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一种是PDF格式，一种是CAJ格式的
中国知网是指中国国家知识基础设施（China National Knowledge Infrastructure，CNKI），是在教育部、中共中央宣传部、科技部、国家新闻出版广电总局、国家计委的支持下。
由清华大学和清华同方发起，以实现全社会知识资源传播共享与增值利用为目标的知识信息化建设项目，始建于1999年6月。
国家知识基础设施（National Knowledge Infrastructure，NKI）的概念由世界银行《1998年度世界发展报告》提出。
1999年3月，以全面打通知识生产、传播、扩散与利用各环节信息通道，打造支持全国各行业知识创新、学习和应用的交流合作平台为总目标，王明亮提出建设中国知识基础设施工程（China National Knowledge Infrastructure，CNKI），并被列为清华大学重点项目。
CNKI工程集团经过多年努力，采用自主开发并具有国际领先水平的数字图书馆技术，建成了世界上全文信息量规模最大的" CNKI数字图书馆"。
并正式启动建设《 中国知识资源总库》及CNKI 网格资源共享平台，通过产业化运作，为全社会知识资源高效共享提供最丰富的知识信息资源和最有效的知识传播与数字化学习平台。
知网中的硕博论文是caj格式，期刊论文如果在你找到的相关文献列表页，不打开文献，直接点击文献名字右侧的下载键，知网默认的也是caj格式。
但是，PDF格式的论文更方便大家使用。所以，下载硕博论文时，把知网转成英文版知网再下载，这样获取的是PDF格式，而且不用下载知网caj阅读器了。
1、首先百度“中国知网”一般第一个就是中国知网，点进网站看见搜索栏。
2、输入你想要找的论文题目，进而搜索出论文，点进去。
3、进入到论文详情页，看到下面有阅读、CAJ下载，PDF下载，点击PDF下载，论文下载好就是PDF格式的了。
学位论文参考文献格式为[数字]并且以上标的形式标注。文章最后的参考文献(即引文出处)格式应为：最前面是[数字]且顶格书写，接下来是一个空格符号，后面是具体的的参考文献。
参考文献格式一般包括：
1、专著【M】、论文集【C】、报纸文章【N】、期刊文章【J】、学位论文【D】、报告【R】、标准【S】、专利【P】、论文集中的析出文献【A】。
2、常见的字体字号有两种：和正文文本保持一致，或者比正文文本字号小一号。
3、行距常见的有倍、22磅、倍。
4、缩进方式悬挂缩进、首行缩进、无缩进均有出现。
5、英文参考文献中的标点符号要用半角标点，并且按照英文输入的习惯，标点符号后应该加一个空格，中文文献中的标点，可以和英文文献保持一致，全部使用半角标点+空格的形式，也可以全部使用全角标点，标点后不加空格。
当我们在论文中参考文献时要在两处提供参考文献信息：
1、参考文献标注，标注于正文中，可以是(【作者】【出版年】：【页码】)，也可以是文献的序号(例如1，2……，①②……)。
2、参考文献表，提供参考文献的详细信息，既可以集中排列在文章的最后，也可以在引用的那一页下方以脚注的形式著录。不同的学术期刊要求不样，必须按其规定的位置与格式呈现。中国知网的信息在导出时，就能生成中国知网格式或CAJ格式的参考文献表。不过，在使用这些自动生成的服务前，还是有必要熟悉参考文献格式的要求。
知网中的硕博论文是caj格式，期刊论文如果在你找到的相关文献列表页，不打开文献，直接点击文献名字右侧的下载键，知网默认的也是caj格式。但是，PDF格式的论文更方便大家使用。所以，下载硕博论文时，把知网转成英文版知网再下载，这样获取的是PDF格式，而且不用下载知网caj阅读器了。下载期刊论文，在文献列表页，下载哪篇文献就点击篇名打开文献，就可以选择PDF格式下载了。
我简要说一下两种格式分别适用的情况吧
注意：知网的论文在高校图书馆内网可以免费下载对于公网我不了解，应该要收费
两种都可以，建议下载PDF版本的，因为PDF版本更实用。
caj是中国期刊网提供的一种文件格式。
CAJ为中国学术期刊全文数据库英文缩写（China Academic Journals）；CAJ同时也是中国学术期刊全文数据库中文件的一种格式。可以使用CAJ全文浏览器来阅读。
中国学术期刊全文数据库是目前世界上最大的连续动态更新的中国期刊全文数据库，积累全文文献800万篇，题录1500余万条，分九大专辑，126个专题文献数据库，其知识来源：国内公开出版的6100种核心期刊与专业特色期刊的全文。6100种全文期刊的数据完整性达到98％。
