理事会下设大气物理与人工影响天气委员会、农业气象与生态学委员会、天气与极地气象学委员会、动力气象学委员会、水文气象学委员会、大气环境学委员会、卫星气象与空间天气学委员会、航空与航天气象学委员会、台风委员会、热带与海洋气象学委员会、干旱气象学委员会、军事气象学委员会、城市气象学委员会、气象软科学委员会、气候学委员会、统计气象学委员会、大气探测与仪器委员会、数值天气预报委员会、气象通信与信息技术委员会、大气科学名词审定委员会、气象史志委员会、气象教育与培训委员会、气象影视与广播技术委员会、雷电防护委员会、气象经济学委员会、大气化学委员会、气象灾害与服务委员会、气候生态学委员会、雷达气象学与气象雷达委员会等29个学科委员会及气象科学普及工作委员会、《气象学报》编审委员会、《气象知识》编审委员会、涂长望青年气象科技奖评选委员会等4个工作委员会。