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hpv生物信息学论文

2023-12-08 12:08 来源:学术参考网 作者:未知

hpv生物信息学论文

【综述】
几种用于发现未知病毒核酸序列的技术及其应用
翁康生
病毒是引发人类传染性疾病的主要病原体之一, 它们极
大地威胁着人类健康。目前还存在人类尚未认知或新出现的
病毒, 随时可能严重危害人类健康安全〔1 - 3〕。及早地发现,
鉴别未知的或新出现的病毒, 是有效的预防和控制的先决条
件之一。因此, 建立、储备、改良、发展、乃至创新应用于
发现、鉴别未知或新出现病毒的技术方法是十分必要的。
近20 多年来, 常采用传统的微生物学技术方法和现代分
子生物学技术方法相结合的途径, 发现和鉴别未知病毒。通
过细胞培养的方法分离病毒、电镜观察、用已知病毒的抗血
清建立的免疫学方法作排他性检测、用已知病毒核酸序列建
立的PCR、杂交等方法, 作特异核酸序列的检测、用分子生物
学技术获得未知病毒核酸序列, 查询基因数据库, 检出并确
定未知病毒基因组序列, 最终发现鉴别出未知病毒。
对于无法用细胞分离培养的未知病毒, 有的采用免疫学
与分子生物学技术相结合, 筛选获取病毒特异抗原编码基因
的克隆, 进而发现鉴别出该病毒。更多的则是采用相应的分
子生物学技术, 从被检样品中发现获取未知病毒的核酸序列,
进而发现鉴别未知病毒。无论未知病毒是否可以用细胞培养
分离, 最终对其基因组序列的测定分析, 是鉴别和判断的决
定性依据之一, 而获取未知病毒的核酸序列是前提条件。
从少量样品中, 从高度复杂的宿主细胞核酸物质中, 分
离、扩增、获取足够量的无基因序列资料的未知病毒的核酸
片段, 供进一步克隆、测序、生物信息学分析, 是用分子生
物学技术发现、鉴别未知和新出现病毒的关键之一〔4〕, 也是
最终测定分析, 拼接出未知和新出现病毒基因组序列的瓶颈
步骤。病毒所携核酸物质有DNA 和RNA 之分, 可采用的技术
方法也有所不同, 现将有关技术与其应用作一简介, 以供
参考。
1 代表性差异分析法
代表性差异分析法是为寻找分析两个生物样品复杂的基
因组间有何差异而发展建立起来的分子生物学技术方法, 并
不断得到演化, 发展和应用。病毒感染宿主细胞后, 与未感
染的同类细胞相比, 二者核酸物质间的差异主要在于是否存
在病毒核酸。消减去二者核酸间相同序列的背景部分, 扩增、
比较、选取余下可能存在差异的部分, 进一步分析以发现未
知病毒的核酸序列。病毒的核酸结构各有不同, 可选用相应
的代表性差异分析法, 见表1 。
111 DNA 代表性差异分析法(DNA Representation difference
analysis , DNA RDA)
此方法是Lisitsyn 等〔5〕利用核酸消减杂交技术〔6〕、PCR 方法
和双链DNA 热变性后互补链退火复性的二级动力学原理〔7 - 8〕
作者单位:上海市疾病预防控制中心 200336
表1 病毒核酸类型与各代表性差异分析法的选用
病毒核
酸类型
DNA RDA c DNA RDA
非rRNA 序列
6 核苷酸引导
c DNA RDA
ds DNA 线状√
ds DNA 环状√
ss RNA polyA( + ) √
ss RNA polyA( - ) 3 √
ds RNA polyA( - ) √
3 负链ss RNA polyA( - ) 视病毒在宿主细胞的转录机制而定。
而建立的。方法中将需分析的样品DNA(Test DNA ,T- DNA) 和
对照DNA(Driver DNA ,D - DNA) 设为二组,分别用同一种限制
性内切酶酶切处理,并接上5′端去磷酸化的人工接头,补齐接
头后,加入与接头序列互补的引物作PCR 扩增。切除扩增产物
上的人工接头后,切出的T - DNA 连上第二种人工接头,变性
后与过量的变性D - DNA 杂交。通过杂交,消减去T- DNA 中
与D - DNA 中同源的核酸序列,而只存在于T - DNA 中的靶序
列DNA(Target DNA) 则自我退火复性,其两端连有第二种人工
接头。加入与第二种接头互补的引物作PCR ,只有靶序列DNA
呈指数扩增,因而得到进一步富集。进过如此重复的几个轮回
后,以电泳检测比较T- DNA 和D - DNA ,将T- DNA 中呈现的
差异部分作分离,克隆,序列分析。
Lisitsyn 等以10μg 人淋巴细胞基因组DNA 作为D - DNA ,
在相同的人DNA 中加入相当于单拷贝量的120 pg 腺病毒DNA
作T- DNA。以此作为实验模型,用DNA 代表性差异分析法成
功的寻找、鉴定出外加入的腺病毒DNA 序列。应用此技术,
Chang 等〔9〕在艾滋病相关的卡波西肉瘤(Kaposis Sarcoma) 中发现
一段类似人类疱疹病毒的基因, 并由此发现一种新的病毒
HPV8。以后人们又以此技术发现鉴定了HPV6、TTV 病毒、黄热
病毒样基因组、MDV 等〔10 - 13〕DNA 病毒。
112 cDNA 代表性差异分析法(cDNA Representation difference
analysis , cDNA RDA)
Hubank 等〔14〕针对mRNA 所含序列相对简单的特点,提出
了cDNA 代表性差异分析法。它的基本原理与DNA RDA 相同,
