The basic facts about the research of the gingerol of the : Gingerol has a great deal of high value and potential in the area of medication and food industry. This passage has given a brief introduction of the components, function and extraction of the gingerol with special emphasis on the explaination of its extraction and abstriction as well as the problems that exist in the words: Gingerol; gingerol(医学方面的词汇,我查到的姜辣素和姜酚是一样的词。。。);abstraction; abstriction.希望我的回答能够帮到你哈!
纵观各领域焦点文献,不难发现,目前研究者们主要采用四种组装策略: 第一种策略 是依赖于亲本序列进行高效组装的Trio-binning[1](Illumina+PacBio)法。这种方法虽简便易行,但在亲本为杂合子时易出现reads的错误划分; 第二种策略 是不依赖亲本序列,结合Hi-C数据,产出染色体级别单倍型的DipAsm[2](HiFi+Hi-C)法,但对高度杂合区域易出现错误划分; 第三种策略 是有效利用HiFi reads生成高质量单倍体的Hifiasm[3]法,与DipAsm相比,Hifiasm不仅保持了不依赖亲本从头组装的优势,还降低了对Hi-C数据的依赖性,简化了流程,一键式实现组装和定相,且可整合Hi-C数据帮助挂载,正逐渐成为高质量组装的首选方法; 第四种策略 是多倍体组装策略——PolyGembler[4]或nPhase[5]法。其中前者分型需要提供家系数据,后者需要提供参考基因组序列。 由此可见,异源多倍体单倍型分型原则上需提供亲本序列,若不能提供,至少要提供其进化上的祖先种/近似祖先种序列(用于比对来拆分不同的亚基因组),并在后期帮助挂载。到此,单倍型组装的主流策略已介绍完毕,细心的你更青睐哪种策略呢? 虽然大家已经对单倍型组装策略有了一定了解,但我们仍需再趁热打铁一把,继续从文章分析内容出发,深入了解下单倍型基因组的研究思路! 一、研究背景 茶是一种极为重要的经济作物,含有多种被认为对人体健康有益的多酚化合物。茶树是无性繁殖农艺作物,这种无性繁殖能有效地保持有价值的基因型,避免其因分离或有性重组而丢失。同时无性繁殖也容易导致作物积累有害突变,造成植物突变负荷升高。个体中高水平的有害突变最终会降低相对适合度,从而降低农艺表现。目前关于茶的遗传负荷响应机制尚不清楚。本研究将通过组装茶单倍型基因组,对等位基因特异性表达进行分析,并结合全基因组重测序数据对群体遗传进化进行分析,以预测对茶树驯化育种具重要价值的分子机制。 二、材料方法 PacBio+Illumina+Hi-C组合测序策略。以1个铁观音(TGY)个体为样本,结合129个全基因组重测序数据和近期发表的61个非冗余全基因组重测序资料构建了一个完整的数据集。 三、主要结果 1.铁观音单倍型基因组组装 TGY的基因组大小约为 Gb,杂合度为。文章首先使用PacBio长序列对初始contigs进行组装,随后使用Illumina短序列进行纠正,获得了大小为 Gb的基因组,表明整个基因组具有高杂合度。接着,文章对杂合序列使用Khaper程序进行处理,得到大小为 Gb的嵌合式基因组,此时contig N50为 Mb,BUSCO完整性评估结果为。最后,文章利用TGY基因组的高杂合性,使用ALLHiC和Canu进行单倍型拆分和定相,从而产生15对假染色体和 Gb的锚定序列。共线性分析结果显示:两种单倍型的基因序列高度一致。同时对单倍型间序列差异进行分析,发现两种单倍型之间序列的重叠率为。 2. 铁观音单倍型基因组与茶树基因组变异研究 文章首先对单倍型基因组进行选择压力分析,发现的等位基因对包含至少一个非同义替换。这些差异表明,TGY单倍型基因组对揭示等位基因结构和功能差异具参考意义。随后文章对不同组织中等位基因表达情况进行分析,发现大多数等位基因的表达模式是一致的,例如单倍型B的CsSRC2基因在第二个外显子中具有两个3-bp的插入和一个78-bp的缺失,引入了两个额外的氨基酸(赖氨酸和天冬酰胺)和蛋白质序列中26个氨基酸的去除。而在单倍型A中也检测到一个非同义突变,使氨基酸由谷氨酰胺变为组氨酸。对CsSRC2进行转录表达水平分析,结果显示,在不同组织中CsSRC2等位基因表达模式一致。另外,文章还发现了386个在组织中表达有差异的等位基因,其中几个基因与挥发性有机化合物的生物合成有关,包括黄酮、黄酮醇和萜类化合物。随后文章对等位基因差异表达(ASE)结果进行统计,发现在14,691个基因中,有4,423个基因()在茶叶中表现出显著的ASE。同时在6个组织中有1,528个基因偏向于一个等位基因的表达,这些基因通常与核糖体、自噬作用、转录因子和剪接体等多种生物学过程相关,提示减少有害突变的关键因子可能与基本生物功能中差异表达的基因相关联。 文章又收集了129份茶树材料和已发表的61份重测序茶树样品,进行了全基因组重测序,分析确定了9,407,149个SNPs和829,388个小Indels (< 10 bp)。文章接着利用496,448个单拷贝基因的SNPs进行系统发育分析,结果显示茶树主要分成3个类群:C. taliensis、C. sinensis var. sinensis(CSS)和C. sinensis var. assamica(CSA)。使用SplitsTree和TreeMix进行分析,结果显示茶树系统发育关系网络复杂,且茶树群体之间存在显著的基因交换。