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自2019年12月首次在武汉发现由新型冠状病毒引发的肺炎以来,众多研究揭示该病毒与其他冠状病毒基因组的异同。研究表明该病毒与SARS和蝙蝠冠状病毒的序列相似性远高于其他冠状病毒,但三维空间构象抗原性的差异尚未被揭示。
2020年1月30日,复旦大学生物医学研究院&上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心 徐建青 教授团队与同济大学 曹志伟 教授团队联合在 Journal of Genetics and Genomics 杂志上发表了文章 Identification of potential cross-protective epitope between 2019-nCoV and SARS virus ,对武汉新型冠状病毒2019-nCoV与SARS的交叉表位进行了分析。
在本研究中,研究团队对于新型冠状病毒S蛋白进行了系统性的三维空间构象模拟和抗原性分析。据报道,S蛋白是冠状病毒与宿主细胞表面ACE2受体结合、进而介导病毒进入宿主细胞的关键表面蛋白,是疫苗研发的重要靶点。基于团队前期开发的空间表位预测工具CE-BLAST,研究人员扫描了新型冠状病毒S蛋白与其他已知冠状病毒抗原性的相似性。研究发现, 相较于其他冠状病毒,新型冠状病毒S蛋白在三维空间构象抗原性上与SARS及蝙蝠冠状病毒近似,与SARS抗原性更为接近。
进一步的结构研究揭示出2019-nCoV与SARS在受体接合区域(RBD)上存在潜在交叉反应表位,且该区域与RBD上重要的人ACE2受体结合位点相毗邻。因此,识别该区域的抗体将能够有效的阻止新型冠状病毒通过RBD与人ACE2蛋白进行结合。 该研究表明,之前针对SARS的S蛋白ACE2结合位点的抗体将有应用于2019-nCoV的临床干预的价值。
据悉,复旦大学 徐建青 教授与同济大学生命科学与技术学院 曹志伟 教授是本文的共同通讯作者,上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心 裘天颐 博士和同济大学博士生 毛甜甜 为本文的共同第一作者。
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