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ACS(美国化学学会)合成生物学是一个同行评审 的,美国化学学会出版的科学杂志。它开始在2011秋季出版接受论文,而第一期月刊刊登在一月2012。[ 1 它涵盖了所有方面的合成生物学,包括分子,系统,和合成的研究。杂志主编是克里斯托弗 Voigt(麻省理工学院)。

重点:了解合成生物学的产生过程及其工程化特质;

难点:理解合成生物学的研究范畴

1910年,法国物理化学家Stephane Leduc首次提出“合成生物学”。

1980年,“合成生物学”第一次被作为文章标题出现在学术期刊上。

2000年以后,合成生物学的发展才真正到了。

2000年,Eric Kool重新定义了“合成生物学”,是基于系统生物学的遗传工程,标志着这一学科的出现。

上图来自《行研 | 合成生物二次“鲤”跃龙门,蓄势待发》

定义:综合来讲,合成生物学是在现代生物学和系统科学以及合成科学基础上发展起来、融入工程学思想和策略的新兴交叉学科,通过将自然界存在的生物元件标准化、去耦合和模块化来设计新的生物系统或改造已有的生物系统(很难单一定义)。

英国皇家工程院:合成生物学旨在设计与制造以生物为本质的组件、新装置与体系,同时也对现有的、自然界中存在的生物体系进行 重设计 。

重要原则:标准化、去耦合和模块化(美国斯坦福大学Drew Endy教授提出)。

研究策略:侧重于“自下而上(bottom-up)”的理念,从元件、模块到系统,对已有的生物体进行改造或设计合成自然界不存在的人工系统,打破了传统“自上而下(top-down)”方法的诸多限制。

研究范畴:生物基因组合成、基因组的最小化、基因线路的设计与构建、合成代谢网络生产药物与生物基产品或材料、人工合成生态系统(多细胞体系)

