1、研究背景RNA结合蛋白(RNABindingProtein,RBP)在转录后的剪接、修饰、转运、细胞定位、稳定性、翻译和降解等RNA代谢过程中发挥着重要的调控功能,但近来对RNA可交联蛋白质的观察揭示了大量的经典和非经典RBP。目前已知一些...
植物RNA结合蛋白的研究进展中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,湖北武汉430072;中国科学院研究生院,北京100049)摘要从RNA结合蛋白的鉴定方法,RNA结合蛋白的基序,以及植物RNA结合蛋白在调控叶绿素mRNA的稳定和转录、植物抗逆反应...
本方法对DNA结合蛋白模型的分类准确率达到0.940,马修斯相关系数(MCC)等于0.881,优于已报道的文献和方法。最后,我们将该方法用于RNA结合蛋白体系,进一步分析并总结RNA结合蛋白与DNA结合蛋白的异同。本文中,我们开发了一种全新的基于序列预测DNA
RNA结合蛋白参与转录后调控的计算分析.杨禹丞.【摘要】:在真核细胞内,转录组与转录后调控有着密切的关联:转录本RNA从产生直至降解的过程中,总是被RNA结合蛋白(RBP)和其他RNA分子结合,这些调控因子参与几乎所有的转录后调控事件,包括RNA分子的剪接、加尾...
RNA结合蛋白思路发7分+生信文章,不香么?大家好!今天跟大家分享的文献是2021年4月发表在MolecularTherapy:NucleicAcid(IF=7.032)杂志上的一篇文章。
RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)技术(一)1.microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。.miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptionalcontrol)中重要的调控...
生科领域的新数据库:一幅RNA和蛋白质水平上的单细胞类型人体组织图.分子谱分析的进步开辟了绘制人体细胞、组织和器官中基因表达图谱的可能性。.在未来,人类基因表达图谱极有可能成为研究人类生物学和疾病的基础。.来自KTH皇家理工学院(KTHRoyal...
20世纪40年代初,人们就知道除了脱氧核糖核酸(DNA)之外,还有另一种核酸,核糖核酸(RNA)。在明确DNA含有基本的遗传信息后,人们在很长一段时间内对于遗传信息的表达方式仍旧一无所知。到了20世纪60年代,蛋白…
2021-04-09分类:数据库使用指南阅读(1440)收藏我们拿到一个lncRNA,想继续往下做时,一般都会想到从它的RNA结合蛋白(RBP)入手。因为RBP在多种细胞过程中起着最基本的作用,包括转录、RNA剪接和、定位、稳定性及翻译等。那么今天小编就...
AbstractDNA结合蛋白在真核和原核蛋白质组的选择性剪接,RNA编辑,化和许多其他生物学功能中发挥关键作用。从一级氨基酸序列预测这些蛋白质的功能正成为基因组功能注释的主要挑战之一。传统的预测方法通常致力于从序列中提取生理化学特征,但忽略图案之间的基序信息和位置信息。
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20世纪40年代初,人们就知道除了脱氧核糖核酸(DNA)之外,还有另一种核酸,核糖核酸(RNA)。在明确DNA含有基本的遗传信息后,人们在很长一段时间内对于遗传信息的表达方式仍旧一无所知。到了20世纪60年代,蛋白…
2021-04-09分类:数据库使用指南阅读(1440)收藏我们拿到一个lncRNA,想继续往下做时,一般都会想到从它的RNA结合蛋白(RBP)入手。因为RBP在多种细胞过程中起着最基本的作用,包括转录、RNA剪接和、定位、稳定性及翻译等。那么今天小编就...
AbstractDNA结合蛋白在真核和原核蛋白质组的选择性剪接,RNA编辑,化和许多其他生物学功能中发挥关键作用。从一级氨基酸序列预测这些蛋白质的功能正成为基因组功能注释的主要挑战之一。传统的预测方法通常致力于从序列中提取生理化学特征,但忽略图案之间的基序信息和位置信息。