文章最后对CSA和CSS驯化基因进行分析,发现两个品种具有不同的芳香化合物、株高和耐寒性等特点,可能与驯化过程中人工选择作用相关。 四、研究结论 该研究清楚地表明现代栽培品种种内和种间基因渐渗对遗传多样性的贡献,为茶树的进化历史提供了遗传学和分子生物学方面的见解。同时,该研究表明,PacBio+Illumina+Hi-C测序技术可以助力准确单倍型基因组组装,为分析变异与驯化机制提供基因组资源。 一、研究背景 荔枝是重要的热带水果,在20多个国家都有种植,其突出的营养成分和诱人的颜色,使其成为国际市场上具有吸引力的热带或亚热带水果之一。依据果实成熟期差异,荔枝品种可分为极早熟品种(EEMC)、中早熟品种(EMC)和晚熟品种(LMC)。果实品质较好的品种通常归属于LMC类群,而EEMC类群的品种数量较少,生产价值较低。然而造成荔枝品种差异的分子机制尚不清楚。研究荔枝基因组的结构和进化对促进荔枝及无患子科近缘植株的遗传改良具重要价值。 二、材料方法 PacBio+Illumina +Hi-C+10x Genomics组合测序策略。以妃子笑为高质量参考基因组,结合72份野生或栽培种质全基因组重测序资料构建数据集。 三、主要结果 1. 妃子笑单倍型基因组组装 妃子笑的初始组装基因组大小为962Mb,基因组杂合度。文章使用流式细胞仪或Survey方法评估基因组大小约为500或460Mb,说明初始组装版本包含两套染色体信息。所以文章首先使用HaploMerger2进行单倍型分型,选择与流式预估大小相近的基因组结合Hi-C数据进行挂载,得到了15条假染色体(pseudochromosomes),大小为470Mb,BUSCO评估结果为。由于妃子笑基因组具高杂合度,使得文章能够接着利用 SNPs的reads分型组装方法和10x Genomics测序数据,成功组装出妃子笑的两个单倍型基因组,然后利用不同群体材料全基因组重测序数据与15对染色体序列进行比对,根据覆盖度的差异获得了云南单倍型(HY,450M)基因组和海南单倍型(HH,455M)基因组,指明了妃子笑基因组的来源。最后文章对获得的单倍型进行了准确性的分析,发现HY和HH基因组序列之间总SNPs的平均杂合度为,与k-mer估计值相似,说明此次单倍型分型是准确的。 2. 荔枝全基因组复制事件和变异分析 生成单倍型基因组后,文章首先对荔枝基因组进行了全基因组复制事件(WGD)分析,发现荔枝仅发生过核心双子叶植物共有的全基因组三倍化事件,说明以荔枝为代表的无患子科近期没有发生WGD。随后,文章又收集了34份野生荔枝品种和38份栽培荔枝品种进行全基因组重测序分析,共鉴定出80,235,643个变异,为荔枝的遗传驯化研究提供参考。 3. 荔枝基因组等位基因差异表达分析 由于荔枝基因组中相关等位基因差异表达可能对其生长和进化产生深远影响。文章继续对35个荔枝样品中等位基因表达情况进行分析,发现约14,000个差异等位基因(DEAs)处于稳定差异表达状态。随后文章继续对妃子笑荔枝样品中等位基因表达情况进行分析,确定了13,517个DEAs。接着文章对DEAs分布区域进行汇总,发现这些DEAs在某些基因组区域中高度富集,例如,许多DEAs积聚在5号染色体的3′端。同时,文章发现与非差异表达的等位基因(EEAs)相比,DEAs的启动子、内含子以及3'UTR和5'UTR具有更高的SNPs密度,这表明DEAs表达量的差异可能与转录因子和启动子区的序列变异有关。最后文章对不同区域SNPs密度进行分析,发现外显子中的SNPs密度显著低于其他区域(例如,外显子与启动子的差异为倍),同时对于这些外显子SNPs,转换比颠换更为普遍,且多数是非同义的。因此,文章推测DEAs的两个等位基因可能具不同功能,导致其对突变的耐受性较低。 为了剖析荔枝果实成熟的调控网络,文章使用72个种质进行了全基因组关联分析(GWAS),发现一个开花相关基因(LITCHI019307)在荔枝中具差异表达。接着文章对不同品种基因结构进行分析,发现HY基因组中鉴定到的 kb缺失片段可能有助于解释荔枝种质之间COL307差异表达和开花时间差异。 四、研究结论 该研究通过PacBio+Illumina+Hi-C+10x Genomics测序技术,结合全基因组重测序数据,助力准确单倍型基因组组装,并对等位基因在不同组织中差异表达情况进行分析,为利用变异助力驯化机制提供基因组与转录本资源。同时结合全基因组关联分析,为分子育种和基因组选择提供了理想的靶标,为培育多样化荔枝品种提供参考。 一、研究背景 生姜,广泛的药用植物和香料之一,是许多国家传统药用系统中最著名的非处方药之一。目前全球有超过39个国家在种植生姜,中国和印度是两个生姜生产大国。FAO的数据显示,2019年全球生姜产量为408万吨,是世界贸易中具重要经济价值的植物。同时生姜中具有多种生物活性化合物。其中,姜辣素依据其药理特性,被认为是生姜中最重要的药用化合物。然而,在姜属中,迄今为止只有叶绿体基因组序列已公布,可用来进行代谢相关研究的高质量基因组组装研究仍未开展,这种基因组资源的缺乏严重阻碍了人们对生姜基因组进化和姜辣素生物合成途径的理解。本研究将通过获得生姜高质量基因组与拆分单倍型基因组,进一步揭示生姜生物学和育种相关内容,并为物种特异性姜辣素生物合成途径提供依据。 二、材料方法 PacBio+Illumina +Hi-C组合测序策略。 三、主要结果 1. 生姜高质量基因组和单倍型基因组组装 为了对生姜的基因组大小进行评估,文章进行了k-mer分析,结果表明生姜基因组大小约为 Gb,杂合度为。文章使用Illumina、PacBio和Hi-C测序数据,对生姜" Zhugen "(2n = 2x = 22)基因组进行组装。首先文章使用Falcon软件进行基因组contigs的从头组装,并使用Falcon phase进行定相。然后文章用Arrow抛光contigs并用Pilon校正。