(1)研究领域和研究内容将有新的发展

(2)相关产品的开发将更为广泛

合成生物学杂志官网

“合成生物学是21世纪初新兴的生物学研究领域,是在阐明并模拟生物合成的基本规律之上,达到人工设计并构建新的、具有特定生理功能的生物系统,从而建立药物、功能材料或能源替代品等的生物制造途径,我国必须重视和加强这一领域的研究与开发。”近日,在以“合成生物学基础前沿问题”为主题的第144期东方科技论坛上,来自全国各地60多位两院院士和专家学者发出呼吁。中国大会执行主席邓子新院士认为:“在合成生物学在全世界蓬勃发展的历史性机遇面前,探讨在我国开展合成生物学的研究对象与最佳切入点,发展和建立合成生物学新理论、新方法及相应的技术支撑体系,这对提升我国现代化生物技术水平、抢占合成生物学研究制高点有极大的意义。”与会专家结合国际合成生物学发展动态及我国相关领域的研究基础,探讨我国开展合成生物学的可行性、现阶段的主要目标和任务,就合成生物学中核心元件(如基因线路、酶、代谢途径等)的标准化以及合理组装方式,建立具有可预测性和调控性的代谢途径,构建具有特定功能的新生物体等进行了深入研讨。自2000年《自然》(Nature)杂志报道了人工合成基因线路研究成果以来,合成生物学研究在全世界范围引起了广泛的关注与重视,被公认为在医学、制药、化工、能源、材料、农业等领域都有广阔的应用前景。国际上的合成生物学研究发展飞速,在短短几年内就已经设计了多种基因控制模块,包括开关、脉冲发生器、振荡器等,可以有效调节基因表达、蛋白质功能、细胞代谢或细胞间相互作用。2003年在美国麻省理工学院成立了标准生物部件登记处,目前已经收集了大约3200个BioBrick标准化生物学部件,供全世界科学家索取,以便在现有部件的基础上组装具有更复杂功能的生物系统。中国大会执行主席杨胜利院士在报告中指出,2006年以来,合成生物学发展又进入了新阶段,研究主流从单一生物部件的设计,快速发展到对多种基本部件和模块进行整合。通过设计多部件之间的协调运作建立复杂的系统,并对代谢网络流量进行精细调控,从而构建人工细胞行为来实现药物、功能材料与能源替代品的大规模生产。2008年,美国Smith等人报道了世界上第一个完全由人工化学合成、组装的细菌基因组。今年8月份,他们又成功地将该基因组转入到Mycoplasma genitalium宿主细胞中,获得了具有生存能力的新菌株。该研究使人工合成生命这一合成生物学终极目标取得了历史性突破,为创造可用于生产药物、生物燃料、清理毒性废物等方面的人工基因组奠定了基础。与国际上合成生物学的飞速发展相比,中国在此领域的研究还处于起步阶段。在国际上有影响的相关重大成果仍不多见。但是,我国在合成生物学所需的相关支撑技术研究方面并不落后于国际主流水平,如大规模测序、代谢工程技术、微生物学、酶学、生物信息学等方面均有良好的基础。如何对现有研究力量进行整合,充分发挥在相关领域已有的良好研究基础,从医药、能源和环境等产业重大产品入手,抓住合成生物学的核心科学问题,创建可控合成、功能导向的新代谢网络和新生物体,引领中国合成生物学的原创研究和自主创新,是目前亟待解决的问题。”中国大会执行主席赵国屏院士在以《合成生物学——从科学内涵到工程实践》为题的报告中提出,合成生物学是继系统生物学之后,生物学研究思想在从“分析”趋于“综合”、从“局部”走向“整体”的认识基础上,上升至复杂生命体系“合成、构建”的更高层次;也是继以“原位改造与优化”为目的的基因工程技术和以“数据获取与分析”为基础的基因组技术之后,生物技术上升至以工程化“模型设计与模块制造”为导向的更高台阶。利用合成生物学实现‘人造生命’,是通过学科交叉,进一步发展系统生物学的一次科学思维革命,将为生物学基础研究提供崭新的思想武器。利用合成生物学方法和理论,对生命过程或生物体进行有目标的设计、改造乃至重新合成,创造解决生物医药、环境能源、生物材料等问题的微生物、细胞和蛋白(酶)等新“生命”,可能带来新一轮技术革命的浪潮,对于解决与国计民生相关的重大生物技术问题有着长远的战略意义和现实的策略意义。“它有助于人类应对社会发展中面临的严峻挑战,从而从根本上改变经济发展模式,在带来巨大社会财富的同时,促进社会的稳定、和谐发展。中国科学院微生物所研究员马延和、清华大学教授林章凛、南开大学教授王磊、山东大学教授祁庆生和复旦大学/西藏大学教授钟扬等专家建议,针对我国在能源、环境、健康等方面的需求与挑战,要聚焦若干重要的生物学体系,实施面向生物医药、生物能源和生物基产品等重要生物产品的合成生物学理论与技术的基础研究,设计并合成相关的细胞工厂和分子机器。“在具体实施中,一方面要建立合成生物学工程技术平台和研究实验体系,实现关键工程科学问题的重大突破,另一方面要揭示细胞工厂和分子机器的运行机理和构造原理,实现优化设计,提高元件、网络的合成能力和调控能力,尽早拿出实在的成果来。”

个人认为前者更好一些。合成生物学展现出的巨大潜力举世瞩目。2004年美国麻省理工学院出版的《Technology Review》将合成生物学评为将改变世界的十大新兴技术之一。英国《自然》杂志于2007年以“合成生物学:设计生命”(Synthetic Biology: Design for Life)为题刊文,认为人类已经进入了“为了某个实用目的而进行基因组工程改造”的时代。美国生物经济研究协会于2007年发表的报告甚至认为未来合成生物学技术将会比重组DNA技术发展更快。必须注意到,在新技术蓬勃发展的时候,出于乐观和兴奋,许多研究者和相关专业人员都倾向于认为新技术是可控的,其扩散是可以预计的。然而,成瘾化合物合成技术与核技术的历史已经告诉我们,我们必须警惕新技术可能带来的社会风险。与此二者相比,合成生物学带来的社会风险甚至更大。

