今天跟大家介绍两个数据库:NCBI和uniprot。一般在想要了解某个蛋白信息的时候都是从这两个数据库开始查找。NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation,美国国家生物技术信息中心)不用多说,光名字就…
一、应用场景需要表达某物种的特定蛋白或基因二、序列获取方法:1.打开NCBI网站(https://ncbi.nlm.nih.gov)2.点击下图红色箭头指示的下拉框3.找到下图所示的“Gene”4.选中“Gene”,在右边的搜索…
上面有各种物种(包括植物)的蛋白详细信息,包括序列,结构,功能介绍,详细的annotation和分类,甚至列了很多相关publication参考文献(当然很多时候不全,需要另外查询,但可以参考,有一些列出来的文献自己找还未必能找到),最后还有一个protein
2011-04-20怎样在NCBI上搜索基因序列或者是蛋白质序列?102015-02-16怎样用blast找到蛋白的相关文献12014-08-22请问,已知蛋白序列的GI号,怎样在NCBI中查找对应蛋白的序...52013-12-02如何在Genbank上查找某一生物表达特定蛋白的一段基因序列12...
以CD28蛋白序列为例(uniprot有序列),打开CBS-SignalP,fasta格式输入:结果显示,该序列含有信号肽,且切割位置位于18-19位氨基酸—意味着信号肽位于1-18位,与前面查询结果完全一致;含有信号肽意味着序列可能是分泌蛋白,也可能是I型跨膜蛋白,下面再分析下跨膜区同样以fasta格式预测CBS-TMHMM...
蛋白序列模糊查找工具.-SMS2南京德泰生物镜像.蛋白序列模糊查找工具按照类似BLAST的方法在目标序列中搜索相似的子串,并按照相似度从高到低返回相似子串。.输入原始序列或者FASTA格式序列,长度限定在2000以内。.输入需要模糊查找的子串,长度限定在30...
NCBI里有蛋白序列就肯定可以查到对应的基因序列.例子如下:.myosincrossreactiveantigen[Bifidobacteriumbreve]GenBank:ADY18551.1.在NCBI的页面里,可以看到以下内容:.LOCUSADY18551625aalinearBCT05-MAR-2011.DEFINITIONmyosincrossreactiveantigen,partial[Bifidobacteriumbreve].ACCESSIONADY18551.
2016-10-07求大神指教蛋白质的氨基酸序列怎么排序啊!82008-12-13请教:怎么用NCBI查询新城疫病毒F基因的蛋白质序列、氨基酸...212019-04-04如何确定参与参与蛋白质相互作用的氨基酸序列2016-09-27如何从蛋白质的氨基酸序列计算其分子式2...
为此,本实验以细胞色素c的蛋白质序列为实验对象,以计算机为平台,以DNAstar、SeqVerter、Cn3D、RasMol等当前分子生物学研究软件为工具。.通过本实验弄清楚了蛋白质的结构,这对进而理解其结构与功能的关系以及空间结构具有重要意义。.并通过本实验研究...
如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列运用STS查找已经公布的引物序列如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性今天我们就先讲第一部分:如何查找基因序列、mRNA、Promoter。这里主要用到的是Mapviewer,我们以人的IL6(白细胞介素6...
今天跟大家介绍两个数据库:NCBI和uniprot。一般在想要了解某个蛋白信息的时候都是从这两个数据库开始查找。NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation,美国国家生物技术信息中心)不用多说,光名字就…
一、应用场景需要表达某物种的特定蛋白或基因二、序列获取方法:1.打开NCBI网站(https://ncbi.nlm.nih.gov)2.点击下图红色箭头指示的下拉框3.找到下图所示的“Gene”4.选中“Gene”,在右边的搜索…
上面有各种物种(包括植物)的蛋白详细信息,包括序列,结构,功能介绍,详细的annotation和分类,甚至列了很多相关publication参考文献(当然很多时候不全,需要另外查询,但可以参考,有一些列出来的文献自己找还未必能找到),最后还有一个protein
2011-04-20怎样在NCBI上搜索基因序列或者是蛋白质序列?102015-02-16怎样用blast找到蛋白的相关文献12014-08-22请问,已知蛋白序列的GI号,怎样在NCBI中查找对应蛋白的序...52013-12-02如何在Genbank上查找某一生物表达特定蛋白的一段基因序列12...
以CD28蛋白序列为例(uniprot有序列),打开CBS-SignalP,fasta格式输入:结果显示,该序列含有信号肽,且切割位置位于18-19位氨基酸—意味着信号肽位于1-18位,与前面查询结果完全一致;含有信号肽意味着序列可能是分泌蛋白,也可能是I型跨膜蛋白,下面再分析下跨膜区同样以fasta格式预测CBS-TMHMM...
蛋白序列模糊查找工具.-SMS2南京德泰生物镜像.蛋白序列模糊查找工具按照类似BLAST的方法在目标序列中搜索相似的子串,并按照相似度从高到低返回相似子串。.输入原始序列或者FASTA格式序列,长度限定在2000以内。.输入需要模糊查找的子串,长度限定在30...
NCBI里有蛋白序列就肯定可以查到对应的基因序列.例子如下:.myosincrossreactiveantigen[Bifidobacteriumbreve]GenBank:ADY18551.1.在NCBI的页面里,可以看到以下内容:.LOCUSADY18551625aalinearBCT05-MAR-2011.DEFINITIONmyosincrossreactiveantigen,partial[Bifidobacteriumbreve].ACCESSIONADY18551.
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为此,本实验以细胞色素c的蛋白质序列为实验对象,以计算机为平台,以DNAstar、SeqVerter、Cn3D、RasMol等当前分子生物学研究软件为工具。.通过本实验弄清楚了蛋白质的结构,这对进而理解其结构与功能的关系以及空间结构具有重要意义。.并通过本实验研究...
如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列运用STS查找已经公布的引物序列如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性今天我们就先讲第一部分:如何查找基因序列、mRNA、Promoter。这里主要用到的是Mapviewer,我们以人的IL6(白细胞介素6...