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社区图书馆对于提高市民的综合素质,推动地方经济、科技、 文化 发展,促进地方物质文明、精神文明和政治文明建设都起着重要作用。下文是我为大家整理的关于社区图书馆论文 范文 的内容，欢迎大家阅读参考! 关于社区图书馆论文范文篇1 浅谈社区图书馆建设 摘要：从宏观视角，通过对城市和谐社区建设过程中，社区图书馆(室)服务职能和管理现状的分析，诠释了社区图书馆(室)的功能，提出管理模式，以促进社区图书馆的建设与完善。 关键词：社区图书馆;管理;方策研究 1 社区图书馆建设现状 社区图书馆(室)是文化事业、公共文化设施的重要组成部分，在社区开展图书馆服务是图书文化融入社会、参与营造良好文化环境和文明社会风尚、拓展社会服务的切入点。目前社区图书馆(室)建设存在的主要问题是：服务对象不明确，开放程度不够;服务的技术手段落后，跟不上信息技术发展的进程;服务阅读的项目、手段单一，不能适应读者不断变化的、多层次的阅读需求;仍明显具有图书馆(室)传统的内向服务特征和封闭性。因此，必须正确认识社区图书馆建设的意义，树立正确的建设观，使社区图书馆的建设落到实处，发挥应有的功能。 2 社区图书馆建设的目的 社区图书馆(室)建设的目的主要体现在三个方面： 社区图书馆(室)应该成为社区的信息中心 身处信息社会，社区居民需要一个与外界沟通的畅通 渠道 ，需要一个获取信息的平台和中心。它不仅具备图书馆的传统服务功能，通过借阅使社区居民获取信息，还应当满足社区居民不同文化和信息的需求。如：提供社区心理咨询、劳动就业咨询、国家政策咨询等功能，满足社区居民多层次、多方面的信息需求。 社区图书馆(室)应成为社区文化 教育 场所 社区文化教育是一种内容广泛的教育，既包括学校教育，也包括社会教育和 家庭教育 ;既有普通教育、职业教育和成人教育，也有正规教育和非正规教育;既有青少年的教育，也有在职人员的继续教育和离退休人员的休闲教育。因此，社区图书馆(室)要通过各种渠道，满足读者借阅图书、查找信息的需求。只有完成这些教育功能，社区图书馆(室)才能成为社区教育的培训基地与场所。 社区图书馆(室)应成为社区居民文化休闲的场所 社区图书馆(室)还应强化文化休闲的服务功能。伴随着社会的进步与发展，图书馆的休闲功能日益重要，这也是提高居民文化素养，提升生活质量的重要手段。社区图书馆(室)的服务管理应当充分体现这种功能。 3 社区图书馆建设的模式 为了转变服务角色，优化服务资源，深化服务内容，完善服务设施，实现知识的共建共享，社区图书馆(室)建设必须变革与创新服务模式，建立与社区实际情况相适应的知识管理模式和服务模式。 海外 经验 和模式 美国、日本、新加坡等国家的社区图书馆在服务方面非常出色，不仅能够满足当地居民的阅读需求，还把服务范围扩大到社区新闻发布、公民纳税指导、气象与旅游指南等方面，成为居民了解社区、融入社区生活的门户。 (1)美国模式 美国的社区公共图书馆是世界上办得最好的，有上万家，惠及全美所有人口，其藏书量也非常惊人。美国九成以上的社区公共图书馆接通了互联网，八成以上的社区公共图书馆为读者提供免费上网服务，七成以上的社区公共图书馆提供网上借阅服务。美国的社区公共图书馆根据居民年龄层次的不同，分为成人阅览区、青少年阅览区和 儿童 活动阅览区。在美国办个图书馆借阅卡非常简便。