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如果自己研究的领域已经发表了文章， 又是同一种疾病！ 如何设计实验才能让自己的文章“脱颖而出”呢？ 接下来，我就以2022年2月3日在皮肤病领域排名第一的杂志  Journal of Investigative Dermatology  上发表的一篇利用 10x 单细胞关联 10x Visium 空间转录组测序的文章开始总结一下最近关于瘢痕疙瘩的单细胞及空间的3篇研究报道吧！ 瘢痕疙瘩，俗称疤痕疙瘩，是皮肤伤口愈合或不明原因所致皮肤损伤愈合后所形成的过度生长的异常瘢痕组织，是一种良性皮肤纤维化疾病，但具有与恶性肿瘤相似的特征。瘢痕疙瘩缺乏药物治疗，治疗仍然是一个挑战，因此研究其致病机制对该疾病的精准治疗具有非常重要的意义。 单细胞测序技术的最新进展增强了我们对瘢痕疙瘩和其他纤维化疾病的理解，空间转录组技术的迅速发展对于我们获取细胞的空间位置并理解细胞相互作用和通信至关重要。 1、 单细胞结合空间转录组学揭示瘢痕疙瘩发病潜在机制 Integrated analysis of single-cell and spatial transcriptomics in keloids: Highlights on fibro-vascular interactions in keloid pathogenesis 【发表期刊】 J Invest Dermatol. 【影响因子】 8.551 【发表时间】 2022年2月 【发表单位】 韩国成均馆大学 【实验技术】 10x 单细胞转录组测序，Visium 空间转录组测序，mIF 等 【实验设计】 2例瘢痕疙瘩皮肤组织 vs 5例健康皮肤组织（单细胞转录组）；1例瘢痕疙瘩皮肤组织 vs 配对成熟疤痕组织（单细胞转录组）；2例瘢痕疙瘩皮肤组织 vs 2例健康皮肤组织（空间转录组）； 研究背景 瘢痕疙瘩是一种由异常伤口愈合引起的纤维增生性皮肤疾病，导致血管过多和细胞外基质（ECM）成分的过度沉积。该疾病复发率高，临床治疗结果欠佳且难以管理。迄今为止，瘢痕疙瘩的发病机制已被广泛报道。然而，其纤维化失调的潜在机制仍然很大程度上未知。 研究思路 研究结论 1、研究对2例瘢痕疙瘩病人的皮肤组织及5例健康皮肤组织的单细胞转录组测序结果进行整合，降维分群及亚群定义； 2、研究重点对成纤维细胞（FB）进行 recluster，对 subcluster 进行 Monocle3 拟时间分析，对瘢痕疙瘩特异来源的成纤维细胞（FB1 和 FB2）及正常皮肤来源的成纤维细胞（FB4）进行差异基因分析，并进行 GO 及 GSEA 分析； 3、研究使用2种细胞通讯方法—CellphoneDB 及 NicheNet 分析 FB 与 EC 细胞通讯，发现瘢痕组织中 FB 与 EC 的通讯显著密集； 4、研究选择瘢痕疙瘩（n=2，其中一例与单细胞为同一来源）及正常皮肤（n=2）进行空间转录组测序分析，分析了 FB1 和 FB2 在空间中的分布，强调了纤维血管在瘢痕形成中的重要角色； 5、研究对内皮细胞（EC）进行 recluster，对瘢痕疙瘩特异来源的内皮细胞（EC3）及正常皮肤来源的内皮细胞进行差异基因分析，发现 EC3 具有间质激活特性；并结合 mIF 实验及 ST 实验结果进行验证； 6、研究选择一例患者同时获取其瘢痕疙瘩组织及成熟伤疤组织，进行单细胞转录测序，进一步验证了前期基于瘢痕组织 vs 正常组织差异分析得到的结论，即： 纤维细胞（FB） –血管通讯和内皮细胞（EC）的间充质激活在瘢痕疙瘩发病中具有重要的潜在作用。 2、 单细胞转录组测序揭示瘢痕疙瘩中成纤维细胞和血管内皮细胞的谱系特异性调节变化 Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Lineage-Specific Regulatory Changes of Fibroblasts and Vascular Endothelial Cells in Keloids. 【发表期刊】 J Invest Dermatol. 