专著：1 《现代政治地理学》（南开大学出版社1993年）；2《边缘地带发展论：世界体系与东南亚的发展》（上海人民出版社1997年）；3《世界体系论与中国》（商务印书馆2000年）；4《国际政治经济学：理论范式与现实经验研究》（与张岩贵教授合著）（商务印书馆2003年；2004年）；5《建构安全共同体：东盟与地区秩序》（与冯怀信合译）（上海人民出版社2004年）；6《世界体系与国家兴衰》（北京大学出版社2006年）7《亚洲区域合作的政治经济分析：制度建设、安全合作与经济增长》（与[美]Miles Kahler、[日]高木诚一郎共同主编） （上海人民出版社2007年）。8《国际政治经济学通论》北京大学出版社，2010年9月论文：“汇率制度选择的政治经济分析：三种研究路径比较及其启示”（2006）“超越“吉尔平式”的国际政治经济学：1990年代以来IPE及其在中国的发展”（2006）“王正毅——探求中国与“世界体系”关联性的学者”（2005）“理解中国转型：国家战略目标、制度调整与国际力量”（2005）“世界知识权力结构与中国社会科学知识谱系的建构”（2005）；“国际政治经济学的‘研究路径’：政治学的、经济学的、政治经济学的还是其他？”（2004）；“争论中的国际政治经济学”（2004）；“社会科学知识谱系与国际关系研究方法”（2004）；“理解国际体系中的权力与财富”（2003）；“亚洲区域化：从理性主义走向社会建构主义？”（2003）；“国际关系理论建构的三个难题”（2003）；“国际政治经济学：历史、理论与方法”（2002）；“21世纪中国的地缘发展战略”（1999）；“能否走出以欧美为中心的国际关系理论？”（1999）；“国家利益是合法性相互制约的利益”（1997）；“东亚国际体系何以成为可能？”（1997）；“世界经济、历史体系与文明：评沃勒斯坦的‘世界体系论’”（1996）。
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