得到单倍型1和单倍型0。最后文章使用Hi-C数据辅助挂载,并获得了两套染色体水平的单倍型基因组,其中单倍型1的基因组大小为 Gb,包含669个contigs(N50为 Mb)。而单倍型0的基因组大小为 Gb,具有636个contigs(N50为 Mb)。 2. 生姜单倍型基因组间的比较分析和等位基因差异表达分析 文章使用PacBio长序列验证单倍型1和单倍型0。发现PacBio长序列和单倍型1之间有的重叠,与单倍型0有的重叠,而两种单倍型之间的杂合率为,与k-mer分析一致,表明单倍型间的分相是精确的。为了进一步了解单倍型间的差异,文章继续对两种单倍型的选择压力进行分析,发现二者单拷贝基因的Ka / Ks比率是一致的,这意味着两种单倍型在生姜的驯化历史中经历了相似的选择压力。此外,文章通过共线性分析在两种单倍型之间共鉴定到了57个主要共线性块,且包含12个反转,表明单倍型间仍存在差异。随后文章继续对两种单倍型间的同源基因进行分析,共鉴定到了55,635个同源基因(占所有注释基因的)。然后文章进一步对两种单倍型的17,226个等位基因对的特征进行分析,发现大部分等位基因在染色体上的分布模式相似,且这些等位基因的表达水平在单倍型之间没有显著差异。但是有2,055个基因对()表现出等位基因之间的差异表达,且这些差异位点主要在代谢途径中富集。 为了进一步揭示生姜生物代谢路径中的关键因子,文章对不同发育阶段生姜根和茎中的差异表达基因(DEGs)进行分析,发现不同发育阶段生姜根茎中共6,690个基因呈现显著下调表达趋势,773个基因上调。而转录组学和代谢物相关性分析表明,不同发育阶段组织中部分基因家族的表达模式与姜辣素和姜黄素的积累程度相关。 四、研究结论 该研究通过PacBio+Illumina+Hi-C组合测序技术助力准确单倍型基因组组装,并对单倍型间差异进行了细致区分。随后,结合比较基因组,对生姜基因组进化情况进行研究;并结合转录组学和代谢组学对在不同发育阶段组织中等位基因差异表达情况和代谢物含量进行关联分析,分析了姜辣素生物合成基因家族成员之间的相关性,并提出了姜辣素类似物的骨架生物合成途径,为了解生姜代谢奠定了基础。 上述内容均显示,单倍型基因组是结合变异与差异表达分析的重要突破口,同时也是后续实现优质分析的先决条件。对分析内容进行总结后,不难发现,单倍型基因组与全基因组重测序相结合的研究方法可以为高水平文章的问世提供更多分析内容与保障。 参考文献 1. Koren S, Rhie A, Walenz B P, et al. De novo assembly of haplotype-resolved genomes with trio binning[J]. Nature Biotechnology, 2018, 36:1174–1182. 2. Garg S, FungtammasanA, Carroll A, et al. Chromosome-scale, haplotype-resolved assembly of human genomes[J]. Nature Biotechnology, 2021, 39:309–312. 3. Cheng H, Concepcion G T, Feng X, et al. Haplotype-resolved de novo assembly using phased assembly graphs with hifiasm[J]. Nature Methods, 2021, 18:170–175. 4. Zhou C, Olukolu B, Gemenet D C, et al. Assembly of whole-chromosome pseudomolecules for polyploid plant genomes using outbred mapping populations[J]. Nature Genetics, 2020, 52:1256–1264. 5. Saada O A, Tsouris A, Eberlein C, et al. nPhase: an accurate and contiguous phasing method for polyploids[J]. Genome Biology, 2021, 22:126. 6. Zhang X, Chen S, Shi L, et al. Haplotype-resolved genome assembly provides insights into evolutionary history of the tea plant Camellia sinensis[J]. Nature Genetics, 2021, 53:1250–1259. 7. Hu G, Feng J, Xiang X, et al. Two divergent haplotypes from a highly heterozygous lychee genome suggest independent domestication events for early and late-maturing cultivars[J]. Nature Genetics, 2022, 54:73–83. 8. Li HL, Wu L, Dong Z, et al. Haplotype-resolved genome of diploid ginger (Zingiber officinale) and its unique gingerol biosynthetic pathway[J]. Horticulture Research, 2021, 8:189.
