氨基酸组成成分方法没有考虑残基在序列中出现的顺序,而仅仅计算二十种基本氨基酸在序列中的出现频率,该模型忽略了氨基酸残基间的顺序关系;k-mer频度的特征提取方法仅考虑了氨基酸残基的局部顺序关系,当k增加时,向量维度迅速升高;这两种模型
摘要:机器学习算法无法直接对连续的氨基酸序列进行功能注释,将用字符串表示的氨基酸序列转化成用数值表示的特征向量是必要步骤,本文探讨了基于氨基酸序列的特征提取方法,简单探讨了各种方法的优劣,为新的氨基酸序列特征提取方法的研究起到抛砖引玉的作用。
中山大学博士学位论文基于氨基酸序列信息的蛋白质结构与功能预测研究姓名:李占潮申请学位级别:博士专业:分析化学指导教师:邹小勇20090607基于氨基酸序列信息的蛋白质结构与功能预测研究专业:分析化学姓名:李占潮导师:邹小勇教授摘要随着人类基因组计划的顺利完成,以及...
分子动力学模拟氨基酸序列对胶原蛋白热稳定性的影响四川大学制革清洁技术国家工程实验室,成都(610064)E-mail:zhangwh@scu.edu要:采用分子动力学模拟方法,研究了氨基酸序列对胶原蛋白热稳定性的影响。
选取序列CAA25899即(cytochromec.fasta),进行蛋白质一级,二级,三级结构、四级结构的预测。3.2蛋白质序列分析3.2.1一级结构预测蛋白质一级结构[20](Primarystructure)是指不同氨基酸装配形成蛋白质的次序,也称蛋白质的序列,氨基酸也是
多序列比对结果的可视化效果.毕业论文中的多序列比对结果模糊不清晰是一个广泛存在的通病,存在这一问题的原因是多数时候我们都选择了把多序列比对结果以图片的形式插入Word,如果图片本身不是矢量图,那插入Word只会让自己的比对结果糟糕的展示在答辩...
进入之后页面如下,可以在前面标识的菜单右边下拉选择要下载的类型,GENE或者protein看自己需要,在后面搜索框输入序列注册号或者名字,点击后面search进行搜索。
今日,顶尖学术期刊在线发表一篇重要论文——科学家首次使用纳米孔技术,以单氨基酸的分辨率,对蛋白质序列进行了直接读取,可谓是纳米孔技术一大重量级的概念验证。说到纳米孔技术,很多人会想到DNA测序。的确,…
第二十二届中国控制会议论文集——神经网络系统氨基酸序列编码对蛋白质二级结构预测的影响”孙海军(北京工业大学北京100022)E-mail:sunhaijun_hong@eyoucom摘要:本文主要通过运用前向型BP神经网络来比较正交编码、5位编码、Codon(密码予)编码和Profile编码等4种常用氨基酸序列络编码方式...
第二遗传密码(读论文系列第一期).白鲸落.高中学的生物里介绍了生物学的第一遗传密码,即从DNA序列到肽链的氨基酸序列的对应关系。.然而,肽链是如何折叠形成蛋白质结构的呢?.这个过程之间是不是又有类似第一遗传密码这样的对应关系呢?.第一遗传...
氨基酸组成成分方法没有考虑残基在序列中出现的顺序,而仅仅计算二十种基本氨基酸在序列中的出现频率,该模型忽略了氨基酸残基间的顺序关系;k-mer频度的特征提取方法仅考虑了氨基酸残基的局部顺序关系,当k增加时,向量维度迅速升高;这两种模型
摘要:机器学习算法无法直接对连续的氨基酸序列进行功能注释,将用字符串表示的氨基酸序列转化成用数值表示的特征向量是必要步骤,本文探讨了基于氨基酸序列的特征提取方法,简单探讨了各种方法的优劣,为新的氨基酸序列特征提取方法的研究起到抛砖引玉的作用。
中山大学博士学位论文基于氨基酸序列信息的蛋白质结构与功能预测研究姓名:李占潮申请学位级别:博士专业:分析化学指导教师:邹小勇20090607基于氨基酸序列信息的蛋白质结构与功能预测研究专业:分析化学姓名:李占潮导师:邹小勇教授摘要随着人类基因组计划的顺利完成,以及...
分子动力学模拟氨基酸序列对胶原蛋白热稳定性的影响四川大学制革清洁技术国家工程实验室,成都(610064)E-mail:zhangwh@scu.edu要:采用分子动力学模拟方法,研究了氨基酸序列对胶原蛋白热稳定性的影响。
选取序列CAA25899即(cytochromec.fasta),进行蛋白质一级,二级,三级结构、四级结构的预测。3.2蛋白质序列分析3.2.1一级结构预测蛋白质一级结构[20](Primarystructure)是指不同氨基酸装配形成蛋白质的次序,也称蛋白质的序列,氨基酸也是
多序列比对结果的可视化效果.毕业论文中的多序列比对结果模糊不清晰是一个广泛存在的通病,存在这一问题的原因是多数时候我们都选择了把多序列比对结果以图片的形式插入Word,如果图片本身不是矢量图,那插入Word只会让自己的比对结果糟糕的展示在答辩...
进入之后页面如下,可以在前面标识的菜单右边下拉选择要下载的类型,GENE或者protein看自己需要,在后面搜索框输入序列注册号或者名字,点击后面search进行搜索。
今日,顶尖学术期刊在线发表一篇重要论文——科学家首次使用纳米孔技术,以单氨基酸的分辨率,对蛋白质序列进行了直接读取,可谓是纳米孔技术一大重量级的概念验证。说到纳米孔技术,很多人会想到DNA测序。的确,…
第二十二届中国控制会议论文集——神经网络系统氨基酸序列编码对蛋白质二级结构预测的影响”孙海军(北京工业大学北京100022)E-mail:sunhaijun_hong@eyoucom摘要:本文主要通过运用前向型BP神经网络来比较正交编码、5位编码、Codon(密码予)编码和Profile编码等4种常用氨基酸序列络编码方式...
第二遗传密码(读论文系列第一期).白鲸落.高中学的生物里介绍了生物学的第一遗传密码,即从DNA序列到肽链的氨基酸序列的对应关系。.然而,肽链是如何折叠形成蛋白质结构的呢?.这个过程之间是不是又有类似第一遗传密码这样的对应关系呢?.第一遗传...