主要不同在于,采用识别4 核苷酸序列的限制性内切酶,它的
识别位点在mRNA 反转录成的cDNA 中出现的频率更高,平均
酶切片段长度约256 bp ,保证了cDNA 序列群中绝大多数序列,
至少被切出一个片段可扩增,供差异分析,分离鉴定。
cDNA RDA 技术相对经济,可高效灵敏地用于非常少的起
始材料而获得结果〔15〕。具有polyA( + ) - RNA 病毒,其核酸可
类似于mRNA 分离纯化,因此可应用此技术。利用cDNA RDA
技术,发现鉴定了TiV、MenV ,等〔16 ,17〕RNA 病毒。
113 非rRNA 序列6 聚核苷酸引导反转录的cDNA RDA
中国预防医学杂志2007 年6 月第8 卷第3 期 Chin Prev Med , June 2007 , Vol18 No13 ·317 ·
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polyA( - ) - RNA 病毒,其核酸物质不似于mRNA ,需和宿
主细胞总RNA 同时分离,并用随机引物作反转录。因为宿主细
胞总RNA 中rRNA 约占80 % ,由于竞争反应、靶序列信号被湮
灭等原因,从这样的总RNA 抽提物中,用随机6 聚核苷酸引物
引导反转录的cDNA RDA 技术,发现鉴别polyA( - ) - RNA 病
毒核酸序列是困难的。Endoh 等〔18〕罗列了6 聚核苷酸所有可
能的排列组合,共计4 096 个序列模式,以大鼠18S、518S、28S 等
rRNA、微卫星重复序列、SARS - CoV、BI - 3 病毒等的序列数据
为模型,筛选出在rRNA 序列中出现频率极低或不出现的6 聚
核苷酸序列模式共96 种。将这些序列分别合成并混合后,称
之为非rRNA 序列6 聚核苷酸引物。生物信息学分析96 种序
列模式在哺乳动物病毒科具代表性的1 791 个病毒基因组序列
中出现的频率,数据表明,非rRNA 序列6 核苷酸引物可引导绝
大多数病毒的cDNA 合成。分别用非rRNA 序列6 聚核苷酸引
物和随机6 核苷酸引物作cDNA 反转录效率、cDNA RDA 试验,
结果表明,二类引物对人工合成的RNA (二类引物在其序列中
出现的频率相似) 反转录效率几乎相等,而前者对细胞总RNA
反转录效率远低于随机引物。用二类引物作cDNA RDA ,检测
人工合成的RNA ,前者灵敏度是用随机引物的30 倍。在模拟
实验中用非rRNA 序列6 聚核苷酸引物引导反转录,串联cDNA
RDA 技术,检测鉴别出感染细胞的BI - 3 和SRAS - Cov 核酸序
列片段。
此方法能从1μg 总RNA 中检测出3 ng 的外来RNA ,其检
测灵敏度不及普通的PCR 检测方法,但对于检测鉴别在宿主细
胞中复制,但不知其基因序列的poly A( - ) - RNA 病毒而言,也
是一个可选择的方法。
114 抑制消减杂交
cDNA RDA 技术结合消减杂交和PCR 抑制作用〔19〕的技术
原理,Diatchenks 等〔20〕等发展出了抑制消减杂交技术( suppression
subtractive hybridization ,SSH) 。与前两种RDA 技术不同点在于,
SSH 技术将内切酶酶切处理的T - cDNA 分为两份,分别接上
不同序列的去磷酸化的接头1 和2 ,分别于过量的D - cDNA
作第一轮杂交。杂交过程中两组中的单链T - cDNA 浓度趋
同,T- cDNA 中的非靶序列单链cDNA 与D - cDNA 中相应序列
形成杂交双链而被消减, T - cDNA 中差异表达的单链cDNA
被显著富集。合并一轮杂交物,加入过量变性D - cDNA ,作第
二轮杂交。合并的二组份一轮杂交物中剩下的趋同化、经消减
杂交后的单链T - cDNA 能互补杂交, 可以形成: 原组内
T- cDNA 单链间的杂交、T - cDNA 与D - cDNA 单链间的杂
交、二组间T- cDNA 单链间的杂交。补齐杂交反应后双链cD2
NA 末端,用分别与接头1 和2 的外侧部分序列互补的寡核苷
酸为引物,作PCR 扩增。二组份间T- cDNA 互补单链杂交物,
因两端分别具有接头1 和2 ,可被指数扩增;T - cDNA 与D -
cDNA 杂交物和剩余单链T- cDNA ,因一端具接头序列,被线性
扩增;而同组间T- cDNA 杂交物两端具反转重复长序列,因抑
制性PCR 效应,在PCR 反应循环中分子内退火形成稳定的“锅
柄结构”〔19〕而不被扩增。因此,SSH 技术通过二轮消减杂交和
抑制性PCR 特异扩增,使假阳性大大降低,提高了检出低丰度
靶mRNA 的灵敏度。
Hu 等〔21〕应用SSH 技术,结合反转录酶的模板切换(tem2
plate - switching) 功能, 以HCV RNA 阳性血清体外感染的人
MOLT- 4 急性淋巴母细胞白血病T 细胞系为模型,通过反转录
合成全长cDNA、抑制性消减杂交、消减的cDNA 文库构建、反相
斑点杂交筛选,在被筛的96 个克隆里,T- cDNA 探针杂交呈特
异阳性的16 克隆中,序列分析后得到4 个插入HCV 序列的
克隆。
2 非特异多重引导滚环式扩增法
乳头瘤病毒、痘病毒等,其基因物质为环状DNA 分子。在
事前未知基因序列的情况下,发现和鉴别这类病毒核酸序列还