现代的生姜精油采用超临界CO2萃取法萃取生姜精油,是以CO2为溶剂,在超临界状态下把生姜中的生姜精油萃取出来,由于CO2的特性和常温、绿色的萃取工艺,使得生姜精油与传统加工方法生产的姜油制品相比有三大优势:一、姜辣素指标标准化,确保终端产品稳定。超临界萃取的生姜精油在采用气相、液相色谱处理系统,用面积归一化法测得生姜精油各组分相对含量,并确定了以特征成分6-姜辣素的含量做为产品标准,使得生姜精油产品标准化,所得到的生姜精油香气纯正自然、风味完整、品质稳定,最大限度地保留了生姜风味成分,是原汁原味的高浓缩产品。传统加工方法因受生姜品种、产地、贮存等因素影响,导致姜辣素强度不一致而无法保证终端产品的稳定一致,而采用生姜特征呈味物质姜辣素控制的生姜精油可完全达到姜的辛辣风味的一致性。二、纯天然、无菌卫生、保质期长、方便贮存。整个生产过程在接近常温、高压下进行,没有溶剂污染,在生产过程中几乎没有活菌能够生存,避免了使用传统香辛调味料灭菌困难的弊端。三、高浓度,体积小,使用方便。高浓度产品,可随意稀释、复配成油溶、水溶、油水两溶等各种产品,方便终端的使用。
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随着生活压力倍增,发际线问题也愈演愈烈,放眼望去,脱发秃头大军日益壮大,就连杨幂,郑爽等天仙都显示出中招的迹象。
发际线不断撤退显然是让人难以接受的,于是脱发大军展开了轰轰烈烈的自救,使用功效型生发防脱洗发护发产品无疑是保卫战的第一步。某宝某东平台相关产品是一搜一大把。然而说到功效成分,我们第一个想到的应该都是生姜。 生姜生发——我们从小就是这么被教育的,很多科普也是这么宣传的。
然而作为一个地地道道的生物科研工作者,我们只相信生物学实验的结果, 只参考风评较好的SCI文章。(不好意思,我真的从不看中文论文,在我们生物狗的标准里,但凡稍微拿得出手的研究结果,都会去发SCI,也不是说中文期刊的文章毫无参考价值,但是。。。。。。,自行体会吧)。
2020年3月,我偶然发现自己后脑勺斑秃两大块,素来爱美的我在悲痛之余,开始疯狂查找文献,想替自己选购科学靠谱的生发防脱用品,全力自救。然而,就在这个过程中,令我瞠目结舌的是: 生姜生发防脱它仅仅只是个传说! 纵观整个pubmed, 搜索关键词“Ginger(生姜)”,“hair loss”后,居然 只有一篇基础研究型SCI研究 ,其结论非但不能支持“生姜防脱生发”这个科研假设,相反,倒是证实能进一步抑制毛发生长!!!!不能生发反而能用于脱毛。
于是这个研究小组设计了生物学实验,运用 生姜的主要活性成分6-姜辣素 对离体毛干伸长、毛发生长以及其对人毛乳头细胞的影响展开了离体和在体研究。
结果令人大跌眼镜,大家都很忙,下面薇薇简单划个重点 :
⑴ 加了6-姜辣素培养的人毛乳头细胞比不加姜辣素的细胞生长更慢,活力更低,凋亡率更高。说明姜辣素对人毛乳头细胞(可以理解为长毛发的细胞)具有增殖抑制和凋亡促进作用。
⑵ 使用6-姜辣素处理人的毛囊7天后,测量发干生长长度。结果显示,使用20 μg/ml姜辣素的实验组,发干生长长度显著短于没有经过姜辣素处理的对照组。说明姜辣素对人发干生长不仅木有促进作用,还有一定抑制作用。
⑶ 看看活体实验吧,老鼠被剃毛后,连续20天背部涂抹姜辣素或不涂姜辣素,结果可以看出,没有涂抹姜辣素的对照组从第10天开始就显示出比姜辣素处理组更佳的毛发新生,这个优势在15天,20天都很显著。说明姜辣素处理抑制新生毛发生长。
本研究结果表明, 生姜提取物的主要活性成分6-姜辣素经过离体细胞实验和活体毛发生长实验的验证,其不但不具有促进毛发生长的作用,相反,在体外可通过对DPCs的活力抑制和促凋亡来抑制人的毛发生长,并可引起体内休止期的延长。
现实总是骨感,生姜提取物主要成分6-姜辣素不仅不是一种促毛发生长的成分,反而可以被认为是一种潜在的毛发生长抑制药物。不但不适用防脱生发,反而更适合用于脱毛。。。。。。
参考文献:
Miao Y, Sun Y, Wang W, Du B, Xiao SE, Hu Y, Hu Z: 6-Gingerol inhibits hair shaft growth incultured human hair follicles and modulates hair growth in mice . PloS one 2013, 8 (2):e57226.
一般来说一篇论文的研究的意义包括了两个方面,一个就是理论,另一个就是实践意义,所以可以从这两开两个方面展开进行论述。
1、 姜是小的辣;年轻人也可有所作为。2、 首先肯定老姜的辣,为下文论证“姜是小的辣”作铺垫;使文章立论不偏激,公允客观。3、承上启下(或过渡);若只信“姜是老的辣”就会扼杀年轻人的奋斗精神,从而引出下文的论述。4、“我不相信,老姜就一定辣过小姜”“我不相信,此时不辣,将来定有属于我辣的时代”“我不相信,年岁到了就一定能变成辣姜”三个方面。5、“老姜”的“辣”产生于人生阅历和岁月磨练;“小姜”的“辣”产生于年轻人一往无前的锐气;我更赞同“姜是老的辣”,因为经验和能力来源于岁月的磨炼。(或更赞同“姜是小的辣”,因为一往无前的锐气,常常可以使年轻人战胜困难,取得成功)。 (以上主观题意对即可)
生姜(Zingiber officinale)是一种极具价值的食药两用园艺作物, 既为传统中药的重要成分,又是重要的调味料 ,在我国有悠久的栽培历史。中国生姜栽培面积、产量和出口量均居全球第一位。长江中上游生姜总面积226万亩,占全国,是推动乡村振兴的优选产业。姜具有多年生宿根,根茎肉质、肥厚,内含多种营养成分,它除了含有蛋白质、碳水化合物、多种维生素和矿物质外,还含有姜辣素、姜油、姜醇等生物活性物质,具有调味、抗癌、抗真菌、抗炎症、抗氧化和抗血小板聚集等用途,是香料家族和药用植物家族的重要成员。姜辣素是生姜特有的呈味物质,也是生姜多种功能活性的主要功能因子,在调味品、化妆品和医疗保健等领域具有广阔的应用前景。尽管姜在世界范围内有显著的经济价值,但由于其有性繁殖困难,基因组庞大、杂合度高,相关的分子生物学和遗传选育工作一直停滞不前。此外,长久以来生姜基因组信息的缺乏,限制了我们对 合成调控机理的理解,导致生姜分子育种发展缓慢。
