NatMethods:蛋白序列比对新工具HHblits更快更准.近日,来自德国慕尼黑大学的研究人员在NatureMethods杂志上发表论文"HHblits:lightning-fastiterativeprotein...
【精品专业论文】蛋白质三级结构比对方法及其应用,计算机,软件编程,系统开发,期刊论文,博士论文,硕士论文号:TP39单位代码:1硕士学位论文蛋白质三级结构比对方法及其应用ProteinStructureAlignment作者姓名:郎美娜业:计算机应用技术研究...
近日,德国慕尼黑大学的研究人员发表论文介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具:HHblits。相关成果公布在《自然—方法学》(NatureMethods...
DNAMAN是美国LynnonBiosoft公司开发的高度集成化的分子生物学综合应用软件,可以用于多序列比对、PCR引物设计、限制性酶切分析、质粒绘图、蛋白质分析等,几乎囊括了所有日常核酸、蛋白质序列的分析工作。因此掌握它,是从事分子生物学工作的...
同源序列比对是生物信息学普遍采用的分析方法之一,其中,编码蛋白质DNA序列比对最为常见,在比较基因组学、分子进化学、系统发育等领域具有重要的基础作用。为获取相应的比对结果,通常采用的方法是先比对后回译(back-translate),此方法比直接进行DNA序列比对…
BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)可以说是短序列比对中最常用的比对工具了,它不仅支持核酸和蛋白的双序列比对,而且可以在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性…
3.Origin使用时间最长的数据绘图软件,在普通工科院系Origin就是专业论文绘图标配。功能丰富全面,多图层在2D数据处理上非常实用(3D的没画过),简单画画容易上手,深入之后学习曲线开始变得平缓。由于渲染效果和自由度的限制,画出的图都...
diamond软件_DIAMOND:超快的蛋白序列比对软件weixin_39703982的博客12-28657今天用BLASTX将我的转录本序列在UniProt蛋白数据库(700w条序列)中搜索,80个线程,过了1小时大概就分析1000条吧。实在是有点慢,于是我想到之前耳闻的...
前两天导师给我找了十篇Papers,这让我有些小惶恐,毕竟读论文还是自己要做好的事情,仔细想起来我还没有一个完整的阅读文献的思路,故此想将知乎上大家讨论的精华整理成一篇,供自己也供大家学习。读论文该包括哪…
图片来源:软件截图这里顺便回顾一下BLAST的几个注意事项:(1)考虑到密码子的简并性,BLAST通常优先用蛋白序列比对,没有蛋白序列的情况下再考虑用核酸序列比对,这样能最大限度减少假阳性;(2)在比对时应该注意合理选择数据库和物种信息,比如核酸序列比对时通常选择Nucleotidecollection数据...
NatMethods:蛋白序列比对新工具HHblits更快更准.近日,来自德国慕尼黑大学的研究人员在NatureMethods杂志上发表论文"HHblits:lightning-fastiterativeprotein...
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近日,德国慕尼黑大学的研究人员发表论文介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具:HHblits。相关成果公布在《自然—方法学》(NatureMethods...
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同源序列比对是生物信息学普遍采用的分析方法之一,其中,编码蛋白质DNA序列比对最为常见,在比较基因组学、分子进化学、系统发育等领域具有重要的基础作用。为获取相应的比对结果,通常采用的方法是先比对后回译(back-translate),此方法比直接进行DNA序列比对…
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