【影响因子】 8.551 【发表时间】 2022年1月 【发表单位】 北京协和医院整形外科 【实验技术】 10x 单细胞转录组测序 【实验设计】 4例瘢痕疙瘩病人的皮肤组织 vs 4例配对的健康皮肤组织 研究背景 尽管瘢痕疙瘩被归类为良性真皮生长，但它们表现出与恶性肿瘤相似的生物学特征，例如过度增殖、细胞凋亡抗性和侵袭。瘢痕疙瘩给患者带来严重的生理和心理负担。尽管目前正在使用多种疗法，但就高复发率和缺乏药物疗法而言，瘢痕疙瘩仍然是治疗挑战。这部分是由于对瘢痕疙瘩发病机制的不完全了解，因此彻底了解瘢痕疙瘩发病机制的细胞和分子机制将有助于开发针对该疾病的药物疗法。 研究思路 研究结论 3 、单细胞转录组揭示人类纤维化皮肤病的发病机制 Single-cell RNA-seq reveals fibroblast heterogeneity and increased mesenchymal fibroblasts in human fibrotic skin diseases. 【发表期刊】 Nature Communications 【影响因子】 14.919 【发表时间】 2021年6月 【发表单位】 南方医科大学；中山大学 【实验技术】 10x 单细胞转录组测序 【实验设计】 3例瘢痕疙瘩病人疤痕组织 vs 3例正常疤痕组织 研究思路 我点评 这三篇都是研究研究瘢痕疙瘩的单细胞相关文章，相同之处是文章使用的都是皮肤组织，case 组都选择使用瘢痕疙瘩处的皮肤组织，但 control 组的选择却有不同：有使用同一批病人配对的正常皮肤组织（第二篇）或配对的成熟伤疤皮肤组织（第一篇），有使用其他健康皮肤组织（第一篇），也有选择其他人成熟（正常）伤疤皮肤组织的（第三篇）。实验技术也不同，第2篇和3篇只使用了单细胞转录组测序，第一篇却同时还选择了更新的空间转录组测序技术。 除了以上不同点，还有几处是很相似的，比如（1）文章都重点关注成纤维细胞（FB）及（血管）内皮细胞(EC)，并进行了 recluster；（2）对 FB 及 EC 的 subcluster 都进行分子特征描述，差异基因分析，GO/GSEA 富集分析，Monocle2/3 拟时间分析，细胞通讯分析；（3）都有使用其他技术对单细胞所得结果进行了验证，使用 mIF 或 IF。 所以，不要太担心自己研究的领域已经发表了文章，即使是同一种疾病，只要实验设计别出“一点”心裁，照样可以持续发表高质量的文章！ 参考文献 1. Shim J, Oh SJ, Yeo E, Park JH, Bae JH, Kim SH, Lee D, Lee JH. Integrated analysis of single-cell and spatial transcriptomics in keloids: Highlights on fibro-vascular interactions in keloid pathogenesis.  J Invest Dermatol . 2022 Feb3: S0022-202X(22)00085-9. doi: 10.1016/j.jid.2022.01.017. Epub ahead of print. PMID: 35123990. 2. Liu X, Chen W, Zeng Q, Ma B, Li Z, Meng T, Chen J, Yu N, Zhou Z, Long X. Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Lineage-Specific Regulatory Changes of Fibroblasts and Vascular Endothelial Cells in Keloids.  J Invest Dermatol . 2022 Jan;142(1): 124-135.e11. doi: 10.1016/j.jid.2021.06.010. Epub 2021 Jul 7. PMID: 34242659. 3. Deng, CC., Hu, YF., Zhu, DH. et al. Single-cell RNA-seq reveals fibroblast heterogeneity and increased mesenchymal fibroblasts in human fibrotic skin diseases. Nat Commun 12, 3709 (2021).https: //doi.org/10.1038/s41467-021-24110-y.