可选择非特异多重引导滚环式扩增法(multiply primed rolling -
circle amplification ,RCA) ,扩增、分离、获取其基因片段供进一步
分析。
自然状况下,环状DNA 经常以滚环方式进行复制。Dean
等〔22〕应用随机6 聚核苷酸作引物,加入φ29 DNA 聚合酶,以质
粒DNA 和噬菌体DNA 为模型,建立了多重引物引导的滚环式
扩增法。φ29 DNA 聚合酶可长距离( > 70 000 nt) 地结合于DNA
模板,进行链置换DNA 合成。而随机6 聚核苷酸引物可多位
点的与单链环状DNA 互补复性。在φ29 DNA 聚合酶作用下,
以随机引物引导,合成与模板互补的DNA 链。当合成链延伸到
与模板结合的随机引物5′端时,在φ29 DNA 聚合酶的链置换活
性作用下,下游被延伸的随机引物链被“甩”出模板。而上游的
延伸链继续在环状模板上复制合成。同时,被从单链环状模板
上“甩”出的互补链,又成为新的模板,随机引物与之结合,在
φ29 DNA 聚合酶作用下,继续以枝杈的形式进行链延伸和链置
换,最后以双链DNA 串联体形式释放。用此法可使1 ng 纯
pCU18 环状DNA 模板延展式地扩增至107倍。
Rector 等〔23〕以此原理建立了不依赖已知的特定基因序列
(非序列依赖性) 的多重引导滚环式扩增环状DNA 病毒基因组
方法,并应用其扩增获取了HPV 16 的基因组DNA。在接近实
样的试验样品中,由于稀释倍数和环状DNA 分子较大等原因,
将HPV 16 基因组DNA 扩增了214 ×104 倍。
3 病毒颗粒相关核酸的非序列依赖性PCR 扩增
病毒核酸可包裹于病毒外壳内,病毒的蛋白外壳或脂膜对
病毒核酸具有保护作用。而病毒颗粒具有不同于细菌或其他
真核细胞的理化特性。利用这样的特点Allender 等〔24〕和Stang
等〔25〕各自建立了病毒颗粒相关核酸的非序列依赖性PCR 扩增
方法(sequence - independent amplification) 。两种方法的共同点在
于,依据病毒颗粒小、具一定密度,用0122μm 滤器过滤、或再串
上超速密度梯度离心,从样品中分离出病毒颗粒,DNA 酶酶解
游离的DNA ,裂解病毒颗粒,抽提获取较纯的病毒颗粒相关
核酸。
Allender 等〔24〕借鉴RDA 原理,对病毒颗粒相关核酸用限制
性内切酶酶切后,作非序列依赖性单引物PCR 扩增( sequence -
independent single primer amplification ,SISPA) :将抽提获取的DNA
或RNA 分别补齐,合成第二链DNA ,或反转录,合成双链cDNA。
限制性内切酶酶切后,酶切片段两端连接一种接头,并以与接
头同序列的单一寡核苷酸为引物,作PCR 扩增。扩增产物进一
步克隆与序列分析。用此法检验HBV 阳性血清和GBV - B 阳
性血清样品,结果在相当于106/ ml 个基因组拷贝浓度的50μl
样品中,可重复试验检出相应的病毒基因片段。
Stang 等〔25〕则在得到双链DNA 或双链cDNA 后加入k - 随
机引物,此种引物5′端含有20 个固定序列的核苷酸,3′端则有
·318 · 中国预防医学杂志2007 年6 月第8 卷第3 期 Chin Prev Med , June 2007 , Vol18 No13
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MNNMNM6 核苷酸随机简并序列。与变性模板退火时,6 核苷
酸随机简并序列随机地与模板相应序列互补退火,在T4 DNA
聚合酶作用下作链延伸。然后在延伸产物中加入k - 随机引物
中固定序列部分的20 寡核苷酸作引物,进行PCR 扩增。扩增
产物电泳分析、克隆、测序。用此方法检验由实时- PCR 定量,
包括病毒颗粒相关核酸及游离核酸在内的病毒基因组拷贝数
为109/ ml 的Cox - 3 和MAV - 1 培养物。前者的12 克隆中,
9 个克隆插入有肠道病毒的四个不同区域的同源基因片段;而
6 个MAV - 1 中分离的克隆内,5 个含有99 % 同源MAV - 1 基
因片段。
基于病毒颗粒分离纯化、DNase 处理、病毒颗粒相关核酸的
非序列依赖性PCR 扩增,获取、鉴定未知病毒的基因片段,尽管
灵敏度不够高,但其实验时间较短,步骤相对简单,对于病毒拷
贝数高,时间紧急的样品鉴别,是较适宜的一套方法。
病毒的种类、结构、特性多种多样,感染病毒后需要检验的
样品又各不相同,因此用于发现鉴别未知病毒的核酸序列的技
术,也不是固定不变和完全通用的。以上的技术方法各有优缺
点和适用范围。而针对扩增获取未知病毒基因组序列片断,这
一发现鉴定未知病毒的分子生物学技术的要点或瓶颈,必然还
会有新的改进、创新技术出现,将会更快、更灵敏、更简便、更准
确的发现鉴别未知病毒。
参 考 文 献
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中国预防医学杂志2007 年6 月第8 卷第3 期 Chin Prev Med , June 2007 , Vol18 No13 ·319 ·
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信息检索2009 答案2

