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【摘要】：多序列比对是生物信息学中至关重要的一步。传统的序列比对的方法是NP难问题。目前的算法都是以牺牲某种程度的精度为代价,达到可实用的速度。由于现有的蛋白质多序列比对算法难以兼顾速度和精度,因而在基于氨基酸多序列比对算法的蛋白质进化演化研究中,也不可避免的存在着计算...
多序列列线可被视为诱变遗传学试验中的自然突变状况，其对序列上单一位点变异的分析的确提供了该位点在蛋白质三级结构中的信息；二是神经网络已开始被用于根据序列预测结构。.目前已有这样一个共识，即在有大量、高质量的多序列列线结果的情况下...
本文的主要内容如下：在第一章，根据DNA序列中四种核苷酸A、G、C和T的大连理工大学博士学位论文tDNA序列及蛋白质序列的分析与比较化学结构分类，提出DNA序列的特征序列的概念．利用特征序列中每种（o，i）三元组出现的频率，构造出一种压缩矩阵...
【陪你学·生信】九、多序列比对-MultipleSequenceAlignment（MSA）一、多序列比对能干嘛？下面是多序列比对的主要应用：1.推测——Extrapolation可以推测一条未知的aa序列属于某个已知的蛋白质家族或者拥有相似蛋白质结构域甚至相似的蛋白
中国农业大学博士学位论文生物信息学中的序列比对算法研究姓名：唐玉荣申请学位级别：博士专业：农业电气化与自动化指导教师：汪懋华20040601中国农业大学博士学位论文摘要摘要序列比对是生物信息学中一种基本的信息处理方法，对于发现核酸和蛋白质序列上的功能、结构和进化的...
多序列比对及蛋白质功能及结构预测.关键词：多序列比对蛋白质.如果序列重叠群(contig)包含有蛋白质编码区，则接下来的分析任务是确定表达产物–蛋白质的功能。.蛋白质的许多特性可直接从序列上分析获得，如疏水性，它可以用于预测序列是否跨膜螺旋...
博士毕业论文—《基于隐马尔可夫模型的蛋白质多序列比对方法研究》摘要第1-6页ABSTRACT第6-15页第1章绪论第15-35页1.1课题背景及研究的目的和意义
对于蛋白序列，BLAT是用来设计寻找80%及以上相似至少20个氨基酸的序列。相比于BLAST，BLAT比对更简单方便，速度更快，还可以输出更为易读的比对结果，可以很容易的找到exons和introns。BLAT也同样可以处理DNA，RNA和蛋白质序列的比对。
如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPriptFirstrelease：2017-12-16Lastupdate:2018-03-17大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图，现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享，希望对大家的科研工作有所帮助，效果图如下：
打开页面，上面有全局比对工具、局部比对工具、还有基因组比对工具。首先看全局比对中的蛋白质序列比对工具（图2.31）。输入值非常简单，把要比较的两条蛋白质序列贴在输入框里或者上传。如果想要进一步设置比对的参数，可以点Moreoptions。
【摘要】：多序列比对是生物信息学中至关重要的一步。传统的序列比对的方法是NP难问题。目前的算法都是以牺牲某种程度的精度为代价,达到可实用的速度。由于现有的蛋白质多序列比对算法难以兼顾速度和精度,因而在基于氨基酸多序列比对算法的蛋白质进化演化研究中,也不可避免的存在着计算...
多序列列线可被视为诱变遗传学试验中的自然突变状况，其对序列上单一位点变异的分析的确提供了该位点在蛋白质三级结构中的信息；二是神经网络已开始被用于根据序列预测结构。.目前已有这样一个共识，即在有大量、高质量的多序列列线结果的情况下...
本文的主要内容如下：在第一章，根据DNA序列中四种核苷酸A、G、C和T的大连理工大学博士学位论文tDNA序列及蛋白质序列的分析与比较化学结构分类，提出DNA序列的特征序列的概念．利用特征序列中每种（o，i）三元组出现的频率，构造出一种压缩矩阵...
【陪你学·生信】九、多序列比对-MultipleSequenceAlignment（MSA）一、多序列比对能干嘛？下面是多序列比对的主要应用：1.推测——Extrapolation可以推测一条未知的aa序列属于某个已知的蛋白质家族或者拥有相似蛋白质结构域甚至相似的蛋白
中国农业大学博士学位论文生物信息学中的序列比对算法研究姓名：唐玉荣申请学位级别：博士专业：农业电气化与自动化指导教师：汪懋华20040601中国农业大学博士学位论文摘要摘要序列比对是生物信息学中一种基本的信息处理方法，对于发现核酸和蛋白质序列上的功能、结构和进化的...
多序列比对及蛋白质功能及结构预测.关键词：多序列比对蛋白质.如果序列重叠群(contig)包含有蛋白质编码区，则接下来的分析任务是确定表达产物–蛋白质的功能。.蛋白质的许多特性可直接从序列上分析获得，如疏水性，它可以用于预测序列是否跨膜螺旋...
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对于蛋白序列，BLAT是用来设计寻找80%及以上相似至少20个氨基酸的序列。相比于BLAST，BLAT比对更简单方便，速度更快，还可以输出更为易读的比对结果，可以很容易的找到exons和introns。BLAT也同样可以处理DNA，RNA和蛋白质序列的比对。
如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPriptFirstrelease：2017-12-16Lastupdate:2018-03-17大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图，现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享，希望对大家的科研工作有所帮助，效果图如下：
打开页面，上面有全局比对工具、局部比对工具、还有基因组比对工具。首先看全局比对中的蛋白质序列比对工具（图2.31）。输入值非常简单，把要比较的两条蛋白质序列贴在输入框里或者上传。如果想要进一步设置比对的参数，可以点Moreoptions。
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