艾默生网络能源赢得了各个行业观点塑造者和意见领袖的信赖和认可。为客户创造卓越价值，这是我们对客户的承诺，每个荣誉的获得都是对我们信守承诺的肯定，我们为此感到自豪。2014年3月，艾默生网络能源有限公司荣获由深圳市经济贸易和信息化委员会、深圳市统计局颁发的“2013年度深圳市工业百强企业”。 2014年1月，艾默生网络能源荣膺腾讯授予的“2013年度最佳成长奖”2014年1月，艾默生网络能源有限公司荣获由D1Net授予的“最佳数据中心电源提供商（国际）”称号2013年12月，艾默生网络能源SmartSolutions荣获年度数据中心机房建设优秀解决方案奖。--《计算机世界》2013年12月，艾默生网络能源有限公司荣获由广东省人民政府颁发的“广东省直通车服务重点企业”。2013年11月，艾默生网络能源有限公司荣获“2013年度用户信赖企业”奖。-中国计算机用户协会UPS分会和《UPS与机房》2013年6月，艾默生网络能源在IDC的DCIMMarketScape评选中荣登榜首。-IDC2013年5月，艾默生网络能源制冷产品荣获ComputerWorldHK颁发的数据中心制冷大奖。--ComputerWorldHK2013年1月，艾默生网络能源荣获电信行业节能卫士奖。--《通信世界周刊》2012年12月，艾默生网络能源有限公司荣获由中国电子信息产业发展研究院颁发的2012中国软件和信息服务数据中心领域最佳解决方案奖。--《软件与信息服务》2012年12月，艾默生网络能源Trellis平台荣获由中国数据中心建设运维与用户服务大会组委会2012年度数据中心运维管理优秀解决方案奖。--中国数据中心建设运维与用户服务大会组委。2012年12月，艾默生网络能源有限公司荣获由中国电子信息产业发展研究院颁发的2012中国软件和信息服务风云企业称号。2012年12月，艾默生网络能源云计算中心高压直流供电解决方案荣获的2012年度云计算优秀解决方案奖。--《人民邮电报》2012年11月，艾默生网络能源SmartSolution中小数据中心易睿一体化解决方案荣获2012年度优秀解决方案。-中国计算机用户协会UPS分会及《UPS与机房》2012年10月，艾默生网络能源有限公司荣获2012年中国信息化成果数据中心创新应用奖。--中国计算机用户协会、中国信息化推进联盟、《软件和信息服务》2012年10月，艾默生网络能源有限公司2012年系统管理软件中国方案商首选品牌。--《软件和信息服务》2012年9月，艾默生网络能源荣获计世资讯颁发的“2012中国IT用户满意度调查数据中心一体化解决方案用户推荐品牌”—计世资讯，中国质量协会用户委员会2012年4月，艾默生网络能源Liebert制冷系统荣获2012数据中心制冷大奖--《ComputerworldHK》2012年4月，艾默生网络能源荣获“2011-2012年度数据中心优秀解决方案奖”--中国数据中心产业发展联盟2012年3月艾默生网络能源荣获“优质工程奖--移动通信基站地网优化及综合防雷工程”。--中国质量协会防雷电分会2012年3月，艾默生网络能源高效混插解决方案荣获2012中国绿色ICT产业发展论坛最佳通信电源节能应用创新解决方案奖。--中国通信工业协会、中国电力报社、中国经济与信息化杂志社2012年3月，艾默生网络能源ECM系列机柜荣获2012中国绿色ICT产业发展论坛最佳通信机房整体解决方案奖。--中国通信工业协会，中国电力报社，中国经济与信息化杂志社2012年2月，艾默生网络能源SiteWeb电能管理系统获得2011年度中国通信业荣誉榜-绿色节能杰出贡献奖--《通信世界周刊》2011年12月艾默生网络能源荣获2011年度数据中心基础设施优秀管理解决方案奖.--中国数据中心产品发展联盟2011年12月，艾默生网络能源Liebert.CRV机房精密空调获得渠道财富产品奖--《电脑商报》2011年12月艾默生网络能源荣获颁发的2011年度中国金融IT企业评选的优秀解决方案奖。