保密的一般是与涉密项目有关的论文，即常规涉密内容，如：涉密的国家自然科学基金项目（以下简称“国自然”）、涉密的国家重大社会科学基金项目等；或者是其他涉密内容，如：涉密的国家重点实验室、涉密的军事院校等。
其中，涉密项目一般都有保密期，国自然一般保密期是3-5年，也有更长的，随项目时间顺延，在保密期过后会随当年硕、博士论文一同录入知网；如果是其他涉密内容，则可能只在内网交流，公开时间另行规定（或有限公开、甚至不公开）。
过了保密期后才会在网上公开，也就是说还在保密期的论文是查不到的，自然就不会和保密期的论文查重了。
查 我的就查了 有个同门也是保密论文，以为不查，结果栽了
严格意义上来说，是的。只要是正规的大学，毕业论文都是要查重的，这里主要说的是本科论文，大专论文有些学校可能是不查重的，因为有些是以产品设计或者做一些实际性的东西为考核标准，不太好查重。
有些同学可能在想，学校会不会采取抽查的形式来查重论文，确实有抽查这种形式，不过在抽查之前，学校已经全部查重过一遍了，抽查算是复查了，所以不要抱有侥幸心理，以为可以躲过论文查重。
另外我们在查重论文时，注意选择主流的论文查重系统，可以避免很多麻烦和风险，目前主流的论文查重系统有：中国知网、万方、维普、PaperPP、PaperQuery、PaperGood这些，他们只有数据库大小和价格的差异，其他方面都是差不多的。先来说说中国知网，几乎成了高校和机构专用的论文查重系统了，你们学校很可能就是用的知网查重系统，不过知网早就不对个人用户开放了，想去知网查重论文，只能找学校，或者到网上找其他的知网查重入口，费用比较高，一百到几百不等。这里有一点要注意，知网虽然不查重论文，但是支持验证查重报告的真伪，所以如果用的是其他网站的知网查重入口，一定要到知网验证下查重报告。
参考资料：《毕业论文都要查重吗?》