CBM
1.请用“基本检索”检索下题:
番茄红素抗氧化作用的综述文献
题目:番茄红素 and 抗氧化 限定:综述

尖锐湿疣时白介素2(il-2)的研究文献
题目:(白细胞介素2 or 白细胞介素?2 or 白介素2 or 白介素?2 or il2 or il?2) and 尖锐湿疣

12岁以下儿童接种卡介苗与结核菌素试验研究
缺省:卡介苗 and 结核菌素试验 限定:新生婴儿;婴儿;学龄前儿童;儿童

2.请用“主题检索”检索下题:
骨质疏松诊断的综述文献
限定检索:综述
主题词=骨质疏松/诊断

请查查葛根素主要用于哪些疾病的治疗(列出2种以上疾病)
-冠心病、脑血管疾病、外周血管疾病、功能性消化不良 、糖尿病周围神经疾病等

3.请用“分类检索”检索下题:
检索中药炮制对药物性能影响的相关文献
分类检索:中国医学-中药学-炮制对药物性能的影响 分类号:R283.1

白血病的中图法分类号
类目名:白血病 分类号:R733.7

4.请用“作者检索”检索一下题目
检索钟世镇院士第一作者发表文献多少篇。
作者检索,输入钟世镇,点击第一作者的小图标,即可检得。

检索胡平玲第一作者发表题目中含有“医院管理”的文献多少篇?
#1 作者检索,输入胡平玲,点击第一作者的小图标
#2 题目=医院管理
#3 #1 and #2

5.请用多种检索途径综合组配检索下题:
胰岛素在消化系统疾病的应用(自由词、主题词加分类)
#1 主题词=胰岛素 #2 缺省=胰岛素 #3 #1 or #2
#4 类目名:消化系及腹部疾病 分类号:R57
#5 #3 and #4

三氧化二砷(砒霜)的毒性试验(自由词加主题词)
-#1 题目:砒霜 or 三氧化二砷 #2 主题词=毒性试验 #3 缺省=毒性
#4 #1 and (#2 or #3)
CBM:
1.大叶性肺炎流行病学方面的文献
主题词=="肺炎, 肺炎球菌性/EH/EP/MO"
2.检索1996年以来有关治疗学龄前儿童哮喘的综述文献.
哮喘 -限定:1999-2009;综述;儿童,学龄前;人类
3.请综合利用中国生物医学文献数据库(CBM)的基本检索和分类进行检索,查找2003-2005年广州中医药大学发表的关于中药学方面的综述文献?请写出检索步骤。
#1地址: 广州中医药大学
#2分类: 中药学 扩展
#3限定: 2005-2008;综述
#4=#1 and #2 and #3
4.娱乐新闻经常有对明星在生育之后患抑郁症的报道。请你用中国生物医学文献数据库(CBM)的主题检索途径,查找2005以来关于此类病症的流行病学研究文献。请写出检索步骤并记录最新一篇文献的出处。
1 主题 产后抑郁症
2 副主题词 流行病学
3限定:2005-2008
4 文献出处:中国妇幼保健
5. 某同学患失眠症已经很久,每天晚上都无法很好入睡。请你用中国生物医学文献数据库(CBM)的主题检索进行检索,查找2003年以来关于失眠症膳食疗法方面的文献。
主题词=="入睡和睡眠障碍/DH/全部树",时间限定2003-2009
CBM
1. 三氧化二砷(砒霜)的毒性试验(自由词加主题词、主题词加主题词)
-#1 题目:砒霜 or 三氧化二砷 #2 主题词=毒性试验 #3 缺省=毒性 #4 #1 and (#2 or #3)

2.利用中国生物医学文献数据库(CBM)查找2004年发表的氟尿嘧啶用于胃癌治疗方面的文献。要求:检出的文献是病例报告。请写出检索步骤的全过程及对应检出了多少条记录。
#1 缺省 氟尿嘧啶 AND 胃癌
#2 PY=2004
#3 PT=病例报告
#4 #1 AND #2 AND #3
注:或者在限定界面设置相关条件;或者指明多次使用二次检索。

3.利用CBM数据库,检索中国医科大学的刘勇发表的有关聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)的文献。要求尽可能查全,请写出你的检索式。
#1 TI=聚合酶链式反应 OR Polymerase Chain Reaction OR PCR
#2 AU=刘勇
#3 AD=中国医科大学 OR 中国医大
#4 #1 AND #2 AND #3

4.利用CBM数据库的“分类检索”界面查找2008年发表的有关“抗溃疡药”的文献。请叙述你的操作过程。
点击“分类检索”,输入“抗溃疡药”,查找到此类。按分类检索。
在结果界面选择二次检索,选择“出版年”字段,输入“2008”,执行检索。

5.检索侯凡凡发表的文献有哪些,作为第一作者发表的文献有多少?
作者检索里边,输入侯凡凡,即可得到发表文献数量;点击后边第一作者的图标,可显示第一作者发表文献的数量。