--《电子金融化》TMCnet通信解决方案2010年度产品奖2011年7月8日—TMC授予HMXDesktopoverIPExtenderSystem“通信解决方案2010年度产品”奖网络产品向导奖最佳部署2011年5月10日—网络产品向导奖最佳部署（成功案例）授予艾默生网络能源，表彰其天普大学（TempleUniversity）和医疗系统校园数据中心扩容/数据中心协作项目的部署AFCOM年度数据中心管理者2011年3月14日—TrinityInformationsTomBoberts成功部署艾默生网络能源旗下Avocent的数据中心解决方案，降低了设备消耗，显著减少了成本创新LiebertMPX机架PDU荣获名望设计奖2011年3月—LiebertMPX柔性机架PDU凭借其优异的产品设计荣获享有国际声誉的红点（RedDot）奖今天的未来技术远程接入解决方案2011年2月15日—Avocent数据中心规划器显著改进了计算资产的管理和规划2011 金桥奖年度技术杰出职业女性2011年8月11日 — 艾默生网络能源的数据中心产品营销总监Traci Yarbrough女士，入选年度技术杰出职业女性TMCnet 通信解决方案2010年度产品奖2011年7月8日 — TMC授予HMX Desktop over IP Extender System “通信解决方案2010年度产品”奖网络产品向导奖最佳部署2011年5月10日 — 网络产品向导奖最佳部署（成功案例）授予艾默生网络能源，表彰其天普大学（Temple University）和医疗系统校园数据中心扩容/数据中心协作项目的部署InfoWorld 2011绿色15强：富士通2011年4月22日 — 富士通业务部门采用了Aperture提供的几个工具，包括配置管理器、基础设施过程管理器以及容量管理器，使数据中心运行组能够详细查看数据中心资源当前和未来的使用，获取诸如用户的占地面积以及每个机架消耗的能量等信息。CRN 2011渠道酋长2011年4月4日—Tracy Collins被CRN誉为2011渠道酋长CRN 2011五星合作伙伴项目奖2011年3月30日 — 创新合作伙伴项目被CRN誉为五星合作伙伴项目AFCOM 年度数据中心管理者2011年3月14日 — Trinity Informations Tom Boberts成功部署艾默生网络能源旗下Avocent的数据中心解决方案，降低了设备消耗，显著减少了成本创新Liebert MPX机架PDU荣获名望设计奖2011年3月 — Liebert MPX柔性机架PDU凭借其优异的产品设计荣获享有国际声誉的红点（Red Dot）奖今天的未来技术远程接入解决方案2011年2月15日 — Avocent数据中心规划器显著改进了计算资产的管理和规划2010软件500强2010年9月 — 艾默生在《软件杂志》2010全球最大软件和服务提供商名单中位列第77，显示出该全球技术和工程公司在扩展其产品线方面获得的巨大成功。InformationWeek 500强2010年9月 — 艾默生在《InformationWeek》的美国年度信息技术创新应用500强名单中位列第104。2009 软件500强2009年9月 — 艾默生在《软件杂志》全球最大软件和服务提供商名单中位列第76位，显示该全球技术和工程公司在扩展其产品线方面获得的巨大成功。Newsweek 绿色名单2009年9月 — 艾默生在Newsweek的独家美国500强企业环境排名中位列第129。InfoSecurity 产品向导2009今天的未来技术奖2009年4月29日— DSView 3 荣获今天的未来技术远程接入管理解奖。HMX Digital 在NAB展上荣获2009Mario奖2009年4月23日 — Avocent的HMX KVM over LAN显示了针对媒体行业卓越的技术创新。2009广播工程PICK HIT奖2009年4月23日— HMX1050数字工作站扩展器在NAB上荣获最具声誉技术奖。InfoSecurity 2009 全球产品卓越奖2009年4月21日—LANDesk 资产生命周期管理器凭借其“最佳资产管理解决方案”荣获InfoSecutiry 2009全球产品卓越奖。进步生产奖——卓越服务运行奖2009年4月——艾默生网络能源的Liebert服务业务凭借其行业领先的远程电源和精密制冷监控系统技术——Virtual Ntegrity，被管理自动化杂志授予该殊荣。