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这个科普贴很详细,网站很多,有用户名,有密码

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推荐《橡胶工业》,科技核心期刊,以下是详细收录情况:

《橡胶工业》被以下数据库收录:

CA 化学文摘(美)(2014)

北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊:

1992年(第一版),1996年(第二版),2000年版,2004年版,2008年版,2011年版;

期刊荣誉:

百种重点期刊;中科双奖期刊;Caj-cd规范获奖期刊;

中文化学化工核心期刊

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40.无机盐工业

41.过程工程学报

你到中国石油和化学工业联合会的网站上查一查,也可以到中国橡胶协会网站上查一查,还是比较多,有国家级的,省级的,可能还有大型企业出的;有橡胶类,轮胎类、再生胶类、管带类、橡胶运输带类等等。

适合合成生物学投的英文期刊

国内的《有机化学》,上海有机所的,不收审稿费。挺快的听说。

Bio informatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。2012年度IF=5.468 另外还有Briefings in Bio informatics,这个杂志每年的发稿量少,最近几年IF波动很大,第一年24+,后来到9+,2012年度IF=5.202。 稍次一点的杂志,如BMC Bio informatics,也是生物信息学的专刊。2012年度IF=3.447 对于计算向的生物信息学,PLOS Computational Biology是一个很好的期刊。2012年度IF=5.215 除此之外,Nature Method,也会有生物信息学相关的方法发表。2012年度IF=19.276。PLOS Biology也是很好的杂志,2012年度IF=11.452。PLOS One也会经常有生物信息学文章,但被批灌水太多,算不得牛刊,2012年度IF=4.092。生物信息学相关的文章不一定要发到专门的生物信息学杂志,因为生物信息学作为一个工具,已经融入到很多生物问题的研究中,而不仅仅是一门孤立的学科了。

这类没有自己生产的bench data的文章通常不太可能发布到最最顶尖的杂志,比如Nature或者Science的主刊。投文章时可以分为四个梯队:第一梯队:Nature Methods, 只要能发上面基本上就保证了关注度和引用,也会有很多人follow的;Genome Research, 很老牌的杂志了,文章的质量都很高,当然了editor大部分文章都是直接拒的。Nature Biotechnology,纯方法的文章很难发上来的,一般都是很大的组既有方法又有实验数据。楼主可参见Clinks和That那篇文章,很多个co-author,做了非常多的测序实验来验证。Nature Genetics,同样,很少有纯方法的文章,除非你在圈内已有很大影响力,比如CADD那篇文章。上面有一大堆做统计和GWAS的人,感觉不太欢迎machine learning的文章。第二梯队:Genome Biology, 比较新的杂志,近几年有一些不错的文章。Nature Communication, 非常新的杂志,基本上每期都会有一些生信类的文章。感觉影响因子在不断上涨,顶着Nature的头衔自然不会缺少好文章。审稿周期非常久,不建议需要短时间内发文章毕业的高年级博士。第三梯队:这一类别的杂志就很多了,Bio informatics曾经是最好的生信杂志,近几年因为文章数量太多灌水严重影响因子有所下降。Nucleic Acid Research也是专业的生信杂志。除了这些,Plod系列的Plod Genetics和Plod Computational Biology也都是接受生信文章的不错的杂志。Human Molecular Biology近几年也开始接受生信文章。第四梯队:如果被之前所有杂志都拒了,那基本上在国际上能够得到认可的杂志也就不多了。Explosion和BMC系列是最后选择了。

晚上好! 给您推荐- 《International Journal of Biology》中文译名:国际生物学期刊 是经加拿大国际期刊管理局批准出版的英文学术期刊,已被加拿大国家图书档案馆收藏 还有《:Journal Abbreviation 》

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