近日,Horticulture Research背靠背在线发表了两个不同品种生姜基因组数据,分别是平顶山学院植物遗传育种研究组与北京林业大学等单位合作的题为 《Haplotype-resolved genome assembly and allelespecific gene expression of cultivated ginger》 的研究论文,以及重庆文理学院与西南大学等单位合作的题为 《Haplotype-resolved genome of diploid ginger (Zingiberofficinale) and its unique gingerol biosynthetic pathway》 的研究论文。
☆☆☆ 平顶山学院植物遗传育种研究组等单位的研究解析了我国重要的传统生姜品种单倍型基因组序列,揭示了单倍型基因组间差异,推断了姜高度不育的基因组基础,初步澄清了姜酚(姜辣素)生物合成通路,为后续的功能研究和分子设计育种奠定了重要基础。
该研究以全国首个国家农产品地理标志登记保护的生姜品种 张良姜 为研究对象。据记载,自汉代起“张良姜”已有2000多年的种植历史,现保存在河南省平顶山市鲁山县张良镇。此品种有“姜中之王”美称,具有色泽深黄、辛辣芳香、气浓味长、质实丝多、百煮不烂、久贮不腐等优良特性。
该研究利用先进的长读长测序技术, 解析了“张良姜”单倍型基因组序列;检测了两个单倍型基因组间的遗传差异,以此推断出与姜高度配子败育率相关的结构变异区;揭示出两套基因组间等位基因表达差异可能与基因顺式调控区、编码区序列差异、转座子的临近效应以及选择压有关;利用基因共表达网络分析,初步解析了姜酚(姜辣素)生物合成相关的基因调控机制。
☆☆☆ 重庆文理学院等单位的研究破解了西南地区主栽品种 竹根姜 的基因组,利用短读长( Gb),长读长PacBio( Gb)及Hi-C( Gb)策略组装出竹根姜 两套单倍型高质量基因组 ,单倍型的基因组大小分别为 Gb (contig N50: M)和 Gb (contig N50: M),的序列锚定到22条染色体(图1)。PacBio 读长在2个单倍型的overlap分别为 和,显示了分型的准确性。 两套单倍型的Ka/Ks分析揭示生姜驯化历史过程中经历了相似的选择压力。通过等位基因分析,总共55,635个基因(占所有基因的72%)在两个单倍型中具有同源性。生姜17,226对等位基因中,在转录水平表现出染色体偏好性(图2)。该研究发现生姜基因组杂合度,是目前已报道杂合度最高的植物基因组。重复序列高,其中长末端片段重复(long terminal repeats,LTRs)占,可能是导致其基因组大、杂合度高的主要原因,同时也是生姜基因组进化的主要驱动力。生姜等位基因在两套单倍型中没有展现出表达差异,17,226对等位基因中有2055对()在转录水平表现出染色体偏好性。
通过整合基因组、转录组和代谢组数据进行整合分析,该研究构建了生姜特有成分姜辣素的合成通路,筛选出12个参与姜辣素合成的关键酶家族(PAL, C4H, 4CL, CST, C3′H, C3OMT, CCOMT, CSE, PKS,AOR, DHN, 和DHT),鉴定出38个可能调控姜辣素合成的重要转录因子家族,并绘制出姜辣素合成的分子调控网络(图3)。
作者简介
Haplotype-resolved genome assembly and allelespecific gene expression of cultivated ginger
平顶山学院程世平副教授、北京林业大学博士生贾凯华(现山东省农业科学院工作)、博士生刘辉和张仁纲博士(源宜(山东)基因科技股份有限公司)为共同第一作者。通讯作者是北京林业大学毛建丰副教授和比利时根特大学教授、比利时皇家科学院院士Yves Van de Peer。平顶山市农业科学院马爱锄博士、于从文研究员也参与了该项研究。该工作还包含来自瑞典于默奥大学、加拿大拉瓦尔大学、不列颠哥伦比亚大学、根特大学、比勒陀利亚大学和南京农业大学等单位的合作者。该研究得到河南省科技攻关以及平顶山学院高层次人才启动基金等项目的资助。
Haplotype-resolvedgenome of diploid ginger (ingeiber officinale) and its unique gingerolbiosynthetic pathway
该工作由重庆文理学院牵头,联合长江大学、西南大学和华大基因共同完成。李洪雷教授、吴林副教授、董照明副教授、姜玉松教授和姜三杰博士为论文的共同第一作者,刘奕清教授、夏庆友教授、简建波博士和邹勇副教授为论文的共同通讯作者。济南市第二农科院李承勇研究员、李庆芝高级工程师等参与了该研究。该研究得到了重庆文理学院生姜基因组重大专项、重庆市自然科学基金等项目的支持。
文章链接: Haplotype-resolved genome assembly and allelespecific gene expression of cultivated ginger
Haplotype-resolved genome of diploid ginger (Zingiberofficinale) and its unique gingerol biosynthetic pathway
