一般情况下，论文目录有这几个部分：标题（总标题和副标题）、摘要、关键词（其中摘要和关键词还要有英文版）、目录、正文、结论、致谢、参考文献、附录（一般是对于一些不宜放入正文中、但作为毕业论文又是不可缺少的部分，例如问卷调查原件、数据、图表及其说明等）。
该目录必须符合全文的纲目。也就是，文章标题、分标题和目录之间有一个一一对应的关系。
主要目的是：①使读者在阅读文章前，对全文的内容、结构有个大概的了解，以便读者决定是否要读，要精读还是略读，等等；②便于读者选择文章中的某一论题。除了中心论者之外，长论文中也有很多分论点。
一般说来，篇幅较长的毕业论文，都没有分标题。设置分标题的论文，因其内容的层次较多，整个理论体系较庞大、复杂，故通常设目录。目录按章、节、条三级标题编写，要求标题层次清晰。目录中的标题要与正文中标题一致。目录中应包括绪论、论文主体、结论、致谢、参考文献、附录等。设置目录的目的主要是：1．使读者能够在阅读该论文之前对全文的内容、结构有一个大致的了解，以便读者决定是读还是不读，是精读还是略读等。2．为读者选读论文中的某个分论点时提供方便。长篇论文，除中心论点外，还有许多分论点。当读者需要进一步了解某个分论点时，就可以依靠目录而节省时间。目录一般放置在论文正文的前面，因而是论文的导读图。要使目录真正起到导读图的作用，必须注重：1．准确。目录必须与全文的纲目相一致。也就是说，本文的标题、分标题与目录存在着一一对应的关系。2．清楚无误。目录应逐一标注该行目录在正文中的页码。标注页码必须清楚无误。3．完整。目录既然是论文的导读图，因而必然要求具有完整性。也就是要求文章的各项内容，都应在目录中反映出来，不得遗漏。目录有两种基本类型：1．用文字表示的目录。2．用数码表示的目录。这种目录较少见。但长篇大论，便于读者阅读，也有采用这种方式的。
论文有一个目录很必要，它可以清楚展示论文各部分的内容。论文目录反映的是各章题目，应选择简洁易懂、能反映各章主题甚至结论的主题词做标题。这样不仅方便他人了解论文内容，自己也很清楚各章的主题结论。 不少学生使用教科书的方法起标题，这不太符合研究论文的要求。教科书目录的特点是领域导引，比如： 某学说的起源 某学说的代表人物 某代表人物的观点 观点比较 …… 而研究性论文的目录应当是问题导引，用各章节的观点或核心词汇组成陈述性题目，是个不错的方法，有助于一目了然。 如果是较短的论文，可以用二级标题给出目录，如果论文较长，可给出三级标题的目录。目录涉及小标题，它们应当能够反映论文的全貌。如果看了目录，还不清楚论文各部分究竟在讨论什么，这就是一个失败的目录。 目录要包含文中的图表、附录等。注意，在文中，一项图表应当在一个页面中完整展示，不能分开在不同的页面里。这些图表的格式应当遵从出版物的规范要求，有题目，有编号，上下有线分割，左右不封边，用灰、黑、白或者斜线格等区分类别，避免使用彩色。
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目录应独立成页，包括论文中全部的章、节（到三级目录即可）标题和所在页码，适当的格式缩进可以增进目录的美观和清晰。例如：
按照如此：序号，主要责任者，题名，其他题名信息，文献类型标志、文献载体标志，出版地，出版者，出版年，更新或修改日期，引用日期，获取和访问路径（网址）。注明：[N/OL]为[文献类型标志、文献载体标志]。
论文一般由题名、作者、摘要、关键词、正文、参考文献和附录等部分组成，其中部分组成（例如附录）可有可无。
要求准确、简练、醒目、新颖。
目录是论文中主要段落的简表。（短篇论文不必列目录）。
