇 所属期刊栏目 化学与化学工程 研究方向 页码范围 225-229 页数 5页 分类号 O414.13
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