题目太大了,就拿姜黄素而言,在过去十年,姜黄素获得了巨大人气!在PubMed中以“curcumin”为搜索字符串大约可以检索到8400条记录。其中收录姜黄素有关“Anticarcinogenic Agents(抗致癌药物)”近240篇;“Chemoprevention(化学预防)”近190篇。根据 Library of Medicine统计显示,姜黄进入到临床研究的项目有182项,姜黄素进入到临床研究的项目有217项。作为“第三代癌症化学预防药物”,姜黄素可以用于多种癌症的化学预防和治疗,例如:头颈部癌、肺癌、结肠直肠癌、乳腺癌、泌尿生殖道癌、黑色素瘤、神经癌和肉瘤。但姜黄素如何作用于癌细胞的机理一直是科学界研究的问题。最近,Pan教授实验室(伊利诺伊大学厄本那-香槟分校的生物工程学院,负责医学材料实验室)与美国化学学会期刊主编Peter Stang博士合作,开发出了可溶解姜黄素的方法,利用这种方法将其送达肿瘤,可以杀死癌细胞,他们的研究发表在《PNAS》。美国亚利桑那大学医学院教授苏尼尔·派博士日前在洛杉矶举办的美国癌症控制协会第42届年会上说,最新研究显示,姜黄素可调控干预的抗癌靶点已达86个,其中有美国食品和药物管理局已批准可让药物发生作用的23个靶点,以及尚未被批准的63个靶点。利用姜黄素可能实现天然靶向抗癌药物的突破,大大降低靶向药物治疗费用。目前将姜黄素应用于癌症化学预防药物研究的产品艾易克也在联合北京大学、中科院等高校再进行姜黄素产品的深层次开发,有望成为国内姜黄素癌症化学预防前沿药物。
姜黄素保健是什么原理他有一定他的一定的功率你可以去看一下
姜黄Turmeric 姜黄从唐朝便作为重要的活血化瘀药物,以后历代本草均有记载,在李时珍所著的《本草纲目》中还有一个奇特的名字──宝鼎香。 宝鼎香,属于姜科,多年生草本植物,根茎发达,块茎粗壮,香气独特,味道辛辣,微苦。姜黄原产于印度和印度尼西亚,因其鲜艳的颜色,可作为食用染色剂,我们熟悉的印度咖喱中黄色的来源就是姜黄。姜黄同时作为香料、染色剂和药物使用有悠久的历史,姜黄在印度阿育吠陀疗法和中医等亚洲传统医学中运用由来已久,在印度被称为“印度藏红花”,主要用于止痛,调节血压,促进血液循环,促消化,消除炎症等问题,中医学认为也认为姜黄性辛、苦、温,归肝脾经,主要功效是破气行血、通经止痛。各国科学家们在他们论文的引言部分,很多人都会提到姜黄素和中药(Chinese medicine)的关系,提到中国人从古代就开始使用中药姜黄来治疗各种疾病的例子。 这些论文涵盖了姜黄素在很多方面的药理作用:如抗氧化,抗炎,防癌抗癌,神经保护如抗老年痴呆症和抗儿童自闭症,修复和保护肝功能,抗病毒如抗艾滋病,抗心血管疾病,抗自身免疫疾病,等等。在《救命:逆转和预防致命疾病的科学饮食》这本书中,作者迈克尔·格雷格博士 列了一份每日食物清单,其中姜黄粉是他着重建议纳入每日饮食中的一种食物。在他的健康香料和香草清单中,第一名就是姜黄粉。 美国科学家的新近研究显示,由咖喱原料高度提纯而成的姜黄素,可调节炎症因子,肿瘤转移因子,生长因子,蛋白激酶,癌蛋白等数十个靶点,逆转肿瘤进程。 姜黄素是全球天然抗肿瘤药物研究的热点。 印度瑜伽士萨古鲁也反复强调姜黄的妙用:姜黄根粉末不仅在身体层面发挥作用,也会对能量系统产生重大影响。它能净化血液、身体和能量系统。每天食用姜黄,能保持血液纯净,血液成分保持平衡。它能够净化血液,让能量变得清澈。 更多关于姜黄的信息可以查阅: (整理自网络)
姜黄素可以起到抗菌消炎、调节肠胃、抑制癌细胞的功效。姜黄素素还具有护肝、促进肠胃消化、抑制血管新生的作用。举措建议平时可以吃姜黄炒饭,将锅烧热后放入葱花爆香后,再加入适量的姜黄粉翻炒,翻炒均匀后倒入蒸好的米饭,再加入适量的食盐炒匀,患者就可以直接食用了。注意事项姜黄素最好在医生的指导下服用,用法和用量一定要遵医嘱,不要擅自的加大姜黄素的用量,以免对身体健康造成影响
姜黄Turmeric 姜黄从唐朝便作为重要的活血化瘀药物,以后历代本草均有记载,在李时珍所著的《本草纲目》中还有一个奇特的名字──宝鼎香。 宝鼎香,属于姜科,多年生草本植物,根茎发达,块茎粗壮,香气独特,味道辛辣,微苦。姜黄原产于印度和印度尼西亚,因其鲜艳的颜色,可作为食用染色剂,我们熟悉的印度咖喱中黄色的来源就是姜黄。姜黄同时作为香料、染色剂和药物使用有悠久的历史,姜黄在印度阿育吠陀疗法和中医等亚洲传统医学中运用由来已久,在印度被称为“印度藏红花”,主要用于止痛,调节血压,促进血液循环,促消化,消除炎症等问题,中医学认为也认为姜黄性辛、苦、温,归肝脾经,主要功效是破气行血、通经止痛。各国科学家们在他们论文的引言部分,很多人都会提到姜黄素和中药(Chinese medicine)的关系,提到中国人从古代就开始使用中药姜黄来治疗各种疾病的例子。 这些论文涵盖了姜黄素在很多方面的药理作用:如抗氧化,抗炎,防癌抗癌,神经保护如抗老年痴呆症和抗儿童自闭症,修复和保护肝功能,抗病毒如抗艾滋病,抗心血管疾病,抗自身免疫疾病,等等。在《救命:逆转和预防致命疾病的科学饮食》这本书中,作者迈克尔·格雷格博士 列了一份每日食物清单,其中姜黄粉是他着重建议纳入每日饮食中的一种食物。在他的健康香料和香草清单中,第一名就是姜黄粉。 美国科学家的新近研究显示,由咖喱原料高度提纯而成的姜黄素,可调节炎症因子,肿瘤转移因子,生长因子,蛋白激酶,癌蛋白等数十个靶点,逆转肿瘤进程。 姜黄素是全球天然抗肿瘤药物研究的热点。 印度瑜伽士萨古鲁也反复强调姜黄的妙用:姜黄根粉末不仅在身体层面发挥作用,也会对能量系统产生重大影响。它能净化血液、身体和能量系统。每天食用姜黄,能保持血液纯净,血液成分保持平衡。它能够净化血液,让能量变得清澈。 更多关于姜黄的信息可以查阅: (整理自网络)
