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复旦大学硕士学位论文分子动力学模拟在某些金属蛋白的结构、性质和功能研究中的应用姓名：倪锋云申请学位级别：硕士专业：无机化学指导教师：黄仲贤20070520论文独创性声明本论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。
我们采用分子动力学模拟研个非肽小分子抑制剂和MDM2蛋白的结合。MM-PBSA方法计算的绝对结合自由能与实验确定的非常一致。研究表明，范德华能量是结合抑制剂的最大的结合能成分，这表明对这些抑制剂结合MDM2蛋白主要是形状的互补。
分子动力学模拟是一种研究分子体系结构与性质的重要方法，已被广泛用于化学化工、生物医药、材料科学与工程等学科领域。计算机模拟的方法省时省力，可以用来求解解析理论无法求解的问题，模拟实验做起来困难或不可…
分子动力学软件入门主要有：理论和基础入门、软件入门、分析入门等，在基础部分主要由编程知识入门组成，希望各位在学习的过程中一定要完全履行上述入门顺序，完成最终学习。有问题可以在弹幕上发送，以后有机会的话我就开，谢谢大家…
蛋白质结构和动力学的分子动力学模拟.pdf,中文摘要蛋白质是生命活动的基本功能单元，蛋白质具有柔性，存在许多不同的结构状态，蛋白质的多种构象态构成了蛋白质的构象空间，蛋白质很多生理功能的发挥是通过结构转换实现的。分子动力学方法是一种常用的研究蛋白质结构的方法，其既能...
粗粒度分子动力学—从力场的开发到应用ForceFieldDevelopmentandApplicationofCoarseGrainedMolecularDynamics...本论文不包含其他人已经发表或撰写的研究成果，也不包含本人或他人为获得中国石油大学（华东）或其它教育机构的学位或学历...
8月18日，浙江理工大学以第一署名单位在国际顶级期刊《Nature》正刊发表了在表面高分子链微观动力学机制上取得的重要研究成果。7月28日，浙江理工大学生命科学与医药学院叶飞副教授以共同第一作者（排名第二）在《Nature》发表研究论文...
发色团的颜色状态对可逆光开关的微妙影响，并指出绿色和红色mEos4b中光开关状态的高度动态特性。本文的工作破译了在绿色mEos4b中起作用的主要开关机制。如本文所提出的，发色团和周围蛋白质残基之间的氢键模式在控制光开关中的关键重要…
分子动力学模拟分子体系的运动进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质。看它源代码是对应的的是什么，如果是基于第一性原理的那就是ab-initioMD（当然鉴于计算机能力，上千原子的还很难实施，这个也就走个形式）,还有基于力场，经验参数等等叫法都是不一样的，分子模拟板块应该有不少...
虽然近年来分子动力学领域涌现了一些其他的基于机器学习的模拟方法，但获奖论文的作者表示，他们的研究首次在保持「从头算」精度的前提下...
复旦大学硕士学位论文分子动力学模拟在某些金属蛋白的结构、性质和功能研究中的应用姓名：倪锋云申请学位级别：硕士专业：无机化学指导教师：黄仲贤20070520论文独创性声明本论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。
我们采用分子动力学模拟研个非肽小分子抑制剂和MDM2蛋白的结合。MM-PBSA方法计算的绝对结合自由能与实验确定的非常一致。研究表明，范德华能量是结合抑制剂的最大的结合能成分，这表明对这些抑制剂结合MDM2蛋白主要是形状的互补。
分子动力学模拟是一种研究分子体系结构与性质的重要方法，已被广泛用于化学化工、生物医药、材料科学与工程等学科领域。计算机模拟的方法省时省力，可以用来求解解析理论无法求解的问题，模拟实验做起来困难或不可…
分子动力学软件入门主要有：理论和基础入门、软件入门、分析入门等，在基础部分主要由编程知识入门组成，希望各位在学习的过程中一定要完全履行上述入门顺序，完成最终学习。有问题可以在弹幕上发送，以后有机会的话我就开，谢谢大家…
蛋白质结构和动力学的分子动力学模拟.pdf,中文摘要蛋白质是生命活动的基本功能单元，蛋白质具有柔性，存在许多不同的结构状态，蛋白质的多种构象态构成了蛋白质的构象空间，蛋白质很多生理功能的发挥是通过结构转换实现的。分子动力学方法是一种常用的研究蛋白质结构的方法，其既能...
粗粒度分子动力学—从力场的开发到应用ForceFieldDevelopmentandApplicationofCoarseGrainedMolecularDynamics...本论文不包含其他人已经发表或撰写的研究成果，也不包含本人或他人为获得中国石油大学（华东）或其它教育机构的学位或学历...
8月18日，浙江理工大学以第一署名单位在国际顶级期刊《Nature》正刊发表了在表面高分子链微观动力学机制上取得的重要研究成果。7月28日，浙江理工大学生命科学与医药学院叶飞副教授以共同第一作者（排名第二）在《Nature》发表研究论文...
发色团的颜色状态对可逆光开关的微妙影响，并指出绿色和红色mEos4b中光开关状态的高度动态特性。本文的工作破译了在绿色mEos4b中起作用的主要开关机制。如本文所提出的，发色团和周围蛋白质残基之间的氢键模式在控制光开关中的关键重要…
分子动力学模拟分子体系的运动进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质。看它源代码是对应的的是什么，如果是基于第一性原理的那就是ab-initioMD（当然鉴于计算机能力，上千原子的还很难实施，这个也就走个形式）,还有基于力场，经验参数等等叫法都是不一样的，分子模拟板块应该有不少...
虽然近年来分子动力学领域涌现了一些其他的基于机器学习的模拟方法，但获奖论文的作者表示，他们的研究首次在保持「从头算」精度的前提下...
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