只要出示最近的水电或者电话账单，再加上驾照，证实你是该社区的居民，即可免费办理图书借阅证。 (2)日本模式 日本每个社区均设有图书馆。政府在社区建设中，负责图书馆的规划并按规定提供经费，而日常事务由财团法人管理。这个财团法人是管理社区福利事务的社会团体，政府为其提供经费，并制定管理法规，每年进行审计监督。 (3)新加坡模式 政府颁布《社区住宅规划法》，规定每个社区必须建立图书馆，由国家图书馆和社区基金会联合设立。其运营经费由政府财政补贴，管理借鉴分馆制模式，由国家图书馆管理局统一规划、组织、管理。 (4) 香港模式的社区图书馆 发达国家和港台地区的大型图书馆数量极少， 而社区图书馆却星罗棋布，通常出家门没几步路就能找到一个， 十分便利。相比内地，香港的社区图书馆可谓发展得很有特色，值得借鉴。 (一) 香港地区行政的参与 香港公共图书馆有40多年的历史，由香港特别行政区康乐及文化事务署领导。香港政府为了鼓励市民多参与地区事务， 更有效地协调政府在各地区层面提供的服务及设施，便在各地区成立了区议会的组织，致力改善各区环境市容，促进社区的各种文娱康乐活动。2005年， 香港特别行政区行政长官的施政 报告 内一项重点便是加强地区工作，将特区的施政贯彻到基层，以提升在地区层面上解决问题的能力，帮助处理好民生问题，加强小区建设和推动地区公益活动。配合有关的施政理念， 特区政府便将区议会的功能扩大，并且将一部分原来由政府管理的地区性设施开放，让各个区议会参与管理除了社区会堂、 休憩场地和体育场所、 游泳 池以外，还有的便是各地区的图书馆了。 (二) 香港社区图书馆的伙伴计划 多年来，香港公共图书馆通过团体借阅服务及流动图书车为各社区的市民提供服务，但受时间、地域或其他条件的限制仍有将近一半的人口没能享用图书馆的服务。 因此在2005年底， 香港公共图书馆与社区合作， 推出了社区图书馆伙伴计划。由社区向香港公共图书馆先申领一张团体借书证，得到批准后，图书馆向社区提供专业的意见及指导，例如如何为特别的读者群诸如儿童、青少年、家庭主妇及长者等选择适合的图书，如何设计阅读区，如何建立书籍流通制度，如何向读者提供参考咨询等等。在一切硬件就绪后，香港公共图书馆便会向社区图书馆外借一批图书馆资料，数量由该馆的规模或个别需求而定，而香港公共图书馆亦会协助定期更换这批外借资料。香港公共图书馆一般只会要求开办机构能够公开地将外借的图书馆资料免费供市民或其服务社群使用，至于社区图书馆的运作模式、规则及开放时间等，则通常由开办机构在参考图书馆馆长的专业意见后自行订立，而社区图书馆亦可因既有的资源， 自行增添图书馆的设施和图书数量。 计划推出后，各区区议员普遍十分支持，根据地区的需求，成立不同主题的特色社区图书馆，建立阅览室， 增购报章杂志，举办读书会，推行阅读卡计划等，广泛地落实社区图书馆伙伴计划，务求能够使良好的阅读气氛渗透到每个社区角落，照顾到不同社群的需要。 (三) 社区图书馆的便利服务 社区图书馆建立后， 由于有完善的网络系统，社区居民在家中就可以进入香港公共图书馆的图书检索系统检索。通过检索，读者可清楚地看到一本书的作者、出版社、页数，以及该书是否已被借出，或在哪间图书馆的书架上放着等信息。还书的程序更方便，把书送到遍布全港的任何一间社区图书馆的还书柜台即可。如果社区图书馆未上班，把书塞入还书柜里也行。 香港的社区图书馆除了图书馆的基本服务外，根据具体情况，有的还兼营便利店。这类设在社区图书馆的便利店，一般都会做充分的市场调研，根据当地社区主要读者情况，安排图书配置。