论文查重是会包括毕业论文的摘要部分的，但是并不会包括参考文献部分，因为参考文献都是引用了别人的题目，重复率肯定是比较高的。
sci论文查重通常是国内高校或者期刊对于即将发表的论文或者毕业论文进行原创性审核以及打击学术论文创作过程中可能存在的学术不端行为而采取的一种审核制度，论文查重一般是通过将检测的论文与查重软件数据库中所收录的论文文献，根据一定科学且严格的重复内容识别规则，将论文中发现的重复内容识别出并最终统计出其重复文字占全文字数占比。无论是本科、硕博士还是职称论文，只有通过了查重，文章才能算是合格的。
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