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bindingdock结合亲和力分子对接人们常用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。然而预测值对化合物活性排序非常不准。本文的主要目的…
该文献影响因子4.6，是典型的“实验+计算”模式，比较接近大多数科研人员的研究现状，只要熟悉这种模式，稍加努力即可发表同等水平的论文。【研究背景】文献作者通过细胞MTT试验从8000多个小分子中发现了一个新型的抗流感病毒化合物D715…
在本论文中,我们首先系统评估了主流分子对接程序在不同类型靶标上的性能,然后针对这些对接程序存在的不足提出了改进的方法和策略,最后将所发展的方法应用于实际虚拟筛选项目并获得成功。.本论文主要研究内容及结果如下:(1)系统评估了包括AutoDock...
一、研究路线研究路线见图1。通过脑组织代谢组学分析HSYA抗TBI的机制(第1部分)，通过网络药理学提取Hub基因(第2部分)，根据第1部分和第2部分鉴定关键代谢产物和靶点并进行关联。通过分子对接(第三部分)进一步验证关键靶点。
基于网络药理学与分子对接技术的金花清感颗粒防治新型冠状病毒肺炎的潜在药效物质研究作者：龚普阳、顾健2019年12月以来，中国湖北省武汉地区发现新型冠状病毒感染的肺炎，
1.网络药理学的发展历程和研究思路.2.分析网络药理学SCI论文3篇，解析数据分析要点和论文写作模式.（二）网络药理学数据获取.1.中药有效成分以及对应靶点的查找和获取、对比药物及其靶点的获取（上机实践）。介绍分子对接方法、化学相似性方法以及...
生物分子互作基础1.生物分子互作用研究方法1.1蛋白-小分子、蛋白-蛋白相互作用原理1.2分子对接研究生物分子相互作用1.3蛋白蛋白对接研究分子相互作用蛋白数据库1.PDB数据库介绍1.1PDB蛋白数据库功能1.2PDB蛋白数据可获取资源1.3PDB蛋白数据库对药物研发的重要性2.PDB数据库的使用2.1靶点...
确定对接分子之间的结合强度和最佳的结合位置是分子对接所面临的重要问题,评价函数和构象搜索是分子对接的两个重要研究领域。由于配体和受体分子可以自由的旋转和移动,同时,两个分子构象也在改变,使得可能存在大量的结合模式,无法利用简单的搜索方法来完成这个艰巨的任务,必须引入其他...
本论文采用比较分子力场分析法(CoMFA)、比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)、分子对接和分子动力学模拟等计算方法,对最新发表具有良好抗癌活性的三个系列化合物进行三维定量构效关系(3D-QSAR)和作用机理的理论研究。.基于计算,建立了具有良好统计质量和...
王存新,许先进.基于分子对接的反向虚拟筛选方法[J].北京工业大学学报,2019,45(11):1164-1172.
bindingdock结合亲和力分子对接人们常用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。然而预测值对化合物活性排序非常不准。本文的主要目的…
该文献影响因子4.6，是典型的“实验+计算”模式，比较接近大多数科研人员的研究现状，只要熟悉这种模式，稍加努力即可发表同等水平的论文。【研究背景】文献作者通过细胞MTT试验从8000多个小分子中发现了一个新型的抗流感病毒化合物D715…
在本论文中,我们首先系统评估了主流分子对接程序在不同类型靶标上的性能,然后针对这些对接程序存在的不足提出了改进的方法和策略,最后将所发展的方法应用于实际虚拟筛选项目并获得成功。.本论文主要研究内容及结果如下:(1)系统评估了包括AutoDock...
一、研究路线研究路线见图1。通过脑组织代谢组学分析HSYA抗TBI的机制(第1部分)，通过网络药理学提取Hub基因(第2部分)，根据第1部分和第2部分鉴定关键代谢产物和靶点并进行关联。通过分子对接(第三部分)进一步验证关键靶点。
基于网络药理学与分子对接技术的金花清感颗粒防治新型冠状病毒肺炎的潜在药效物质研究作者：龚普阳、顾健2019年12月以来，中国湖北省武汉地区发现新型冠状病毒感染的肺炎，
1.网络药理学的发展历程和研究思路.2.分析网络药理学SCI论文3篇，解析数据分析要点和论文写作模式.（二）网络药理学数据获取.1.中药有效成分以及对应靶点的查找和获取、对比药物及其靶点的获取（上机实践）。介绍分子对接方法、化学相似性方法以及...
生物分子互作基础1.生物分子互作用研究方法1.1蛋白-小分子、蛋白-蛋白相互作用原理1.2分子对接研究生物分子相互作用1.3蛋白蛋白对接研究分子相互作用蛋白数据库1.PDB数据库介绍1.1PDB蛋白数据库功能1.2PDB蛋白数据可获取资源1.3PDB蛋白数据库对药物研发的重要性2.PDB数据库的使用2.1靶点...
确定对接分子之间的结合强度和最佳的结合位置是分子对接所面临的重要问题,评价函数和构象搜索是分子对接的两个重要研究领域。由于配体和受体分子可以自由的旋转和移动,同时,两个分子构象也在改变,使得可能存在大量的结合模式,无法利用简单的搜索方法来完成这个艰巨的任务,必须引入其他...
本论文采用比较分子力场分析法(CoMFA)、比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)、分子对接和分子动力学模拟等计算方法,对最新发表具有良好抗癌活性的三个系列化合物进行三维定量构效关系(3D-QSAR)和作用机理的理论研究。.基于计算,建立了具有良好统计质量和...
王存新,许先进.基于分子对接的反向虚拟筛选方法[J].北京工业大学学报,2019,45(11):1164-1172.
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