CBM
1. 请查第一军医大学的夏旭在2003年以第一作者发表的文献。
#1 夏旭 第一作者的论文
#2 第一军医大学(地址) 2003年的论文
#3 #1 and #2

2. 利用中国生物医学文献数据库(CBM)基本检索查找2001年以来我校发表的有关卫生经济方面的文献。请写出检索步骤及最早一篇文献的标题。
参考答案: 缺省/题目:#1 缺省 卫生经济
#2地址:南方医科大学 or 第一军医大学
#3时间限定:2001-2008
#4 #1 and #2 and #3
标题:全环境保护预防恶性血液病医院感染的卫生经济学评价

3.在这个压力倍增的年代,很多人都患上了抑郁症,不少明星因为抑郁症而自杀。请你用中国生物医学文献数据库(CBM)的主题检索进行检索,查找关于抑郁症膳食疗法方面的文献。请记录检索过程及最新一篇文章的题录。
参考答案:主题检索: 抑郁症 副主题词:膳食疗法
题录:
标题 日常饮食对抑郁症患者的疗效观察
著者 吴月容
著者单位 莆田武警8710部队医院 351133
出处 中华中西医临床杂志 2002; 2(12): 108-109

CJFD
1 2000年以来《中华检验医学杂志》发表的循证医学文章;国家自然科学基金论文有多少?
刊名:中华检验医学杂志
并且 主题:循证医学
并且 基金: 国家自然科学基金
并且 年代限定:2000-2008

2 我校邹飞教授2002年以来发表在我校学报上的文章。
高级检索
作者:邹飞
并且 单位:南方医科大学 或者 第一军医大学
并且 刊名:第一军医大学学报 或者 南方医科大学学报
并且 年代限定:2002-2008

3检索 《解放军医院管理杂志》,最新一期是哪年哪期?这个杂志是核心期刊吗?它是否发表过篇名中含有“流行病”方面的文章?请写出其中一篇文章的题录。

期刊导航,输入 解放军医院管理杂志
最新一期 2008年5期。
有流行病学的文章。
不是核心期刊。
题录:口腔流行病大样本调查的器械管理.李洁,唐荣银.2003/02:43-44
CJFD:
1. 查找姚开泰院士发表的论文被他人引用几次
参考文献:姚开泰
不包含 作者:姚开泰
检索出的结果数量既是被他人引用的次数。
2. 从篇名字段查找1997年以来心肌梗塞动脉内支架治疗方面的文献
篇名:心肌梗塞
并且 篇名:动脉内支架
时间:1997-2009
3. 查找1997年以来南方医院放射科发表的文献,选择性地进行全文浏览
单位:南方医院放射科
时间:1997-2009
匹配方式:模糊
4. 检索2004年有关水蛭研究的国家自然科学基金的论文
主题(或篇名、关键词):水蛭
基金:国家自然科学基金
时间:1997-2009
5. 1994-2004.12第一军医大学学报有多少篇我校发表的论文被CJFD收录?其中研究睡眠的论文有多少篇?
刊名:第一军医大学学报 或者 南方医科大学大学学报
并且 单位:第一军医大学 或者 南方医科大学
并且 主题(篇名或者关键词): 睡眠
6.请在中国期刊全文数据库(CJFD)中检索2000-2007年我校王彩云老师发表的关于“青风藤”或者“青藤碱”的论文有多少篇?其中受国家自然科学基金资助的有多少篇?请写出检索步骤、检索结果并摘录其中任何一篇文章的引文格式题录。
单位:第一军医大学 或者 南方医科大学
并且 作者: 王彩云
并且 主题:青风藤 或者 青藤碱
并且 时间:2000年-2007年
并且 基金:国家自然科学基金
10篇. 其中第国家自然科学基金7篇。
题录:王彩云,莫志贤,涂宏海. 青藤碱对吗啡依赖离体豚鼠回肠作用的实验研究[J]. 第一军医大学学报,2003,(4).
CJFD

1.《中华检验医学杂志》发表的循证医学文章有多少;其中国家自然科学基金论文有多少
刊名:中华检验医学杂志
篇名:循证医学
基金:国家自然科学基金

2.请检索中国期刊全文数据库(CJFD)回答2006年以来我校张群老师发表的期刊文献共有多少?其中作为第一作者发表的又有多少?抄下篇名中含有“血吸虫”的文献篇名及来源期刊。
作者:张群
单位:南方医科大学
时间:2006-2009
6篇,第一作者的4篇。
文献篇名:文献日本血吸虫小蛋白型多药物/代谢物排出蛋白样基因(SMR-like)的发掘和生物信息学分析 来源期刊:热带医学杂志(检索时间2008.12.25)

3.利用中国期刊全文数据库的“期刊导航”查找它收录的“中国医学”方面的期刊有多少种?其中<中草药>这一份刊更新到哪一年哪一期?
112种;2007年09期 【检索日期:2008-12-25】
CJFD
1. 查找并阅读全文:张丽华. 知网节与知识网络. 现代图书情报技术, 2006 (9) : 85- 88
作者:张丽华
并且 篇名:知网节与知识网络

2. 查找2004年-2006年CJFD中收录的关于三氧化二砷(砒霜) 用于临床治疗方面的文献
高级检索:
主题:三氧化二砷 或者砒霜
并且 主题:临床治疗
时间:2004-2006

