某公司明知是侵犯外观设计专利权的商品

在我国，专利侵权（发明、实用新型）行为主要有五种：制造、使用、销售、许诺销售、进口。根据你的叙述，你公司主要涉及一种制造某种产品的方法专利，对甲公司来讲，其使用专利方法，显然已经构成专利侵权。对乙公司来讲是否构成侵权，则需分不同情况。如果乙公司只是自己使用，因贵公司对产品不享有专利，则不能禁止乙公司的使用行为，乙公司不构成侵权；如果乙公司购买后进行销售，那么乙公司的销售行为构成专利侵权；

如果你想刨根问底问出这个为什么，估计需要用博士论文的20万字来回答你。如果你只想找个依据的，请见以下《专利法》条文：　　第十一条 发明和实用新型专利权被授予后，除本法另有规定的以外，任何单位或者个人未经专利权人许可，都不得实施其专利，即不得为生产经营目的制造、使用、许诺销售、销售、进口其专利产品，或者使用其专利方法以及使用、许诺销售、销售、进口依照该专利方法直接获得的产品。　　外观设计专利权被授予后，任何单位或者个人未经专利权人许可，都不得实施其专利，即不得为生产经营目的制造、许诺销售、销售、进口其外观设计专利产品。

我国《民法通则》规定，公民、法人的合法的民事权益受法律保护，甲与乙之间的买卖行为不属合法行为，损害了他人合法利益。可以对购买的不合法商品就行收缴，根据实际情况可追缴罚金，如果情节恶劣将处以刑事责任。 乙公司明知甲公司产品有侵害你公司知识产权而购买的，你可以要求相关部门制止这一行为，要求追求乙的行为建议采取行政手段，见效快。