区别如下。1、存在位置不同。这是脚注、尾注和参考文献最明显的区别,脚注实在每个页面下方,对当前页面某些内容的具体解释;尾注是在文章的最后,对论文某些内容的注释;参考文献是作为论文的主要内容的一部分,也是在论文的最后出现。2、作用不同。脚注和尾注是注释的一种,是对论文内容的一种补充添加,保证读者在阅读过程中更加清晰的看懂相关内容;而参考文献是论文内容的一部分,通过对参考文献的讨论和分析,进一步说明论文的主要内容和观点,对比参考文献所得结果的不同或相同,从其他角度分析自己的研究,参考文献的存在不仅是论文对他人的引用和讨论,也从某一角度说明论文作者对当前领域的了解程度,甚至论文的质量也取决于参考文献的呈现。很多人将尾注和参考文献混为一谈,主要由于二者都是在文章的最后,但其实尾注和参考文献的作用有本质上的区别。但二者的位置的确会引发很多混乱,因此大多数院校和科研研所对论文的尾注都不做要求,只规定了参考文献的写作要求。3、格式不同。脚注和尾注根据需要标注内容的不同,所需要的格式也不尽相同。除了期刊论文发表时,需要在第一页脚注标注论文的通讯作者、第一作者及其年龄、职称、研究方向等信息。此外并没有固定的要求脚注和尾注需要哪些固定格式。参考文献对比注释则需要的要求更多,在学术论文写作中,不仅严格规定了参考文献的字体、字号以及在文中出现的形式,甚至很多院校和期刊要求参考文献需要达到一定数量,并且需要保证一定中英文论文参考比例,保证论文的学术性。4、对论文的影响脚注、尾注和参考文献是论文的一部分,但由于学术论文有字数和查重等要求注释和参考文献会对其产生不一样的影响。首先无论是注释还是参考文献都算作论文字数,但在统计论文主体字数时,参考文献是不算做论文字数的,但脚注和尾注算。在查重中,三者产生的影响较大,尾注和脚注如果在文中利用固定格式标注清楚,是不算做重复的,但参考文献如果是原文引用,就会提高重复率。因此在论文写作时,需要注意参考文献的引用方式,尽可能的不要使用原句。