性状鉴别:姜黄根茎呈不规则卵圆形、圆柱形或纺锤形,常弯曲,表面深黄色,粗糙,有皱缩纹理和明显环节,并有圆形分枝痕及须根痕。质坚实,不易折断,断面棕黄色至金黄色,角质样,有蜡样光泽。内皮层环纹明显,维管束呈点状散在。气香特异味苦、辛。以质坚实、断面金黄、香气浓厚者为佳。显微鉴别:根茎横切面:外方4~10余列木栓化细胞,常发生在皮层部会,其外有时可见表皮及皮层细胞。皮层宽广,有叶迹维管束;内皮层明显。中柱鞘为1-2列细胞;维管束有限外韧形,近中柱鞘处较多,向内渐少。本品薄壁细胞含淀粉粒及棕色色素;薄壁组织中散有油细胞。 根茎含姜黄素类化合物:姜黄素(curcumin),对,对-二羟基二桂皮酰甲烷(p,p-dihydroxydicinnamoyl methane),即双去甲氧基姜黄素(bisdemethoxycurcumin),对-羟基桂皮酰阿魏酰基甲烷(p-hydroxycinnamoylferuloylmethane),即去甲氧基姜黄素(demethoxycurcumin),二氢姜黄素(dihydrocurcumin);倍半萜类化合物:姜黄新酮(curlone),姜黄酮醇(turmeronol)A、B,大牻牛儿酮-13醛(germacrone-13-al),4-羟基甜没药-2,10-二烯-9-酮(4-hydroxybisabola-2,10-diene-9-one),4-甲氧基-5-羟基甜没药-2,10-二烯-9-酮(4-methoxy-5-hydroxybisabola-2,10-diene-9-one),2,5-二羟基-甜没药-3,10-二烯(2,5-dihydroxybisabola-3,10-diene),原莪术二醇(procurcumadiol),莪述双环烯酮(curcumenone),去氢莪述二酮(drhydrocurdione),(4S,5S)-大牻牛儿酮-4,5-环氧化物[(4S,5S)-germacron-4,5-epoxide],α-姜黄酮(α-turmerone),甜没药姜黄醇(bisacurone),莪述烯醇(curcumenol),异原莪述烯醇(isoprocurcumenol),莪述奥酮二醇(zedoaronediol),原莪述烯醇(procurcumenol),表原莪述烯醇(eiprocurcumenol),4,5-二羟基-甜没药-2,10-二烯(4,5-dihydroxybisabola-2,10-diene);酸性多糖:姜黄多糖(utonan)A、B、C、D。挥发油(),其主要成分有姜黄酮,芳香-姜黄酮(arturmerone),姜黄烯(curcumene),大牻牛儿酮(germacrone),芳-香姜黄烯(ar-curcumene),桉叶素(cineole),松油烯(terpinene),莪术醇(curcumol),莪述呋喃烯酮(curzerenone),莪述二酮(curdione),α-蒎烯(α-pinene),β-蒎烯(β-pinene),柠檬烯(limonene),芳樟醇(linalool),丁香烯(caryophyllene),龙脑(borneol)等。还含菜油甾醇(campesterol),豆甾醇(stigmasterol),β-谷甾醇(β-sitosterol),胆甾醇(cholesterol),脂肪酸及金属元素钾、钠、镁、钙、锰、铁、铜、锌等,锌/铜=。 ⑴降血脂作用:姜黄醇或醚提取物、姜黄素和挥发油灌胃,对实验性高脂血症大鼠和家兔都有明显的降血浆总胆固醇和B-脂蛋白的作用,并能降低肝胆固醇,纠正a-和B-脂蛋白比例失调,但对内源性胆固醇无影响;对降血浆甘油三酯的作用更为显着,能使血浆中甘油三酯降低至正常水平以下。高蔗糖饮食能引起大鼠产生高脂血症,姜黄素能对抗此高脂血症产生。灌胃姜黄素能降低肝重,减少肝中甘油三酯、游离脂肪酸、磷脂含量及血清总甘油三酯、VLDL+LDL甘油三酯,HDL甘油三酯、VLDL+LDL胆固醇和血中游离脂肪酸的含量,也能提高血清总胆固醇和HDL胆固醇含量。用肝匀浆体外保温法,以14C-醋酸为底物试验,初步结果表明,姜黄素能抑制脂肪酸的合成。⑵抗肿瘤作用:用鼠Dalton氏淋巴腹水瘤细胞进行组织培养及在体实验,姜黄醇提物能抑制癌细胞生长。在时能抑制中国仓鼠卵巢细胞生长,并对淋巴细胞和Dalton氏淋巴细胞具有细胞毒性作用,并能减少动物肿瘤的生长,其活性成分主要是姜黄素。在巴豆油促进下,7,12-二甲基苯蒽能诱发小鼠产生乳头癌,姜黄素可明显减少在此情况下乳头癌产生的机会,也能抑制由2O-甲基氯蒽诱导的肿瘤形成。姜黄素还能减少突变原致癌的可能性。姜黄素还能抑制TPA(12-O-Tetradecanoylphorbol-13-acetate)的诱癌作用。当局部应用10μmol/L姜黄素时,对由5nmol/L TPA 诱发的鸟苷酸脱羧酶活性的抑制率达91%;10μmol/L的姜黄素与2nmol/L的TPA-起局部应用,对TPA激发的3H-胸腺嘧啶嵌合入表皮DNA中的抑制率为49%,其抑制率与浓度有关。因此,姜黄素可能作为一种抗癌剂。⑶抗炎作用:姜黄素能对抗角义菜胶诱发的大鼠脚趾肿胀,在30mg/kg范围内有剂量依赖性,而剂量在60mg/kg 时,则抑制这种抗炎作用。姜黄素钠可逆地抑制尼古丁、乙酰胆碱、5-羟色胺、氯化钡及组胺诱发的离体豚鼠回肠收缩,类似于非固醇类抗炎药。⑷抗病原微生物作用:体外试验,姜黄素百分之一浓度时,对细球菌(Micrococuspyogenesvar. Aureus)有抑制作用。挥发油有强力抗真菌作用。姜黄能延长接种病毒小鼠的生存时间。⑸对心血管系统的影响:姜黄素静脉注射对血压无明显影响,对肾上腺素、组胺和乙酰胆碱引起的血压亦无明显影响。用姜黄素灌胃能对抗垂体后叶素静脉注射引起的大鼠心电图S-T、T波变化,灌胃还能增加小鼠心肌营养性血流量。姜黄素对血小板聚集及血液粘度有明显影响,正常人体外实验姜黄素浓度为1×10(-4)mol/L,显着抑制血小板聚集,抑制率为(P<)。大鼠灌胃 5天后(剂量分别为20、40、60、80mg/(kg.天)与对照组相比,血小板聚集作用减弱,血浆粘度和全血粘度降低。其中以40mg/(kg.天)组抑制血小板聚集作用最强,抑制率为(P<)。继续增加给药量,抑制作用未见进行性增强。在低切变率(秒-1)条件下,降低全血和血浆粘度作用显著,而高切变率(150秒~1)时,无显著性差异。⑹利胆作用:姜黄提取物、姜黄素、挥发油、姜黄酮以及姜烯、龙脑和倍半萜醇等,都有利胆作用,能增加胆汁的生成和分泌,并能促进胆囊收缩,而以姜黄素的作用为最强。⑺对终止妊娠的作用:姜黄制成100%(生药1g/ml)和200%水煎剂。