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计算机辅助抗癌药物设计和蛋白同源建模研究.【摘要】：传统的药物设计方法耗时耗力,具有一定的随机性和盲目性,缺乏应有的合理性。.随着自动化平台、计算化学、以及生物学的快速发展,基于计算机辅助的药物设计已逐渐成为重要的技术手段之一。.本学位...
【摘要】：蛋白质大分子的三维结构决定了蛋白质的功能与性质,蛋白质结构预测在医学、药物学、生物学等研究中均具有重要的意义。同源建模法是目前唯一在实际中应用的蛋白质分子结构的预测方法。研究表明,蛋白质中氨基酸序列的一级结构决定着三维结构,序列相似的蛋白质可能起源于共同的...
蛋白质同源建模对于高级结构未知蛋白的功能预测具有重要意义。.同源模型的构建是基于特定的程序进行的，大量及时更新的序列和丰富的蛋白结构数据库是基础。.将需要的工具、程序及数据库整合而成一个基于互联网的工作站，有利于广大科研工作者借助...
蛋白质结构预测方法同源建模＆折叠识别—文档、资料、论文、办公、总结，均是精品资料，免费阅读，免费分享，值得下载！
蛋白同源建模及分子对接总结.ppt,原理：原子能量最小化**蛋白同源建模及分子对接——以CueO蛋白为例基本策略建立模型：Swiss-model、Modeller模型检测：Save模型优化：Chiron再次检测：Save分子对接：Autodock序列与模板相似度，>30...
在做分子对接时，如果没有蛋白质的三维结构，一般通过同源建模得到所需蛋白质的三维结构。现在想和各位虫虫们讨论一下：是在swiss-model上面下载上面自动建模得到的蛋白质好呢，还是自己同源建模得到的三维结构比较好？请各位各抒己见，好让我们这些比较晚接触这方面的有所取舍。
貌似很多人都对同源建模的优化感到困惑，我也一样。.今天上午跟老板一起讨论下这个问题（因为读博刚进实验室没多久，所以经验不一定很多，所以这里只是和大家一起分享下我们实验室的经验），感觉收获很多。.一般在同源建模的时候，初始的模型是非常...
同源建模通常要求模板蛋白与目标蛋白的序列一致性高于30%。同源建模的步骤同源建模可以通过以下7个步骤进行[1]：1、搜索结构模型的模板(T)。同源建模方法假设两个同源的蛋白质具有相同…
根据DeepMind公开的论文《Improvedproteinstructurepredictionusingpredictedinter-residueorientations》。AlphaFold由深度学习和传统算法混合而成：CNN+Rosetta。具体来说构建神经网络预测残基间的方向和距离，然后用Rosetta对蛋白质结构同源建模
蛋白同源建模及分子对接——以CueO蛋白为例序列与模板相似度，>30%模板可用GMQE（GlobalModelQualityEstimation）是一种基于目标模板对准结合性质的质量估计，数值在0-1之间，越接近于1表示模型越接近实验结果。
计算机辅助抗癌药物设计和蛋白同源建模研究.【摘要】：传统的药物设计方法耗时耗力,具有一定的随机性和盲目性,缺乏应有的合理性。.随着自动化平台、计算化学、以及生物学的快速发展,基于计算机辅助的药物设计已逐渐成为重要的技术手段之一。.本学位...
【摘要】：蛋白质大分子的三维结构决定了蛋白质的功能与性质,蛋白质结构预测在医学、药物学、生物学等研究中均具有重要的意义。同源建模法是目前唯一在实际中应用的蛋白质分子结构的预测方法。研究表明,蛋白质中氨基酸序列的一级结构决定着三维结构,序列相似的蛋白质可能起源于共同的...
蛋白质同源建模对于高级结构未知蛋白的功能预测具有重要意义。.同源模型的构建是基于特定的程序进行的，大量及时更新的序列和丰富的蛋白结构数据库是基础。.将需要的工具、程序及数据库整合而成一个基于互联网的工作站，有利于广大科研工作者借助...
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在做分子对接时，如果没有蛋白质的三维结构，一般通过同源建模得到所需蛋白质的三维结构。现在想和各位虫虫们讨论一下：是在swiss-model上面下载上面自动建模得到的蛋白质好呢，还是自己同源建模得到的三维结构比较好？请各位各抒己见，好让我们这些比较晚接触这方面的有所取舍。
貌似很多人都对同源建模的优化感到困惑，我也一样。.今天上午跟老板一起讨论下这个问题（因为读博刚进实验室没多久，所以经验不一定很多，所以这里只是和大家一起分享下我们实验室的经验），感觉收获很多。.一般在同源建模的时候，初始的模型是非常...
同源建模通常要求模板蛋白与目标蛋白的序列一致性高于30%。同源建模的步骤同源建模可以通过以下7个步骤进行[1]：1、搜索结构模型的模板(T)。同源建模方法假设两个同源的蛋白质具有相同…
根据DeepMind公开的论文《Improvedproteinstructurepredictionusingpredictedinter-residueorientations》。AlphaFold由深度学习和传统算法混合而成：CNN+Rosetta。具体来说构建神经网络预测残基间的方向和距离，然后用Rosetta对蛋白质结构同源建模
蛋白同源建模及分子对接——以CueO蛋白为例序列与模板相似度，>30%模板可用GMQE（GlobalModelQualityEstimation）是一种基于目标模板对准结合性质的质量估计，数值在0-1之间，越接近于1表示模型越接近实验结果。
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