3. 南方医科大学学报 2006年第2期发表的文章数量,其中本校作者发表的文章数量是多少?
刊名:南方医科大学学报
期:02
单位:南方医科大学
时间:2006

4. 检索2005年有关鼻咽癌研究的自然科学基金论文
基金:自然科学基金
并且 主题:鼻咽癌
并且 时间:2005
Pubmed

1 德国科学家哈拉尔德•楚尔•豪森(Harald zur Hausen)因发现导致宫颈癌的HPV(人乳头状瘤病毒)而获得2008年诺贝尔生理学或医学奖。请利用PubMed回答该作者2008年是否发表了有关HPV的文章?如有,请写出该文的出处。
Papillomaviruses—to vaccination and beyond
期刊 Biochemistry (Moscow)
ISSN 0006-2979 (Print) 1608-3040 (Online)
期 Volume 73, Number 5 / 2008年5月
文章类型 Review
DOI 10.1134/S0006297908050027
页 498-503
学科分类 生物医学和生命科学
SpringerLink Date 2008年5月31日

2 请利用PubMed检索2000年以来有关“65岁以上老人阿尔茨海默病(Alzheimer Disease)死亡率(mortality)的综述(Review)文献”。写出检索过程及命中文献数,记录最早一篇文献的出处。
#1 "Alzheimer Disease/mortality"[Mesh]
#2 Limits: Publication Date from 2000/01/01 to 2009/06/01, Review, Aged: 65+ years
#3 #1 AND #2
8篇,最早如下:
Potential savings in the cost of caring for Alzheimer's disease. Treatment with rivastigmine.
Hauber AB, Gnanasakthy A, Snyder EH, Bala MV, Richter A, Mauskopf JA.
Pharmacoeconomics. 2000 Apr;17(4):351-60. Review.

3利用pubmed检索关于SARS治疗(treatment, therapy)的英文文献,要求检出的文献带有文摘,发表时间是2004-2008。叙述如何操作可以完成上述检索要求。
#1 "SARS Virus"[Mesh] and (therapy OR treatment)
#2 Limits: Publication Date from 2004/01/01 to 2008/12/31, only items with abstracts, English
#3 #1 AND #2
4利用pubmed Single Citation Matcher查找下面文献:发表于New England Journal of Medicine 2000 年11月、内容是关于采用臀部保护器( hip protector)预防臀部骨折( hip fracture)的文献,请写出文献第一作者、文献篇名。
步骤:
Journal:the New England Journal of Medicine
Date:2000/11
Title words: hip fracture and hip protector
参考答案:
Prevention of hip fracture in elderly people with use of a hip protector.
Kannus P, Parkkari J, Niemi S, Pasanen M, Palvanen M, Järvinen M, Vuori I.N Engl J Med. 2000 Nov 23;343(21):1506-13.

5自己的名字在英文杂志上的书写格式?
钟世镇 zhong sz 王选 wang x
6 利用pubmed查找Pubmed收录的2003年来我校珠江医院发表的文献。
Affiliation:zhujiang hospital ORzhu jiang hospital
PubMed:
1.检索1996年以来有关学龄前儿童哮喘(asthma)的药物治疗(drug therapy)的带摘要并是综述的英文文献.
"Asthma/drug therapy"[Mesh],限定1996-2009;abstract;english;review,学龄前儿童

2.检索疯牛病(mad cow disease)流行病学(epidemiology)研究的文献.
("Encephalopathy, Bovine Spongiform"[Mesh] OR "Encephalopathy, Bovine Spongiform/epidemiology"[Mesh]
3.检索PubMed收录《中华医学杂志》(Chinese medical journal)的论文有多少篇?Chinese medical journal[journal name]
4.检索南方医院侯凡凡教授2006年在新英格兰医学杂志上发表的论文标题是什么,刊登在哪卷.哪期.哪页?
限定:
Author:hou ff journal:N Engl J Med date:2006
Efficacy and safety of benazepril for advanced chronic renal insufficiency. N Engl J Med. 2006 Jan 12;354(2):131-40 
Pubmed

1 一篇文章发表在一期刊上,具体信息如下:2006, volume 26, issue 5, and began on page 553. 请利用Pubmed查出这篇文章的作者以及作者的通讯地址。
利用single citation
Author:Yang LP, Liu ZF, Li YM, Li ZJ, Jiang Y.
Corresponding address:Department of Pathophysiology and Guangdong Provincial Key Laboratory of Functional Proteomics, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China

2.Suppose you want to find a meta-analysis published in 2006 on PubMed’s MeSH Databases: drugs for treatment of pregnancy induced hypertension, how should you do? Please write down your search strategy and the article’s funding sources.
Search strategy: "Hypertension, Pregnancy-Induced/drug therapy"[Mesh] AND (("2006"[PDAT] : "2006"[PDAT]) AND Meta-Analysis[ptyp])
External sources of support:No sources of support supplied
Internal sources of support:NSW Centre for Perinatal Health Services Research, The University of Sydney AUSTRALIA;Medical Research Council UK;Resource Centre for Randomised Trials, Oxford UK

3请利用MeSH Database回答PubMed中收录的有关“痴呆(dementia)流行病学(epidemiology)研究”的文献最早发表于哪一年?并写出文章的篇名与作者
答案:1957年
Huntington's chorea it India.
CHHUTTANI PN

4.请利用PubMed回答2008年11月以来发表在BMC Public Health上的文献中,由PMC提供免费全文文献有几条?请写出以Ahonkhai VI为最后一名作者的文献篇名。
答案:5条
Determinants of vaccination coverage in rural Nigeria.

