可以。任何时间都可以申请专利。发表论文后，即使论文中已经记载了专利申请的内容，写成专利时只需要明确一个时间点，这样就不会影响专利授权了。
不行的 ，已经公开就不行了
不清楚你说的“专利论文”是什么，是不是只专利申请文件。大学的毕业论文，是学术文章。专利申请文件，是法律文件。如果要学习，建议至少要看一下专利法和专利法实施细则。你所说的实用专利，应该是指实用新型，它是专利的一种，它保护的是产品的结构特征。你所说的外观专利，应该是指外观设计，它也是专利的一种，它保护的是产品的外观特征。如果第一次写，可以去国家知识产权局下载几篇由比较大的专利事务所代理的专利授权文件看一下。
实用新型的话写得比外观设计复杂点，它需要些说明书，说明书摘要，说明书附图，权利要求书等等 外观设计只需提供六面视图，以及简单的说明就可以了！
需要要确认论文是否被发表，没有被发表，才可以改写为专利的，不然专利不会被授权下证
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