文件格式的作用：
有些文件格式被设计用于存储特殊的数据，例如：图像文件中的JPEG文件格式仅用于存储静态的图像，而GIF既可以存储静态图像，也可以存储简单动画；Quicktime格式则可以存储多种不同的媒体类型。
文本类的文件有：txt文件一般仅存储简单没有格式的ASCII或Unicode的文本；HTML文件则可以存储带有格式的文本；PDF格式则可以存储内容丰富的，图文并茂的文本。同一个文件格式，用不同的程序处理可能产生截然不同的结果。
以上内容参考：百度百科-caj
cnki的博硕士论文有caj格式和PDF格式。
CAJ文件是一种同PDF文件类似的文件格式，网络上的许多电子图书文献均使用这种格式以让广大用户浏览。在浏览CAJ格式文件的时候，必须使用相应的浏览器才，通用的浏览器为CAJViewer。
PDF是Portable Document Format的简称，意为“可携带文档格式”，是由Adobe Systems用于与应用程序、操作系统、硬件无关的方式进行文件交换所发展出的文件格式。
CAJ文件无法复制文字怎么办：
1、对于可复制文字格式原文，要注意正确的使用方法：鼠标的箭头向左时点击要复制文字的开头，向右时点击要复制文字的结尾，否则会复制不到想要的文字。
2、如果整篇原文是图片格式，则不能选择复制文字，只能复制成图片。
以上内容参考 中国知网 - 帮助中心 百度百科 - Caj-cd规范 百度百科 - pdf
CAJ是电子刊物的一种格式，可以使用CAJ全文浏览器来阅读。
CAJ全文浏览器是中国期刊网的专用全文格式阅读器，它支持中国期刊网的CAJ、NH、KDH和PDF格式文件。它可以在线阅读中国期刊网的原文，也可以阅读下载到本地硬盘的中国期刊网全文。它的打印效果可以达到与原版显示一致的程度。
同一个文件格式，用不同的程序处理可能产生截然不同的结果。例如Word 文件，用Microsoft Word观看的时候，可以看到文本的内容，而以无格式方式在音乐播放软件中播放，产生的则是噪声，一种文件格式对某些软件会产生有意义的结果。
常见文件格式释义：
ISO：镜像文件
RAR：压缩包
html：网页
zip：压缩包
exe：可执行文件
pdf：pdf文档
rm：视频文件
avi：视频文件
tmp：临时文件
mdf：虚拟光驱镜像文件
txt：记事本
doc/docx：Word文档
xls/xlsx：Excel工作表
ppt/pptx：PowerPoin幻灯片
MID：数字乐谱信息文件
以上内容参考 中国知网-CAJ是什么格式?用什么软件打开
不同大学和不同的学术期刊，对论文引用参考文献的格式也有很大的不同，最好是按照实际要求来标注，一般大学的毕业论文都会有自己的标准，文字方法如下：
(1)首先打开要标注参考文献的word文档，用鼠标点在需要添加标注的位置，然后点开【引用】选项卡，点击【脚注和尾注】，这时候会弹出一个脚注尾注的设置框，勾选【尾注】，格式勾选【方括号样式】，应用更改设置为【整篇文档】，设置好之后点击【插入】，这样在该处就插了一个上标“[1]”，这就是输入第一个参考文献的地方。
(2)但需要注意的是，参考文献自己排序——不能手打序号，参考文献导入后，选中参考文献，点击菜单栏【开始】——【编号】——【定义新编号格式】将编号格式里的“1”，手动添加英文符号“[]”，变为“[1]”后，选中参考文献即可自动排序。
(3)插入交叉引用，在需要插入引用文献的位置，选择【插入】——【交叉引用】，选择需要插入的文献即可，可以连续插入文献，一步到底。随后将引用的“[1]”点击【开始】——【上标】，一篇标准的参考文献格式就出来了。
当然，参考文献的标注也是有学问的，分为全部引用、局部引用、间接引用
①全部引用（直接引用）
需要双引号，无论冒号逗号，句号在双引号里，标注放最后面
例：“我是论文我是论文我是论文我是论文。”[1]
②局部引用（直接引用）
自己的句子构成中，引用一小段文字，标注在引号后面
例：我是论文我是论文我是论文，“我是引用我是引用”[1]。
③间接引用
无双引号，标注放在符号后
1、目前我们写作毕业论文灿参考的格式是GB/T 7714-2015《信息与文献 参考文献著录规则》和GB/T7714—2005《文后参考文献著录规则》。 2、参考文献根据内容的不同分成了图书，报纸，专利文件等很多类，不同类参考文献类型代码不同。 3、参考文献的格式基本上是类似的，只是代码不太相同。例如内容为专著的参考文献格式为[序号] 著者.书名[M].出版地：出版者，出版年：起止页码。
关于参考文献的正确格式
