1 中华医学杂志(中、英文版)
2 中华劳动卫生职业病杂志
3 中华预防医学杂志
4 中华流行病学杂志
5 营养学报
6 中华医院管理杂志
7 中国中西医结合杂志
8 中国中药杂志
9 中华微生物学和免疫学杂志
10 病毒学报
11 中国病理生理杂志
12 中国寄生虫学与寄生虫病杂志
13 解剖学报
14 中华医学遗传学杂志
15 中华放射学杂志
16 中华医学检验杂志
17 中华放射医学与防护杂志
18 中华护理杂志
19 中华超声影像学杂志
20 中华急诊医学杂志
21 中华内科杂志
22 中华心血管病杂志
23 中华血液学杂志
24 中华结核和呼吸杂志
25 中华消化杂志
26 中华肾脏病杂志
27 中华传染病杂志
28 中华内分泌代谢杂志
29 中华外科杂志
30 中华泌尿外科杂志
31 中华骨科杂志
32 中华神经外科杂志
33 中华整形外科杂志
34 中华烧伤杂志
35 中华普通外科杂志
36 中华胸心血管外科杂志
37 中华麻醉学杂志
38 中华创伤杂志
39 中华妇产科杂志
40 中华儿科杂志
41 中华小儿外科杂志
42 中华肿瘤杂志
43 中华病理学杂志
44 中华神经科杂志
45 中华精神科杂志
46 中华皮肤科杂志
47 中华眼科杂志
48 中华耳鼻咽喉科杂志
49 中华口腔医学杂志
50 药学学报
51 中国药理学报(中、英文版)
52 中国药学杂志
53 药物分析杂志
54 中国药理学与毒理学杂志
为了更好地开展国内外学术交流，促进医药卫生事业的发展，《重庆医科大学学报》将继续秉承以往的办刊宗旨， 编辑部全体编校人员将努力把学报办成“精品”杂志，争取进入核心期刊行列，积极为促进学院科研学术事业的繁荣做贡献。
重庆医科大学学报二审和终审不一样。重庆医科大学学报级别非常高，目前被国内几大核心数据库同时收录中，专家审稿阶段周期比较长，对论文标准很严格，学报审稿流程有：编辑部初审-专业一审-专业二审-返修-编委会终审几个阶段，论文质量不达标，投稿后第二天就会被拒稿，效率很高，尤其是外审没有审稿意见，直接进入终审阶段的话，被拒稿概率还是非常大的。
