发表服务
HerewehighlightthemajordevelopmentstoENAservicesandcontentin2020,focussinginparticularontherecentlyreleasedupdatedENAbrowser,modernisationofourreleaseprocessandourdatacoordinationcollaborationswithspecificresearch
japonica)进行转录组测序。我们在11个测序物种中鉴定到1,048个直系同源基因用于系统发育分析。...中国植物学会八十五周年学术年会论文摘要汇编（1993-2018）[C];2018年2...
ENA存储测序数据，并没有绝对的规律，部分数据有专门的目录，部分数据放在不同深度的目录。.故，无法通过像NCBI或者DDBJ一样的操作去拼接链接。.而只有两个操作：.爬虫，解析整个ENA的FTP，获得并保存文件地址.爬虫，针对给定的SRR获取其对应的信息.第...
使用R语言批量下载指定数据批次的双端测序数据通常，论文中的双端测序数据在ENA数据库中存储，当我们需要下载的时候，可以使用ENA推荐的工具下载，但是有些环境中却不是那么方便，因此，本文基于R语言，编写了一个根据数据批次下载双端测...
摘要：DNA测序技术是现代分子生物学研究中最常用的技术。从1977年第一代测序技术的出现,经过30多年的发展,DNA测序技术取得重大进展,以高通量为特点的第二代测序技术逐步成熟并商业化,以单分子测序为特点的第三代测序技术也已经出现。
在做基因组学数据分析，往往需要从NCBI/sra或者EBI/ENA下载高通量的测序数据。通常的ftp下载(或者wget)，或者sratoolkit下载往往耗时太长，这时一种大数据下载神器Aspeara就能够大显神通了。Aspera的最简单使用是通过网页插件形式(像Firefox,IE...
而二代测序数据的话，一般都会上传到SRA数据库。SRA（SequenceReadArchive）数据库主要保存的是高通量测序的原始数据和对比信息。SRA的数据库上传不了的情况下，你可以选择把二代测序数据上传到ENA（EuropeanNucleotideArchive）。ENA隶属于
完成以后，进入到上传的主界面，又有诸多步骤，下面进行详细介绍。.4.1进入Submitter界面.界面显示的是你之前填写的个人信息，直接点击“continue”按钮。.4.2进入GeneralInformation界面.该界面值得注意的是数据的公开时间，如果用于发表文章，建议指定公开的...
一般在进行公共测序数据挖掘的时候，需要从公共数据库中（SRA、ENA、DDBJ等）下载自己所需的测序数据。下载数据时，往往会遇到网速限制或下载链接不可用等因素，当某个数据库的目标数据下载不来时，可以去其他公共数据库下载，因为这三者的数据是共享的。
一般高通量测序文章发表时会将原始数据上传至GEO数据库并在文章中提供GSE号，如果想对某些文章的数据进行在分析，可以在GEO数据库搜索文章中的GSE号。3.拉至页面最下方，选择需要下…
HerewehighlightthemajordevelopmentstoENAservicesandcontentin2020,focussinginparticularontherecentlyreleasedupdatedENAbrowser,modernisationofourreleaseprocessandourdatacoordinationcollaborationswithspecificresearch
japonica)进行转录组测序。我们在11个测序物种中鉴定到1,048个直系同源基因用于系统发育分析。...中国植物学会八十五周年学术年会论文摘要汇编（1993-2018）[C];2018年2...
ENA存储测序数据，并没有绝对的规律，部分数据有专门的目录，部分数据放在不同深度的目录。.故，无法通过像NCBI或者DDBJ一样的操作去拼接链接。.而只有两个操作：.爬虫，解析整个ENA的FTP，获得并保存文件地址.爬虫，针对给定的SRR获取其对应的信息.第...
使用R语言批量下载指定数据批次的双端测序数据通常，论文中的双端测序数据在ENA数据库中存储，当我们需要下载的时候，可以使用ENA推荐的工具下载，但是有些环境中却不是那么方便，因此，本文基于R语言，编写了一个根据数据批次下载双端测...
摘要：DNA测序技术是现代分子生物学研究中最常用的技术。从1977年第一代测序技术的出现,经过30多年的发展,DNA测序技术取得重大进展,以高通量为特点的第二代测序技术逐步成熟并商业化,以单分子测序为特点的第三代测序技术也已经出现。
在做基因组学数据分析，往往需要从NCBI/sra或者EBI/ENA下载高通量的测序数据。通常的ftp下载(或者wget)，或者sratoolkit下载往往耗时太长，这时一种大数据下载神器Aspeara就能够大显神通了。Aspera的最简单使用是通过网页插件形式(像Firefox,IE...
而二代测序数据的话，一般都会上传到SRA数据库。SRA（SequenceReadArchive）数据库主要保存的是高通量测序的原始数据和对比信息。SRA的数据库上传不了的情况下，你可以选择把二代测序数据上传到ENA（EuropeanNucleotideArchive）。ENA隶属于
完成以后，进入到上传的主界面，又有诸多步骤，下面进行详细介绍。.4.1进入Submitter界面.界面显示的是你之前填写的个人信息，直接点击“continue”按钮。.4.2进入GeneralInformation界面.该界面值得注意的是数据的公开时间，如果用于发表文章，建议指定公开的...
一般在进行公共测序数据挖掘的时候，需要从公共数据库中（SRA、ENA、DDBJ等）下载自己所需的测序数据。下载数据时，往往会遇到网速限制或下载链接不可用等因素，当某个数据库的目标数据下载不来时，可以去其他公共数据库下载，因为这三者的数据是共享的。
一般高通量测序文章发表时会将原始数据上传至GEO数据库并在文章中提供GSE号，如果想对某些文章的数据进行在分析，可以在GEO数据库搜索文章中的GSE号。3.拉至页面最下方，选择需要下…
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