不可以。经过授权仿真软件的版权可以写毕业论文，没经过授权不可以写毕业论文。毕业论文按一门课程计，是普通中等专业学校、高等专科学校、本科院校、高等教育自学考试本科及研究生学历专业教育学业的最后一个环节，为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前总结性独立作业、撰写的论文。
可以引用发表，但注意不要完全抄袭（当然如果专利本身就是你的除外），不会影响专利新颖性。
只要论文不是用来盈利的，那就不算侵权
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招妹0916