小鼠在妊娠早期(6~7天)、中期(10~14天)和晚期(16~18天)分别腹腔注射或皮下注射姜黄水煎剂10g/kg,每日1次,连续2天。早、中期妊娠小鼠在给药1次后,次日清晨可见阴道出血,解剖可见子宫内有坏死、变性胚胎,晚期妊娠小鼠在给药1次后,大部分在24小时内娩出小鼠。表明腹腔注射或皮下注射给药对小鼠各期妊娠都有明显作用(口服50g/kg无效),终止妊娠率为90~100%,而对照组胚胎发育正常。家兔于妊娠早期(8~10天)、中期(13~15天)和晚期(23~25天)腹腔注射或皮下注射姜黄水煎剂8g/kg,每日1次,连续2-3天,8只早期妊娠家兔和4只中期妊娠家兔全部终止妊娠,4只晚期妊娠家兔亦全部流产。对照组6只家兔全部正常妊娠。以未成熟小鼠子宫增重法,测定姜黄的雌激素与抗雌激素活性,表明姜黄水煎剂10g/kg 腹腔注射 或 皮下注射无雌激素活性和抗雌激素活性。姜黄10g/kg所致的终止动物早期妊娠作用可被黄体酮(1mg/鼠)拮抗,姜黄10g/kg还可明显抑制假孕小鼠创伤性子宫蜕膜瘤的生长,因此推测姜黄引起动物早期流产作用的机理,可能是由于它具有抗孕激素活性和宫缩作用。姜黄粉依次用石油醚、95%乙醇和水提取物,于妊娠第l-7天连续灌胃,三种提取物的剂量为100mg/kg时,对雌性大鼠的终止妊娠率分别为100,70和100%。出生的幼鼠无畸形。上述3种提取物对硫酸铜诱发的兔排卵均无影响。⑻抗氧化作用:以NIH小鼠脑、心、肝、肾、脾等器官制成一定浓度匀浆液,以不饱和脂肪酸被氧化成过氧化脂质时,过氧化脂质很快又转变成丙二醛,在加热条件下丙二醛与硫代巴比妥酸反应生成红色化合物的原理进行检测,结果姜黄素对五大脏器的脂质过氧化作用都有明显对抗作 用。各脏器匀浆浓度分别为,脑,心,肝(1),肝(2),肾,脾;姜黄素剂量(mg/100ml)分别为,脑~,心,肝(1),肝(2),肾,脾,与空白对照比较,除脾中剂量、低剂量>,脑高剂量 P<外,其余均为P<。亦有报道,姜黄素 和4-Hydroxycinnamoyl(geruloyl)methane,bis(4-Hydroxycinnamoyl)methane均有抗氧作用,以姜黄素最好,对亚油酸的空气氧化的50%抑制浓度为×10(-2)%(硫巴比妥值)和×10(-2)%(过氧化物值),均高于维生素E。⑼光效应作用:姜黄素在通常情况下杀菌能力较弱,但当给于光照射时,微克量的姜黄素就显示出很强的光毒性反应。革兰氏阴性菌对于姜黄素光毒性的抵抗力比革兰氏阳性强。姜黄素的这种光毒性只有在有氧情况下才能产生。因此姜黄素可能作为一种光敏化药物应用于牛皮癣、癌症、细菌和病毒性疾病的光疗。姜黄素还能对易光解的药物起稳定的作用。如对硝苯吡啶的光稳定作用特别强,使它半衰期延长6倍,可增强其疗效。⑽其它作用:姜黄素可抑制PGS的生物合成。姜黄还可杀蝇。姜黄的氯仿和乙醚提取物体外对发癣菌和石膏样小孢子菌有抑制作用。Turmeronol A和B可抑制大豆脂氧合酶,其IC50分别为16和19μmol/L。这二种化合物在-200ppm浓度时可防止亚油酸的自动氧化。 小鼠可只灌胃姜黄醇浸液40~100g(中药),观察3天,未发生死亡。以姜黄浸膏5、2和(相当于临床用量的50、20和5倍)拌入饲料中喂大鼠,共30天,体重、食量和活动未见异常。取心、肝、肾、主动脉、肾上腺作病理组织学检查,均未见明显病理改变,姜黄素小鼠灌胃的半数致死量大于2g/kg。
姜黄总素的提取量为。姜黄素类化合物因其良好的生物活性成为近年来研究的热点之一,目前姜黄素类化合物主要来源于药材姜黄。本论文以姜黄素类化合物为研究对象,建立了姜黄提取物的定性定量检测方法,优化了姜黄的提取工艺,研究了大孔树脂纯化姜黄提取物的工艺,为姜黄素类有效部位开发奠定了基础。建立了双去甲氧基姜黄素(BDMC)、去甲氧基姜黄素(DMC)和姜黄素(CUR)的HPLC定量测定方法。使用WatersAtlanticT3(×250mm,5μm)色谱柱,以乙腈-4%冰醋酸水溶液(47:53)为流动相,流速1mL/min,检测波长425nm,柱温30℃。采用HPLC-MS/MS法对提取物进行结构分析,定性了19种姜黄素类化合物,其中发现3种姜黄素的同分异构体,据推测其结构可能分别为链状、环状和烯醇式。通过单因素试验、CCD设计响应曲面法和支持向量回归法优化了湿粉微波提取姜黄的工艺。最优工艺是乙醇体积分数69%,液料比(mL:g),微波时间55s。姜黄总素的提取量为(生药材,下同),三种姜黄素的总提取量为。与超声和回流的最优工艺进行比较,三种姜黄素含量差距不大,且均含有定性出的19姜黄素类化合物。从8种不同类型的树脂中筛选出NKA-9树脂用于姜黄提取液的纯化。通过对吸附和洗脱液中的乙醇浓度和流速的考察,确定了用5BV60%的乙醇溶液以2BV/h流速上样,用1BV40%乙醇,1BV60%乙醇,1BV80%乙醇,5BV无水乙醇以流速4BV/h梯度洗脱的工艺。该工艺将三种姜黄素的纯度从升至,回收率为73%。工艺稳定,且经定性分析保留了姜黄素类化合物。对NKA-9树脂的吸附等温曲线、静态吸附动力学和动态传质过程进行研究。发现NKA-9树脂的吸附符合Langmuir方程。吸附动力学分两段,前段由颗粒内扩散步骤控制,后段吸附规律符合准二阶方程。
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药学学子的课程主要以研究药剂学、药理学、药物化学、药物合成等方面的知识和技能为主。药学毕业论文分类:
一、药学专业毕业论文分综述类、调研类和实验类。
二、药学专科毕业论文可以写综述类或者实习报告。
三、药学本科毕业论文要求有数据分析,只能写调研类和实验类,且大部分学校会要求写实验类。调研类毕业论文,可通过调查问卷收集数据进行分析,也可对已有的数据进行回顾性分析(例如医院某一段时间处方用药的分析)。
四、实验类毕业论文,分药剂、药分、药化、药理等实验,选题也各不相同。一般制备工艺和质量研究类较容易。