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方法:本工作以取自TCGA数据库的肝癌基因,miRNA,DNA化和拷贝数等表达谱的数据为研究对象,采用以下方法进行了相关研究:第一,应用WGCNA(WeightedGeneCoexpressionNetworkAnalysis),即加权基因共表达网络的方法,对肝癌基因和miRNA的数据进行共表达网络的分析,寻找与TNM...
本论文提出和构建了一个在线基因组学数据分析平台,深入探究了基因组和临床数据的关系。让转化医学和基础医学研究者能够方便的浏览TCGA基因组数据和利用平台整合的基因组和临床数据挖掘其对癌症发展、转移等过程的影响。
TCGA差异分析miRNA-靶基因共表达分析生存分析收藏本站首页期刊全文库学位论文库会议论文库年鉴全文库...首届男性大健康中西医协同创新论坛暨第三届全国中西医结合男科青年学术论坛论文…
临床工作者如何利用TCGA及SEER等公共数据库发表论文_哔哩哔哩(゜-゜)つロ干杯~-bilibili.临床工作者如何利用TCGA及SEER等公共数据库发表论文.关注.正在缓冲...播放器初始化...[完成]加载用户配置...[完成]00:02/15:27.
国际顶级学术期刊《Cell》在最新一期中，采用封面形式，发表了包括评论和社论在内的超过8篇文章聚焦了人类的一项伟大成就：人类癌症基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas，TCGA)。而事实上，这些文章都是TCGA的收官项目之作-泛癌症图谱(Pan...
TCGA蛋白分析数据库使用指南.功能蛋白质组学是对蛋白质在功能活性水平（例如表达和修饰）的大规模研究。.对诸如癌症等复杂疾病的研究表明，遗传改变并不能说明该疾病的所有原因。.蛋白质水平和结构的变化也已显示在发展和进展中起关键作用，而...
对于TCGA数据库中数据的下载，除了直接从TCGAGDC（https://portal.gdc.cancer.gov/）外，一般常用的方法是借助R的TCGAbiolinks包来进行下载。这里，我们通过TCGAbiolinks包的GDCquery_Maf()函数来进行下载；其中pipelines参数可以是muse，varscan2，somaticsniper，mutect2中的一种，在此我们选择varscan2数据来进行下载。
TCGATCGA,全称为TheCancerGenomeAtlas（癌症基因组图谱）。通过其名称我们就知道这个数据库主要做的就是相关的数据库。为什么经常看到别人用这个数据库呢？还是因为这个数据库收集的信息全呀。首先，对于研究病种而言，这个数据库包括了33
大家好，今天我给大家分享一篇最新的单基因泛癌生信文章，该文章是发表于FrontiersinImmunology杂志上，最新影响因子为5.6分。该篇文章的分析内容非常充实，值得大家学习和借鉴！！文章题…
4月5日，国际顶尖学术期刊《细胞》及其子刊公布了“癌症和基因图谱”（TCGA）的“升级版”——泛癌症图谱（PanCancerAtlas）的研究结果，相关结果以27篇高水平论文呈现，美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制，他们根据基因变异和表达的相似性，提出可以按…
方法:本工作以取自TCGA数据库的肝癌基因,miRNA,DNA化和拷贝数等表达谱的数据为研究对象,采用以下方法进行了相关研究:第一,应用WGCNA(WeightedGeneCoexpressionNetworkAnalysis),即加权基因共表达网络的方法,对肝癌基因和miRNA的数据进行共表达网络的分析,寻找与TNM...
本论文提出和构建了一个在线基因组学数据分析平台,深入探究了基因组和临床数据的关系。让转化医学和基础医学研究者能够方便的浏览TCGA基因组数据和利用平台整合的基因组和临床数据挖掘其对癌症发展、转移等过程的影响。
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对于TCGA数据库中数据的下载，除了直接从TCGAGDC（https://portal.gdc.cancer.gov/）外，一般常用的方法是借助R的TCGAbiolinks包来进行下载。这里，我们通过TCGAbiolinks包的GDCquery_Maf()函数来进行下载；其中pipelines参数可以是muse，varscan2，somaticsniper，mutect2中的一种，在此我们选择varscan2数据来进行下载。
TCGATCGA,全称为TheCancerGenomeAtlas（癌症基因组图谱）。通过其名称我们就知道这个数据库主要做的就是相关的数据库。为什么经常看到别人用这个数据库呢？还是因为这个数据库收集的信息全呀。首先，对于研究病种而言，这个数据库包括了33
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4月5日，国际顶尖学术期刊《细胞》及其子刊公布了“癌症和基因图谱”（TCGA）的“升级版”——泛癌症图谱（PanCancerAtlas）的研究结果，相关结果以27篇高水平论文呈现，美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制，他们根据基因变异和表达的相似性，提出可以按…
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