Pubmed

1. 用limits界面利用PubMed检索2003年以来关于脑血管意外(cerebrovascular accident)的治疗(therapy)方面的免费全文文献。
"Stroke/therapy"[Mesh] Limits: Publication Date from 2003 to 2008, only items with links to free full text

2. 请利用MeSH Database回答PubMed中收录的有关“痴呆(dementia)流行病学(epidemiology)研究”的文献最早发表于哪一年?并写出文章的篇名与作者
1957年
Huntington's chorea it India.
3. 法国科学家弗朗索瓦丝•巴尔-西诺西(Françoise Barré-Sinoussi)和吕克•蒙塔尼(Luc Montagnier)因发现HIV(人类免疫缺陷病毒)而获得2008年诺贝尔生理学或医学奖。请利用PubMed回答吕克•蒙塔尼2004年是否发表了有关HIV的文章?如有,请写出该文的出处。(15分)
有,出处:J Thromb Haemost. 2004 Mar;2(3):514-5

医学相关专业硕士毕业论文题目

论文题目同时应鲜明醒目,能吸引读者,向读者提供最直接的信息和对论文主题作准确的说明。下面我给大家带来医学相关专业硕士 毕业 论文题目参考,希望能帮助到大家!

医学微生物学论文题目参考

1、PCR 方法 快速检验HBV

2、人感染埃博拉病毒的研究进展

3、肠道菌群研究方法进展

4、胃肠道微生物及其分子生态学技术研究进展

5、基于血凝素的新型流感疫苗的研究进展

6、肠道菌群影响宿主行为的研究进展

7、理性和科学的态度认识埃博拉

8、新型人感染H7N9禽流感病毒病原学研究进展

9、肠道病毒71型灭活疫苗的小鼠细胞免疫效果

10、基于结构的HIV-1整合酶抑制剂的虚拟筛选

11、结核分枝杆菌免疫逃逸分子机制的研究进展

12、柯萨奇病毒A组16型研究新进展

13、大肠杆菌生物膜的筛选及生长曲线测定

14、肺炎克雷伯菌耐药机制的研究进展

15、微生物菌种保藏方法及标准菌种管理

16、马尔堡病毒形态特征研究

17、乙型脑炎病毒侵染细胞机制的研究进展

18、5种病毒性脑炎相关RNA病毒多重RT-PCR检测方法

19、肠道菌群调节制剂的研究进展

20、适用于分离人肠道中双歧杆菌的选择性培养基

21、益生菌与肠黏膜互作的分子机制研究进展

22、鲍曼不动杆菌的耐药机制及抗生素治疗研究进展

23、半枝莲总黄酮抗甲型H1N1流感病毒感染的药效学研究

24、轮状病毒感染相关受体的研究进展

25、分子生物学技术在肠道菌群研究中的进展

26、细菌黑色素的合成途径及生物功能研究进展

27、铜绿假单胞菌耐药率与生物膜形成能力之间的相关性分析

28、细菌鞭毛的致病性及其免疫学应用的研究进展

29、人腺病毒的研究进展

30、浅析埃博拉病毒致病机制

31、肠道病毒71型研究进展

32、抗生素对小鼠菌群失调腹泻肠道菌群多样性的影响

33、白念珠菌凋亡诱导研究进展

34、幽门螺杆菌基因分型的研究进展

35、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的研究进展

36、肺炎克雷伯菌耐药机制的研究进展

37、流感病毒在MDCK细胞中培养的条件优化

38、耐药鲍氏不动杆菌的耐药相关基因检测与聚类分析

39、埃博拉病毒研究文献计量与可视化分析

40、博卡病毒的检测方法概述

41、泛素-蛋白酶体途径在病毒感染中的作用

42、双歧杆菌降胆固醇的作用机制

43、幽门螺旋杆菌的研究进展

44、军团菌检测方法概述

45、噬菌体治疗中细菌对噬菌体的抗性

46、水产品中致病性弧菌分布及毒力基因特征分析

47、T细胞免疫在抗结核杆菌感染中的研究进展

48、新发高致病性禽流感H5N1病毒的致病性、传播力研究

49、空肠弯曲杆菌生物学特性及分型技术研究

50、冠状病毒附属基因功能研究

预防医学毕业论文选题

1、公众如何预防新型冠状病毒感染的肺炎

2、 儿童 乙型肝炎疫苗预防接种效果探讨

3、预防新型冠状病毒感染的肺炎口罩使用指南

4、健康 教育 在社区传染病预防控制中的应用效果评价

5、孕前检查预防出生缺陷的优生优育对策分析

6、预防接种薄弱区量化甄别与考核效果分析

7、出生缺陷的相关因素及预防现状分析

8、青少年流行性传染病的控制及预防方法研究

9、浅谈煤矿尘肺病预防及粉尘危害防治

10、呼吸道传染病的主要特点及预防控制办法

11、研究学校学生传染病的预防与控制 措施

12、探讨宫血宁胶囊预防药物流产后子宫出血的效果

13、室内装修过程中的职业危害预防

14、社区传染病的预防和控制措施

15、职业性布鲁氏菌病的预防

16、职业性中毒性肾病的危害和预防

17、靖江市儿童家长预防接种服务满意度调查分析

