Gut:粪便病毒组移植(FVT)对2型糖尿病和肥胖小鼠模型的缓解作用 近年来,粪便移植已成为治疗由梭状芽胞杆菌引起的严重腹泻的流行方法。最近,丹麦哥本哈根大学Dennis Nielsen课题组在一项小鼠中进行的试验表明,通过粪便病毒组移植减轻肥胖症和2型糖尿病(Type 2 diabetes mellitus, T2DM)患者的临床症状。 研究目的 : 肥胖症和2型糖尿病(T2DM)的发生发展与肠道微生物群(gut microbiota, GM)的改变有关。噬菌体(phages)是一种以宿主特异性方式攻击细菌的病毒,其拮抗作用有可能改变肠道菌群,作为概念验证,Dennis课题组通过较瘦供体粪便病毒组移植(Fecal virome transplantation,FVT)将 转变 肥胖小鼠转变为较瘦小鼠表型,证明FVT对2型糖尿病和肥胖症干预的有效性。 实验设计 : 图1:实验设计流程图。40只5周龄的雄性C57BL/6NTac小鼠分为低脂(Low Fat, LF)饮食、高脂(High Fat, HF)饮食、HF +氨苄青霉素(ampicillin, Amp)、HF+Amp+FVT和HF+FVT 5组:(图1)。在13周内,小鼠被随意喂食HF饲料(研究饲料D12492,美国)和LF饲料(研究饲料D12450J,美国)。在不同方案喂食6周后,HF+FVT和HF+Amp+FVT组的小鼠分别用 mL肠溶酶间隔1周(第6、7周)灌胃进行两次FVT,。第一次接种FVT前一天,HF+Amp和HF+Amp+FVT小鼠在饮用水中给予单剂量Amp(1 g/L)。从18只C57BL/6N小鼠的盲肠含量中提取并混合用于FVT的病毒体,这些小鼠代表3个不同的供体,饲喂LF饲料14周。来自不同供应商的个体小鼠代表了独特和多样的病毒概况。应用的FVT 病毒组的滴度约为2×1010病毒样颗粒/mL。在研究的第20周,对小鼠进行口服葡萄糖耐量试验(OGTT),并监测食物摄入量和小鼠体重。 项目流程 : 结果: 1. 瘦供体FVT降低了DIO小鼠的体重增速,使血糖耐量恢复正常 小鼠分别在FVT前1-2周和FVT后间隔1-2周称量体重。在第一次FVT 后,第4和第6周(15、17周龄)时,HF+FVT小鼠(p<)和HF+Amp小鼠(p<)的体重增加明显低于HF小鼠(图2)。LF和HF+FVT小鼠OGTT无显著差异(p>),而HF小鼠OGTT水平显著升高与LF组和HF+FVT组比较(p<),显示FVT已使HF+FVT小鼠的血糖耐量正常化(图2B)。此外,HF+Amp+FVT的OGTT与HF小鼠相当(p>),说明在HF+Amp+FVT小鼠中,Amp对细菌组成的初始破坏有可能抵消了FVT的作用, 。 这同时表明,与FVT相关的影响是通过肠道菌群成分的改变而发生的。除糖化血红蛋白(HbA1c)水平和每只小鼠的食物消耗量外,还定期测定非禁食血糖。 图2. (A)第一次FVT后2、4、6周(分别为13、15、17周)体重增加的条形图。首次FVT后6周(17周龄)测定OGTT水平。数值是基于tAUC相对于单个小鼠的血糖水平。图中排除了第一次FVT后第4周和第6周两两比较的显著差异,以增加图像的可视性。*P<,**P<, ***P<, ****P< 。Amp,氨苄青霉素;FVT,粪便病毒组移植;HF,高脂;LF,低脂。ns,不显著; OGTT, 口服葡萄糖耐量试验; tAUC, 曲线下总面积。 2. FVT 增强了全身能量稳态相关基因的表达 以肝脏和回肠组织中与肥胖和T2D相关的基因为目标,检测HF+FVT与HF小鼠中相关基因的表达是否有显著差异,并与LF小鼠具有相似性。结果显示,FVT降低了HF饮食引起的基因表达差异,从而形成与健康LF小鼠相似的表达水平。 图3:肝脏和回肠组织中与肥胖和T2D相关的基因表达水平(18周龄)。(A) Ffar2Ileum ,(B) LeprLiver ,(C) KlbLiver ,(D) Ppargc1aLiver ,(E) Igfbp2Liver ,(F) Socs3Liver ,(G) MycLiver 。采用以HF或LF为对照组的线性模型计算组间显著性。样本质检表达量的差异倍数取log2是对相对基因表达的一种度量,它是基于log2转化的表达值归一化到最小值的样本。 Ffar2Ileum ,游离脂肪酸受体; LeprLiver ,胰岛素样生长因子结合蛋白; KlbLiver ,β-klotho; Ppargc1aLiver ,瘦素细胞因子受体; Igfbp2Liver ,过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活剂1-α; Socs3Liver ,细胞因子信号传导抑制因子; MycLiver 转录因子。FVT,粪便病毒组移植;HF,高脂;LF,低脂。