例如在老年人居多的社区，藏书就以中医药及保健食疗为主，还经营老年特色的商品。如果有老人想借别的图书馆的书，还可通过社区图书馆统一借还，十分便利。 (四) 义工成为社区图书馆的风景线 香港的义工组织运作得很成熟，不少市民都愿意做义工。而在社区图书馆，不少社区居民就充当着管理员的角色， 成为一道风景线。他们自发地帮助整理资料、 排列书籍、管理阅览室，规划推展各项宣传活动等。义工作为具有双重身份的群体，既是图书馆的读者，又是图书馆的员工，因此既能站在读者的立场直接地向图书馆表达他们的诉求，同时又能体会到图书馆工作的不易。 4模式借鉴与思考 社区图书馆作为居民身边的图书馆所具有的优势是不可替代的， 借鉴香港社区图书馆的办馆模式，社区图书馆要改变现状，笔者认为有以下几条发展对策： 加大宣传力度，争取各级政府的支持 没有社区图书馆的社区建设是不完善的，对社区图书馆的认识有一个不断深化的过程，其建设又是一项涉及人财物的系统工程， 没有政府的大力推动，单靠哪个方面和哪个部门的努力，都难以把这件事情办好，就是建立起来了，也难以做到可持续发展。应加大宣传力度，积极争取各级政府，在舆论导向、 政策、经费、人员等方面赢得政府的支持，使社区图书馆作为一项惠及广大社区居民的文化事业，列入社区建设的重要议事日程，全面进行规划，切实增加投入。 发挥自身优势，吸引社区居民 社区图书馆的建立，是为了激发居民的阅读热情、普及科学文化知识、丰富社区文化生活，因此社区图书馆可通过社区广播、电视、宣传窗口、社区报刊、网络等各种形式，多渠道、全方位宣传，帮助社区居民树立信息思想观念。还可开展形式多样的 讲座、 各具特色的读书活动，吸引社区居民参加，不断增强图书馆的影响力和凝聚力，以此培养居民对社区图书馆的认同和热爱，使人们感到在日常生活中离不开图书馆，逐渐对图书馆产生一种依赖感，进而引起社会对社区图书馆的重视。 走资源共享之路，整合信息资源 对于社区图书馆来说，经费有限，要满足居民不断增长的信息需求， 是一个难题。因此，社区图书馆不能以常规 方法 来解决，要把自己融入社区之中，让社区内的成员参与到社区图书馆的建设中，将社区 图书馆建设成为社区资源整合的平台。 社区图书馆可争取公共图书馆、高校图书馆或有实力的信息服务机构的支持， 在信息资源的建设及信息服务上进行协调和合作，走资源共享之路。还可吸引社区内的机构和社会团体、个人共同建设社区图书馆，充分调动社区内单位、个人的积极性，促进社区图书馆的信息资源建设。 走商业运作与公益性相结合的道路 社区图书馆可寻求和社区及居民生活有密切关系的企业合作。如物业管理公司，为他们搭建一个物业与居民的交流桥梁，可以更好地协调物业和业主的关系。由物业出面联系企业，可用企业的名字命名社区图书馆，一方面提高企业的知名度和美誉度， 另一方面也提高社区图书馆的知名度和企业兴办热情。多方位地争取各种捐赠，如借用公共图书馆淘汰下来的书架，利用其 收藏 的闲置书刊资料，鼓励社区商户、居民捐资、捐书等。还可借鉴香港社区图书馆，经营一些有特色、居民需要的商品，与馆藏优势相结合，以公益性为主，有偿服务为辅，共同建设。还可开办社区读者俱乐部，与电台、电视台或企业合作，举办各类活动，提供场地，让他们更能走近社区居民。 创造条件，借助各种人才资源 作为在财政支持、自身经济实力等方面都相对弱小的社区图书馆要吸引人才几乎没有任何优势，但社区图书馆应创造条件，借助各种可以利用的人才资源来开展服务。