财富500强2009年4月——在以收入评选的《财富500强》名单中，艾默生从第111位上升为第94位。艾默生同时也被《财富500强》列为最大的电子和电力设备生产商。CRN 渠道冠军奖2009年3月——艾默生网络能源获得了IT转销商渠道的认可，凭借其在UPS数据中心电源管理类别中的项目支持，荣获2009计算机转销商新闻（CRN）渠道冠军奖。财富全球最受尊敬的公司2009年3月——全球最受尊敬的公司评选中，艾默生连续两年入选，在电气设备类别中的排名从第三名上升为第二名。排名反映了375个投资管理公司中675名投资者分析师和投资经理的观点。VDC嵌入板金销售商奖2009年3月——艾默生网络能源被誉为计算机板卡最佳销售商。该奖项基于在价格、可用性、供货、技术支持和可靠性等方面的用户评价。机构投资者杂志授予的美国股东最友好公司2009年3月——全球最受尊敬的公司评选中，艾默生连续两年入选，在电气设备类别中的排名从第三名上升为第二名。排名反映了37个投资管理公司中675名投资者分析师和投资经理的观点。2009 Datamation年度产品奖2009年2月——LANDesk安全套件被授予企业安全奖，DSView 3软件被誉为网络和系统管理入围奖。年度SearchDataCenter 产品2009年2月——艾默生网络能源Knurr quick-ship机架，在SearchDataCenter的2008年度产品评选中荣获铜奖。Uptime 组织2009全球绿色100强，褒奖在IT能源效率中的企业领导地位2009年2月——2009全球绿色100强，褒奖其在IT能源效率中的企业领导地位。该名单遴选的企业显示了在减少能源消耗和碳排放方面的承诺和成就。最佳渠道销售商奖2009年1月——艾默生网络能源荣获了企业解决方案杂志（BSM）所颁发的“最佳渠道销售商奖”。该杂志是面向IT渠道公司领导层的出版物。2008福布斯美国大企业400强2008年12月——艾默生再次荣获美国上市公司400强。艾默生过去10年一直榜上有名。财富全球500强2008年7月——在以收入评选的全球500强企业中，艾默生位列第375.eg3 技术选择奖2008年6月——艾默生网络能源的CentellisTM 500——可全面部署、经过测试和验证的MicroTCATM系统在eg3的MicroTCA类别中荣获编辑和读者选择奖。《电子设计师》杂志的电子设计最佳100雇主2008年6月——艾默生在《电子设计师》杂志的电子设计最佳100雇主评选中位列第15.该杂志在当今的工程领域具有极大的影响力。Barron5002008年5月——在该杂志美国和加拿大最大上市公司最新评选中（基于销售额和现金流），艾默生上升为地24位。福布斯全球20002008年4月——艾默生在全球大公司2000强评选中，艾默生位列第275。该评选基于销售额、利润、资产和市值等复合指数。艾默生还被该杂志评选为全球最佳执行力130强之一。年度咨询工程产品奖在通信类目中，艾默生凭借其Liebert vNSA网络开关荣获年度咨询工程产品奖银奖。ECM杂志年度产品奖2008年3月——艾默生网络能源在《电气建设和维护杂志》（ECM）的年度产品将中，荣获两个类目的最高殊荣。这两个类目分别是电源类目（Liebert NX入选）和机架和机箱类目（Liebert XDK-W）入选。CRN渠道冠军奖2008年6月。艾默生网络能源通过转售商渠道销售其Liebert电源、制冷和监控产品以及Knurr IT机架。InformationWeek 500 2008年9月——艾默生在该杂志美国信息技术最具创新用户500强中位列第117位。SearchDataCenter年度产品奖2008年1月——艾默生网络能源连续第二年被Tech Target的SearchDataCenter年度冠军产品，其Liebert NX 和SoftscaleTM在数据中心后备电源类别镇南关荣获银奖。ACHR Dealer设计奖2008年7月——艾默生网络能源凭借其卓越的产品设计，荣获《空调制热和冷却新闻》（ACHRN）颁发的殊荣。该杂志是制热、通风、空气调节和制冷领域领先的行业杂志。Liebert DS上送风配置，在第五届Dealer 设计奖评选活动中荣获HVAC商用设备类目中的最高奖金奖。