ns,不显著; 3. FVT 介导肠道菌群转移 盲肠样本16S rRNA基因拷贝数/g在×1010 ~×1010之间变化。LF小鼠的细菌Shannon多样性指数明显高于HF小鼠(p<),但与HF+FVT小鼠相似(p=)。与HF小鼠相比,盲肠中HF+FVT的Shannon多样性指数也显著增加(p<),但在结肠中Shannon多样性指数没有明显增加。Amp治疗后7周,Amp处理过的HF+Amp小鼠的Shannon多样性指数最低(p<),而FVT提高了Amp干预后的HF+Amp+FVT小鼠的Shannon多样性指数(p<)(图4A)。FVT对病毒Shannon多样性指数无影响(p>),而Amp的处理显著(p<)增加了病毒Shannon多样性指数(图4B和线上补充表S5),其原因可能是由于噬菌体的诱导。 根据Bray- Curtis差异测定法,FVT对细菌组成(图5A, p<)和病毒组成(图5B,P<)都有强烈的影响,如HF+FVT与HF小鼠、HF+Amp+FVT与HF+Amp小鼠的明显分离。 FVT受体的GM特征与供体的GM特征不完全相似,这表明供体病毒组只有部分在接种6周后建立。此外,所有实验组在病毒和细菌群落中两两显著分离(p<),包括LF和HF+FVT (p<)。该研究发现,无论是否经过Amp处理,FVT都强烈地影响和部分重塑了GM的组成。rCCA表明,某些细菌(拟杆菌目和梭菌目)和病毒(尾病毒目,微病毒科和未鉴定的病毒)之间存在强(r>)正或负相关性的潜在宿主-噬菌体对关系。 图4.供体和盲肠(A)细菌和(B)终止时(18周龄)的Shannon多样性指数。括号表示图中每一组的样本数量,灰色点表示异常值。供体是从三个不同供体的盲肠内容物中提取的细菌或菌体的1:1:1混合而成。各组的两两比较见线上补充表S5。*P<。Amp,氨苄青霉素;FVT,粪便病毒组移植;HF,高脂;LF,低脂。ns,不显著。 图5:PCoA图,基于Bray-Curtis不同度测量,取供体和盲肠(A)细菌群落和(B)18周龄病毒群落。Bray- Curtis不同度量的相似度分析(ANOSIM)显示在表中。供体是从三个不同供体的盲肠内容物中提取的细菌或菌体的1:1:1混合而成。各组的两两比较见线上补充表,氨苄青霉素;FVT,粪便病毒组移植;HF,高脂;LF,低脂。 图6.说明所有五个实验组细菌(A)和病毒(B)概况的热图,以及某些细菌和病毒簇之间的强烈相关性(C)。 4. FVT 介导的血浆代谢组谱的改变 采用非靶向UPLC- MS分析血浆样品,测定FVT对宿主代谢组的影响。基于数据集建立了PCA模型,比较LF、HF和HF+FVT的概况(图7,所有组的在线上补充图S111)。与其他测量方法一致,HF+FVT小鼠的血浆谱位于HF和LF小鼠之间。两两建立OPLS-DA模型,所有模型(LF vs HF、LF vs HF+FVT、HF vs HF+FVT)均具有统计学意义(p<),支持三组分离。在筛选出的VIP评分为>2的特征中,仅对与相关基因表达相关(基于rCCA)和细菌或病毒丰度相关的特征进行进一步检测以进行注释。研究的特征主要包括饱和/不饱和溶血磷脂(LysoPC)和/或磷脂磷脂胆碱(PCs), 而 其余的特征包括各种氨基酸或无法识别的代谢物。总体而言,与LF小鼠相比,HF小鼠的LysoPC(18:2)、LysoPC(22:2)、PC(16:0/22:6)水平更高,血浆LysoPC(22:4)和PC (18:1/O-18:2)水平更低。与LF小鼠相比,HF+FVT小鼠循环LysoPC(16:0)、LysoPC(18:2)和PC(16:0/22:6)水平升高,而LysoPC(22:4)和PC (18:1/O-18:2)水平降低。与HF小鼠相比,HF+FVT小鼠的LysoPC(16:0)、LysoPC(18:0)和PC (18:1/O-18:2)水平更高。 图分析图,原始数据各维度和每个主成分的相关度由电喷雾电离(ESIZ)+UPLC-MS处理的终止妊娠(18周龄)时LF、HF和HF+FVT(R2=和Q2=)得到,表包括由两两比较生成的监督的OPLS-DA模型。HF,高脂;LF,低脂;OPLS- DA,潜结构正交投影判别分析;PCA,主成分分析;UPLC- MS,超高效液相色谱-质谱分析。 结论 : ① 对高脂喂养的小鼠进行粪便病毒组移植(FVT),移植来源为低脂喂养14周的瘦小鼠的盲肠病毒组;② FVT 后第 6 周,受体小鼠的体重增长显著降低,且 葡萄糖耐受性 OGTT与 瘦 低脂喂养的对照组小鼠相似,没有出现 发生 因高脂喂养诱发 引起 的糖耐受损;③与此一致的是,FVT 显著改变了小鼠的肠道细菌和病毒组成、血浆代谢物以及与肥胖和 2 型糖尿病相关基因的表达水平;④ 但在 FVT 前进行抗生素预处理,反而会削弱 FVT 的有益效果。这项研究说明,噬菌体介导的疗法或能用来治疗肥胖和糖尿病等肠道菌群相关疾病。