《福建师范大学学报（自然科学版）》是福建师范大学主办的面向国内外公开发行的综合性自然科学学术理论刊物，设有数学、计算机科学、物理学、化学、生命科学、地理科学、环境科学、运动学等栏目。1《福建师范大学学报（哲学社会科学版）》是面向国内外公开发行的哲学社会科学综合性学术理论刊物，创刊于1956年，是福建省最早创办的高校学报之一。
1956年创刊的《福建师范大学学报（哲学社会科学版）》虽是一家地处祖国东南一隅的学术期刊，但它拥有沿海开放和与台湾省毗邻的特殊人文地理环境的优势，且福建师大在理论经济学、中国文学、艺术学、专门史等学科领域占据全国领先地位，故该刊所开辟的闽台文化研究、经济学研究、中国文学研究、历史学研究、艺术研究等重点栏目比较引人注目。
自然科学版是的。
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福建师范大学学报(哲学社会科学版)
该刊被以下数据库收录：
CSSCI 中国社会科学引文索引(2014-2015)来源期刊(含扩展版)
北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊：2014年版
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福建师范大学学报(自然科学版)
该刊被以下数据库收录：
CA 化学文摘(美)(2014)
CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(2015-2016年度)(含扩展版)
北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊：2014年版
2014版北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊：
厦门大学学报(自然科学版)
厦门大学学报(哲学社会科学版)
福州大学学报(自然科学版)
福建师范大学学报(哲学社会科学版)
福建师范大学学报(自然科学版)
福建医科大学学报
福建农林大学学报(自然科学版)
福建林学院学报(改名为：森林与环境学报)
中共福建省委党校学报
福州大学学报. 哲学社会科学版（在2014版北大中文核心期刊目录中 被踢掉了）
