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方法:本工作以取自TCGA数据库的肝癌基因,miRNA,DNA化和拷贝数等表达谱的数据为研究对象,采用以下方法进行了相关研究:第一,应用WGCNA(WeightedGeneCoexpressionNetworkAnalysis),即加权基因共表达网络的方法,对肝癌基因和miRNA的数据进行共表达网络的分析,寻找与TNM...
目的基于生物信息学探讨肝细胞癌（肝癌）发生相关基因及其功能。方法从公共基因数据库GEO筛选并下载肝癌组织及癌旁组织基因芯片,通过GEO2R在线工具和Venn图网站筛选出差异表达基因（DEGs）。对筛选出来的DEGs在DID网站进行基因...
中国肝癌发病当前状况与趋势分析解析.pdf,中华杂志2015年9月第37卷第9期ChinJOncol，September2015，Vol．37，No．9·691··预防研究·中国肝癌发病状况与趋势分析左婷婷郑荣寿曾红梅张思维陈万青【摘要】目的通过对中国登记地区人群肝癌发病数据进行分析，了解中国肝癌的发病现状和...
基因组图谱(TCGA)计划利用大规模测序为主的基因组分析技术，通过广泛的合作，理解癌症的分子机制，本研究利用TCGA数据库深入挖掘肝癌发生关键基因。.材料方法：根据标准流程对TCGA数据进行处理、整合，对数据类型及水平进行评估，用R语言(3.1.1版本...
肝内转移和多中心发生的多结节肝癌蛋白质表达谱的差异分析及差异蛋白的表达验证,肝内转移,多中心,电泳,质谱,蛋白。肝细胞肝癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)是严重影响人类健康的恶性之一,在肝癌的…
生信分析43.浸润免疫与肝癌（HCCDB+oncomine)TISIDB/TIMER分析免疫特征（机制三）。.第43篇生信论文的分享。.先不说论文思路，但是论文题目过于简单，其实可以点出与免疫浸润表型相关。.根据最新影响因子的数据，Aging-US的影响因子已经跌破5分，自...
基于以上发现,本实验将聚焦于肝癌中差异表达的糖链相关基因,运用机器学习和加权基因共表达网络（WGCNA,WeightedCorrelationNetworkAnalysis）网络进行分析,旨在找到在癌症的发生和发展中发挥着重要作用的糖链相关基因,及与其协同变化的其它基因,从更
我国肝癌的主要病因为乙型肝炎病毒(HBV)感染,但其发生发展的分子机制尚未完全清楚。Notch信号是一个在进化中高度保守的反映细胞间通讯机制的通路,它调控细胞的分化和增殖,在胚胎发育和细胞命运的决定中发挥重要的作用。
此外，分析了癌症基因组图谱（TCGA）肝细胞癌（LIHC）数据存储库，以进一步研究这些候选lncRNA和snoRNA在肝癌发生中的作用。与相邻非组织相比，在HCC组织中总共有3,592个lncRNA和113个snoRNA失调（图1aB和C）。
美国癌症基因组图谱TCGA大数据分析发现10-20%的肝癌样本中Hippo信号通路中的激酶发生缺失，10%的肝癌样本中Hippo下游的原癌基因YAP所在染色体片段发生扩增，因此该通路异常与肝癌发生密切相关。在这项研究中，周大旺研究组通过对Hippo信号通路...
方法:本工作以取自TCGA数据库的肝癌基因,miRNA,DNA化和拷贝数等表达谱的数据为研究对象,采用以下方法进行了相关研究:第一,应用WGCNA(WeightedGeneCoexpressionNetworkAnalysis),即加权基因共表达网络的方法,对肝癌基因和miRNA的数据进行共表达网络的分析,寻找与TNM...
目的基于生物信息学探讨肝细胞癌（肝癌）发生相关基因及其功能。方法从公共基因数据库GEO筛选并下载肝癌组织及癌旁组织基因芯片,通过GEO2R在线工具和Venn图网站筛选出差异表达基因（DEGs）。对筛选出来的DEGs在DID网站进行基因...
中国肝癌发病当前状况与趋势分析解析.pdf,中华杂志2015年9月第37卷第9期ChinJOncol，September2015，Vol．37，No．9·691··预防研究·中国肝癌发病状况与趋势分析左婷婷郑荣寿曾红梅张思维陈万青【摘要】目的通过对中国登记地区人群肝癌发病数据进行分析，了解中国肝癌的发病现状和...
基因组图谱(TCGA)计划利用大规模测序为主的基因组分析技术，通过广泛的合作，理解癌症的分子机制，本研究利用TCGA数据库深入挖掘肝癌发生关键基因。.材料方法：根据标准流程对TCGA数据进行处理、整合，对数据类型及水平进行评估，用R语言(3.1.1版本...
肝内转移和多中心发生的多结节肝癌蛋白质表达谱的差异分析及差异蛋白的表达验证,肝内转移,多中心,电泳,质谱,蛋白。肝细胞肝癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)是严重影响人类健康的恶性之一,在肝癌的…
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基于以上发现,本实验将聚焦于肝癌中差异表达的糖链相关基因,运用机器学习和加权基因共表达网络（WGCNA,WeightedCorrelationNetworkAnalysis）网络进行分析,旨在找到在癌症的发生和发展中发挥着重要作用的糖链相关基因,及与其协同变化的其它基因,从更
我国肝癌的主要病因为乙型肝炎病毒(HBV)感染,但其发生发展的分子机制尚未完全清楚。Notch信号是一个在进化中高度保守的反映细胞间通讯机制的通路,它调控细胞的分化和增殖,在胚胎发育和细胞命运的决定中发挥重要的作用。
此外，分析了癌症基因组图谱（TCGA）肝细胞癌（LIHC）数据存储库，以进一步研究这些候选lncRNA和snoRNA在肝癌发生中的作用。与相邻非组织相比，在HCC组织中总共有3,592个lncRNA和113个snoRNA失调（图1aB和C）。
美国癌症基因组图谱TCGA大数据分析发现10-20%的肝癌样本中Hippo信号通路中的激酶发生缺失，10%的肝癌样本中Hippo下游的原癌基因YAP所在染色体片段发生扩增，因此该通路异常与肝癌发生密切相关。在这项研究中，周大旺研究组通过对Hippo信号通路...
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