2007AdvancedTCA 高峰会最佳展览奖2007年10月——艾默生网络能源的CentellisTM 2000 AdvancedTCA ®通信服务器在第三届AdvancedTCA峰会上获得基础设施产品展最佳奖。该会议与2007年10月16日-18日在加利福尼亚的Santa Clara召开。TechTarget的2006年度SearchDataCenter产品奖2007年3月——艾默生网络能源旗下Liebert的三款产品荣获TechTarget的2006年度SearchDataCenter产品奖。在后备电源类目中，Liebert FPC荣获银奖，Liebert FS荣获铜奖；在数据中心制冷类目中，Liebert XDH荣获铜奖。在中国质量协会用户委员会及计世资讯主办的 “ 2007 年中国 IT 用户满意度调查” 中， 艾默生网络能源有限公司囊括 UPS 用户满意度综合第一、用户首选品牌、品牌忠诚度第一三个奖项，精密空调荣获用户满意度综合第一。《计算机产品与流通》 2006 年渠道选择金奖2006 年 12 月在中国IT领域最具影响力的渠道媒体--《计算机产品与流通》进行的 2006 年渠道选择金奖评选中，艾默生网络能源有限公司是众多 UPS 参评厂商中唯一获此殊荣的企业。《南方周末》 2006 年世界 500 强企业在华投资企业排行榜2006 年 11 月在《南方周末》发布的 2006 年世界 500 强企业在华投资企业排行榜中，艾默生网络能源有限公司位列世界 500 强在华投资企业在华影响力榜第 48 位，在华投资企业最具社会责任企业排行榜第75 位。2006 中国 IT 用户满意度调查 “用户综合满意度第一”2006 年 10 月在《计世资讯》主办的“2006 中国 IT 用户满意度调查” 中，艾默生网络能源有限公司的 UPS （不间断电源）产品线囊括UPS “用户满意度综合第一”、“用户首选品牌”、“品牌忠诚度第一”三个奖项；精密空调荣获“用户满意度综合第一”。《中国计算机报》 UPS 及一体化解决方案等五项编辑选择奖互联网电话杂志2006年度产品奖（技术营销企业）2007年1月——艾默生网络能源的NterpriseIP解决方案荣获技术营销企业（TMC ®）的互联网电话杂志所颁发的2006年度产品奖。2006 渠道选择金奖2006年11月——2006年11月，艾默生网络能源被授予计算机产品和流通的“渠道选择金奖”。2006年最受信任的IT产品2006年10月——2006年10月艾默生的小UPS被授予中小企业采购“2006年最受信任的IT产品”奖福布斯全球2000强2006年4月——艾默生在以销售额、利润、资产和市值为基础评估的全球2000强中位列第273。财富500 2006年4月——艾默目前去以收入评选的美国500强企业中位列第126。《财富》全美最受赞赏企业2006 年 3 月Emerson 一直在电子类领域企业声誉指标的权威性评选报告中位居前列，排名电子类第三位。《福布斯》美国 400 强企业艾默生网络能源 2007 年中国 IT 用户满意度调查 “用户综合满意度第一”2006 年 1 月中国建设部正式授予采用艾默生谷轮强热型数码涡旋®技术（Copeland Digital Scroll ® Heating）的格力低温热泵多联机组以最高技术认可― 评定其为“世界领先”技术，这是自 1999 年以后，近七年来行业内首个得到中国建设部这一最高评价的新技术。2006 年初艾默生网络能源有限公司在《中国计算机报》主办的评奖活动中，一举包揽 UPS 及一体化解决方案等五项编辑选择奖。《通信产业报》通信行业十年优秀合作伙伴奖2006 年 1 月在《通信产业报》十周年特刊的评奖活动中，艾默生网络能源凭借优秀的产品品质，良好的信誉和服务荣获了《通信产业报》的十年优秀合作伙伴奖。《电子产品》杂志 年度产品奖2006 年 2 月雅达的 iMP 系列电源产品获得《电子产品》杂志的年度产品奖。艾默生工业自动化 《控制工程》杂志 2004 年年度新产品奖2005 年 12 月Emerson 位居美国 400 强企业行列，该评选以销售、盈利增长、股市收益、债务对总资产比率、长期盈利增长潜力等为衡量标准，Emerson 连续 7 年上榜。