关于参考文献的正确格式，参考文献指的是在文章或者著作中参考到的文献，有一定的格式要求，而参考文献更加是学术论文的重要组成部分，下面分享关于参考文献的正确格式相关内容，一起来看看吧。
参考文献是根据GB/TB7714-2005《文后参考文献著录规则》，适用于“著者和编辑编录的'文后参考文献，而不能作为图书馆员、文献目录编辑者以及索引编辑者使用的文献编著录规则”。参考文献的书写样式不可随意更改，要按照标准仔细地进行排版。
参考文献的编写顺序是按照论文中引用文献的顺序进行编排，采用中括号的数字连续编号，
依次书写作者、文献名、杂志或书名、卷号或期刊号、出版时间。
参考文献的书写首先要明确的一点是，参考文献的全角和半角问题。其实很简单，英文标点+半角；中文标点+全角。可以自己试一下全角和半角的差别在哪，其实就是字符问题，全角字符占两个字节，半角是占一个。另外我们要了解一下关于参考文献都有哪些类型。一共是分为16种类型，如下图所示。
其中对于专著、论文集中的析出文献，其文献类型标识建议采用单字母“A”；对于其他未说明的文献类型，建议采用单字母“Z”。
我们可以具体的学习一下参考文献格式
[序号] 期刊作者。题名[J]。刊名。出版年，卷(期): 起止页码。
[序号] 专著作者。书名[M]。版次(第一版可略)。出版地：出版社，出版年∶起止页码。
[序号] 论文集作者。题名〔C〕。编者。论文集名。出版地∶出版社，出版年∶起止页码。
[序号] 学位论文作者。题名〔D〕。保存地点：保存单位，年份。
[序号] 专利所有者。专利文献题名〔P〕。国别：专利号。发布日期。
[序号] 标准编号，标准名称〔S〕。出版地：出版者，出版年。
[序号] 报纸作者。题名〔N〕。报纸名，出版日期(版次)。
[序号] 报告作者。题名〔R〕。报告地：报告会主办单位,年份。
[序号] 电子文献作者。题名〔电子文献及载体类型标识〕。文献出处，日期。
参考文献以正文中引用的先后次序排列。
以下分别是著作、学位论文和期刊的例子：
[1] 王兴业，唐羽章。复合材料力学性能[M]。长沙：国防科技大学出版社，1988：366–382。
[2] 李玉彬。环氧树脂电子束固化机制与应用基础研究[D]。北京：北京航空航天大学，2005。
[3] 武德珍，宋勇志，金日光。PVC/弹性体/纳米CaCO3 复合体系的加工和组成对力学性能的影响[J]。复合材料学报，2004，21(1)：119–124。
参考文献参考文献的著录应符合国家标准，参考文献的序号左顶格，并用数字加方括号表示，与正文中的引文标示一致，如[1]，[2]……。每一条参考文献著录均以“.”结束。具体各类参考文献的编排格式如下：1.文献是期刊时，书写格式为：[序号] 作者. 文章题目[J]. 期刊名, 出版年份，卷号(期数):起止页码.（2）文献是图书时，书写格式为：[序号] 作者. 书名[M]. 版次. 出版地：出版单位，出版年份：起止页码.3.文献是会议论文集时，书写格式为：[序号] 作者. 文章题目[A].主编.论文集名[C], 出版地：出版单位，出版年份:起止页码.4.文献是学位论文时，书写格式为：[序号] 作者. 论文题目[D].保存地：保存单位，年份.5.文献是来自报告时，书写格式为：[序号] 报告者. 报告题目[R].报告地：报告会主办单位，报告年份.6.文献是来自专利时，书写格式为：[序号] 专利所有者. 专利名称：专利国别，专利号[P].发布日期.7.文献是来自国际、国家标准时，书写格式为：[序号] 标准代号. 标准名称[S].出版地：出版单位，出版年份.8.文献来自报纸文章时，书写格式为：[序号] 作者. 文章题目[N].报纸名，出版日期（版次）.9.文献来自电子文献时，书写格式为：[序号] 作者.文献题目[电子文献及载体类型标识].电子文献的可获取地址，发表或更新日期/引用日期（可以只选择一项）.电子参考文献建议标识：［DB/OL］——联机网上数据库(database online)［DB/MT］——磁带数据库(database on magnetic tape)［M/CD］ ——光盘图书(monograph on CD-ROM)［CP/DK］——磁盘软件(computer program on disk)［J/OL］ ——网上期刊(serial online)［EB/OL］——网上电子公告(electronic bulletin board online)
人名.参考文献名[EB/OL].
如图所示，不要直接点击“整本下载“，而是右键“整本下载”，选择“目标另存为”，就可以下载.caj格式的了。
文件关联错了，把.caj文件格式改回来就可以了。