分子动力学模拟的计算及应用所谓分子动力学模拟是利用计算机技术来模拟或已有的理论知识,进一步来分析微观方面分子或原子的运动。随着人们对牛顿力学的不断研究,进一步从原子物理和统计物理的角度来从微观方面分析宏观的问题。目前所具有的配置
分子动力学模拟氨基酸序列对胶原蛋白热稳定性的影响四川大学制革清洁技术国家工程实验室,成都(610064)E-mail:zhangwh@scu.edu要:采用分子动力学模拟方法,研究了氨基酸序列对胶原蛋白热稳定性的影响。.胶原模型多肽初始结构取自PDB数据库(编号:2cuo...
(毕业设计论文)《P53蛋白与DN段的分子动力学模拟研究》.doc,编号:审定成绩:重庆邮电大学毕业设计(论文)设计(论文)题目:P53蛋白与DN段的分子动力学模拟研究学院名称:生物信息学院学生姓名:专业:生物信息学...
蛋白质结构和动力学的分子动力学模拟.pdf,中文摘要蛋白质是生命活动的基本功能单元,蛋白质具有柔性,存在许多不同的结构状态,蛋白质的多种构象态构成了蛋白质的构象空间,蛋白质很多生理功能的发挥是通过结构转换实现的。分子动力学方法是一种常用的研究蛋白质结构的方法,其既能...
分子动力学是一个交叉学科,需要掌握很多内容,下面大致整理了一些。.力场:任何计算都要用到,所以最好能够熟悉一些常见的力场模型;.系综:这个东西可以说很复杂,需要学习统计力学,如果掌握对于计算过程会理解更透彻。.bash:如果能编写一些简单...
2分子动力学简介52.1概述52.2边界条件72.3能量最小化82.4系综82.5原子结构识别82.6原子间作用势92.5弛豫103模拟方法113.1Meyer-Entel势的测定113.2升/降温温度循环下纯铁的奥氏体-马氏体相变研究133.3模拟脚本实例144模拟结果
各位同学,我最近刚接触MDS,有几个问题一直没搞清(1)是应该先空载蛋白进行分子动力学模拟优化好蛋白后对接一个配体再进行分子动力学模拟呢,还是直接把分子对接到蛋白上直接做分子动力学?(该蛋白的pdb文件可以下载)(2)如果对接位点是根据有关文献推测而不是通过软件搜索的,在写...
分子动力学模拟论坛.已有8290次阅读2017-3-2216:50|系统分类:科研笔记|动力学.分子模拟论坛(又称模拟小窝,计算模拟论坛).旨在传播分子模拟的知识和技能、学习经验等;讨论分子动力学,量子化学等模拟方法以及高性能并行计算技术在计算物理、计算...
1刘鸿;张静;吕中元;;耦合化学反应的聚合物体系介观动力学模拟研究[A];2011年全国高分子学术论文报告会论文摘要集[C];2011年2王伯春;刘宝林;李代禧;余德洋;;不同条件下水玻璃化过程的模拟[A];第六届全国低温生物医学及器械学术大会论文集[C];2009年3刘国栋...
1分子动力学模拟1.1模型建立为了使研究具有普遍性和可对比性,选择国内外广泛研究的Wyoming蒙脱土作为研究对象‘14】。典型的Wyoming蒙脱土结构属于单斜晶系,C2/m空间群,对称型为L2PC,晶格参数为庐5.23A,69.06间...
分子动力学模拟的计算及应用所谓分子动力学模拟是利用计算机技术来模拟或已有的理论知识,进一步来分析微观方面分子或原子的运动。随着人们对牛顿力学的不断研究,进一步从原子物理和统计物理的角度来从微观方面分析宏观的问题。目前所具有的配置
分子动力学模拟氨基酸序列对胶原蛋白热稳定性的影响四川大学制革清洁技术国家工程实验室,成都(610064)E-mail:zhangwh@scu.edu要:采用分子动力学模拟方法,研究了氨基酸序列对胶原蛋白热稳定性的影响。.胶原模型多肽初始结构取自PDB数据库(编号:2cuo...
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蛋白质结构和动力学的分子动力学模拟.pdf,中文摘要蛋白质是生命活动的基本功能单元,蛋白质具有柔性,存在许多不同的结构状态,蛋白质的多种构象态构成了蛋白质的构象空间,蛋白质很多生理功能的发挥是通过结构转换实现的。分子动力学方法是一种常用的研究蛋白质结构的方法,其既能...
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2分子动力学简介52.1概述52.2边界条件72.3能量最小化82.4系综82.5原子结构识别82.6原子间作用势92.5弛豫103模拟方法113.1Meyer-Entel势的测定113.2升/降温温度循环下纯铁的奥氏体-马氏体相变研究133.3模拟脚本实例144模拟结果
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1刘鸿;张静;吕中元;;耦合化学反应的聚合物体系介观动力学模拟研究[A];2011年全国高分子学术论文报告会论文摘要集[C];2011年2王伯春;刘宝林;李代禧;余德洋;;不同条件下水玻璃化过程的模拟[A];第六届全国低温生物医学及器械学术大会论文集[C];2009年3刘国栋...
1分子动力学模拟1.1模型建立为了使研究具有普遍性和可对比性,选择国内外广泛研究的Wyoming蒙脱土作为研究对象‘14】。典型的Wyoming蒙脱土结构属于单斜晶系,C2/m空间群,对称型为L2PC,晶格参数为庐5.23A,69.06间...