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分子动力学模拟的计算及应用所谓分子动力学模拟是利用计算机技术来模拟或已有的理论知识，进一步来分析微观方面分子或原子的运动。随着人们对牛顿力学的不断研究，进一步从原子物理和统计物理的角度来从微观方面分析宏观的问题。目前所具有的配置
1．4论文组织结构本论文分为五章，各章的内容安排如下：第一章绪论。介绍了本文的研究背景及主要工作，以及分子动力学模拟计算、高性能计算中并行计算技术的发展情况。第二章并行计算技术和分子动力学模拟的基础。本章内容是本文的主要理论依据。
图1使用分子动力学模拟发表的SCI论文数分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算...
分子动力学是一个交叉学科，需要掌握很多内容，下面大致整理了一些。.力场：任何计算都要用到，所以最好能够熟悉一些常见的力场模型；.系综：这个东西可以说很复杂，需要学习统计力学，如果掌握对于计算过程会理解更透彻。.bash：如果能编写一些简单...
分子动力学模拟心得适合新手1.看完《分子模拟从算法到应用》那本书的第四章，不用全看完，但是至少要对分子动力学模拟过程有一个了解。2.试着按照书的过程做个Ar的NVE，其实Ar和离子晶体以及其它的任何材料的差别仅仅是势函数的问题，虽然由势函数带来了一些问题，但是这些都不是本质...
第三章分子动力学基础与分子动力学模拟讲解.ppt,3.1分子动力学的基本原理及特点分子动力学模拟的基本原理：建立一个粒子系统来模拟所研究的微观现象，系统中各粒子之间的相互作用根据量子力学来确定。对符合经典牛顿力学规律的大量粒子系统，通过粒子动力学方程组的数值求解，决定各...
要:采用分子动力学模拟方法，本论文对铁-碳合金中不同碳浓度下的奥氏体-马氏体相变进行了研究.我们首先对用于描述铁原子间相互作用的MEYER-ENTEL势进行了测试，通过对晶格常数、原子间结合能、体量等材料基本特性进行了测试并与理论值进行了对比。
2分子动力学简介52.1概述52.2边界条件72.3能量最小化82.4系综82.5原子结构识别82.6原子间作用势92.5弛豫103模拟方法113.1Meyer-Entel势的测定113.2升/降温温度循环下纯铁的奥氏体-马氏体相变研究133.3模拟脚本实例144模拟结果
它是对理论计算和实验的有力补充。主要优点：动态的研究方法、丰富的分析手段、可与分子对接、药效团等分子模拟方法无缝结合等。中大唯信分子动力学模拟报告中的示意图举例（研究某结构的构象转变过程）【分子动力学模拟的研究内容】自组装模拟
GROMACS分子动力学模拟计算.分子动力学模拟软件GROMACS的应用广泛、功能强大、用户友好，能够满足几乎所有常见的原子体系模拟需要，而且免费开源。采用GROMACS进行分子动力学计算分析从而指导进一步的实验工作，预测理论结果。不论你从事计算化学，生物...
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1．4论文组织结构本论文分为五章，各章的内容安排如下：第一章绪论。介绍了本文的研究背景及主要工作，以及分子动力学模拟计算、高性能计算中并行计算技术的发展情况。第二章并行计算技术和分子动力学模拟的基础。本章内容是本文的主要理论依据。
图1使用分子动力学模拟发表的SCI论文数分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算...
分子动力学是一个交叉学科，需要掌握很多内容，下面大致整理了一些。.力场：任何计算都要用到，所以最好能够熟悉一些常见的力场模型；.系综：这个东西可以说很复杂，需要学习统计力学，如果掌握对于计算过程会理解更透彻。.bash：如果能编写一些简单...
分子动力学模拟心得适合新手1.看完《分子模拟从算法到应用》那本书的第四章，不用全看完，但是至少要对分子动力学模拟过程有一个了解。2.试着按照书的过程做个Ar的NVE，其实Ar和离子晶体以及其它的任何材料的差别仅仅是势函数的问题，虽然由势函数带来了一些问题，但是这些都不是本质...
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要:采用分子动力学模拟方法，本论文对铁-碳合金中不同碳浓度下的奥氏体-马氏体相变进行了研究.我们首先对用于描述铁原子间相互作用的MEYER-ENTEL势进行了测试，通过对晶格常数、原子间结合能、体量等材料基本特性进行了测试并与理论值进行了对比。
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