18、高危人工流产术后宫腔粘连的预防疗效观察

19、于计划免疫月龄前发生麻疹的预防措施分析

20、健康教育在儿童保健和预防接种中的效果分析

21、公共卫生管理在传染病预防工作中的作用

22、探讨调查细菌性食物中毒的病原菌与预防对策分析

23、儿童家长预防接种知识知晓情况分析

24、公共卫生监测对传染病预防控制的影响

25、瑞昌市新入学儿童预防接种情况及影响因素分析

26、20_-20_年禽流感流行情况及其监测和预防

27、中国破伤风免疫预防的现状、问题与展望

28、儿童计划免疫预防接种依从性影响因素分析

29、常见肾脏疾病儿童的预防接种

30、流行传染病的控制及预防方法探讨

31、芬吗通在临床中预防术后宫腔粘连的应用效果

32、一例接种卡介苗后疑似预防接种异常反应的分析

33、职业性急性钡及其化合物中毒的预防

医学检验免疫毕业论文题目

1、基于纳米颗粒的分子展示应用于超灵敏检测

2、SLE患者中几种新型自身抗体的检测及其临床诊断价值的探讨

3、多肽酶检测和细胞表面荧光标记的新方法研究

4、区域检验服务协同平台的设计与实现

5、胶体金喷膜仪的设计与开发

6、重庆市乡镇卫生院医疗资源的调查研究

7、基于氧化石墨烯和硫化铅纳米颗粒的荧光生物传感器研究

8、产气荚膜梭菌α毒素快速诊断金标试纸条的研制及初步应用

9、纳米粒子免疫层析法在检测异位妊娠和膀胱癌中的应用

10、现代医院检验科模块化设计研究

11、酶免工作站监控系统的设计与实现

12、乙型肝炎表面抗原胶体金免疫层析法血清快速测定的性能评估

13、基于微型压电与光谱生化分析系统的POCT新技术研究

14、长江三角洲地区犬猫皮肤真菌病调查及体外药敏试验

15、我国医学检验本科专业人才培养的问题与对策研究

16、基于电化学分子信标基因传感技术的HIV-1核酸检测新方法研究

17、Free β-hCG和PAPPA光激化学发光免疫分析试剂的研制

18、乙肝快速分析仪的研究与开发

19、阿托伐他汀对动脉粥样硬化患者外周血中PPAR γ的作用研究及相关炎症因子与动脉粥样硬化关系的建模分析

20、综合性医院医学检验资源优化管理研究

21、全自动多功能免疫检验过程关键问题的优化研究

22、HMGB1通过NF-κB激活TGF-β1诱导特发性肺纤维化发病机制的研究

23、若干病毒感染模型的动力学分析

24、现代综合医院检验中心空间设计研究

25、大型公立医院创建医学独立实验室可行性研究

26、高血压病证型与血清褪黑色素水平的相关性研究

27、医用臭氧与α-干扰素对照治疗慢性乙型病毒性肝炎

28、网织血小板在系统性红斑狼疮患者的临床应用

29、G公司第三方独立医学实验室服务营销策略研究

30、临床毛细管电泳的研究

31、基于光电检测与信息处理技术的纳米金免疫层析试条定量测试的研究

32、贫铀长期作用后的吸收分布特点及其主要蓄积器官的损伤效应研究

33、基于磁性微球的PMMA微流控免疫分析芯片系统的研究

34、hr HPV、L1壳蛋白、p16蛋白与宫颈病变的关系及诊断价值研究

35、76例急性白血病的MICM分型及预后

36、国产化学发光法诊断系统检测乙肝表面抗原的评价

37、蛋白A-藻蓝蛋白β亚基双功能蛋白的性质及其在免疫检测中的应用

38、上海市社区卫生服务中心检验开展现状及检验项目合理化设置研究

39、__医学检验集团发展战略研究

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基因突变对人类的影响论文1500字

人类基因突变被看做是与生俱来的,并且会伴随人的一生。有一些基因突变是很明显的,刚看到他的时候也就发现了,可是有些基因突变是可以隐藏起来的。有一些基因突变会随着人类的年龄增长而愈演愈烈,而有些是会导致人类死亡的。现在很多基因突变的事情都在世界上公布,人们可以从电视上或者网络上查到。下面我要介绍的这八种基因突变不知道你有没有听说过。

独眼畸形

这种天生的基因突变使得人们不能用两只眼睛来观察世界,这种畸形一般在250人中会有1人患有。脸部会模糊或者鼻子会失去作用,如果碰到这样的情况,一般家长会在孩子出生之前就会选择不要。这种人类基因突变都是遗传因素或者是因为母亲身体中摄入了毒素。

树人

从图片上可以看到,这个男子看起来就像是一个树人,手脚上都有树的分支。20年来,他一直都是这样的生活,他全身上下都有苔藓,这让他看起来像是在森林里生长的植物。这些在他身上的苔藓可能有12多磅而他总身重也就100磅。他走几步道就会觉得很累因为全身上下多余的体重很沉。有专家认为引起他这种基因突变的原因是一种HPV病毒。有两种HPV病毒,一种可以导致宫颈癌,而另一种可能导致皮肤上有苔,显然,他是属于后者的。当他进入青春期的时候,这些基因也跟随着他开始发展,这些东西是他所不能控制的。

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