如对社区图书馆现有的管理人员进行相关知识的培训， 使他们能正确掌握分类编目、科学排架、电脑检索等。找人才，让他们参与到社区图书馆的建设中来，成为社区图书馆开展服务的顾问和指导， 义务承担部分工作， 解决人手不足的问题。可以与义工组织联系，招募义工参与社区图书馆的服务。在寒暑期，还可以招募大中学生担当临时的图书管理员，使他们增加 社会实践 。 社区图书馆的服务既亲民又复杂， 如果照搬传统的公共图书馆建设模式，在目前投入不足的情况下，道路只会越走越窄，只有把它当作是一项需要长期经营的事业来做， 突破传统，循序渐进，有计划、有针对、 有选择地开展建设，才会有广阔的发展前途。无论是总分馆或是托管型的办馆模式，都应做必要的可行性调查，采纳适宜的建馆模式。要根据社区居民的人员结构、信息需求、文化层次、环境条件等特点进行综合考虑， 有针对性地提供文献信息资源。开办有特色主题的社区图书馆，如音乐图书馆、保健图书馆、 玩具图书馆等，充分考虑图书馆的利用率。 关于社区图书馆论文范文篇2 谈民国时期的社区图书馆 摘 要：冯玉祥主豫期间对文化教育事业极为重视。在他大力提倡和支持下，把公共图书馆扩充扩展，在各社区新建了很多平民图书馆，以启民智。其实，那就是现代意义上的社区图书馆。冯玉祥主豫时期社区图书馆的建设，使开封公共图书馆事业空前繁荣。对民众的知识水平和精神面貌，乃至对当时社会都影响至深，特别是对当代和谐社会建设有极大的现实意义。 关键词：冯玉祥;图书馆;社区;和谐社会 社区图书馆是为一定地域内的所有居民服务的具有公益性、教育性、休闲性等特征的文献信息集散场所。其功能主要是培育社区文化、传递实用信息、开展社会教育、开发闲暇时间。社区图书馆是“建设全民学习、终身学习的学习型社会”的重要平台，是社区居民阅读休闲、增长知识的场所。发达国家的社区公共图书馆已经非常成熟，大量的国有公立社区图书馆在政府的支持下建设和开放。中国的社区图书馆也是数量剧增，图书馆由“藏书”的职能改变为“社会教育性质”的职能，它的地位和作用将会越来越重要。近几年，学界就社区图书馆的功能、发展模式、资源共建共享等问题发表了不少较有见地的观点。但是，对于中国社区图书馆的发端与雏形，却很少有人论及。其实，早在冯玉祥执政河南时期，在他的提倡和支持下，开封的社区图书馆已经发展得相当繁荣。 一、冯玉祥主豫时期重视文化教育事业，提倡知识普及 冯玉祥自谓平民将军。他出生于下层社会，深谙无文化知识之苦，在他主政时期，他重视人才培养，注重提高民众文化素养。 冯玉祥曾两次主豫，他对当时河南的文化教育事业给予了大力支持。第一次主豫是1922年5月至10月。当时他制定了治豫的十项大纲。其中有一条是：“推行义务教育，以开民智”。他抄没军阀赵倜全部家产，多用作平民教育和开办平民工厂。第二次主豫是1927年夏到1929年春。他以第二集团军总司令名义兼河南省主席后，推出了“建设新河南”的方针，励精图治，推行“革旧制”、“除迷信”、“提倡科学”、“重视教育”等一系列 措施 ，用以提高民众知识水平，形成良好社会风气。 冯玉祥非常支持河南教育经费独立。在他的倡议下，1922年8月省财政厅决定划出全省的契税收入作为教育教育专款。10月又设立河南省教育专款监理委员会专门负责教育经费的管理和分配，使教育经费独立，专款存储，各县知事负责催征。1927年冯玉祥又将河南教育专款监理委员会扩大为河南教育款产管理处，分评议、监察、管理三部。10月，省教育厅设社会教育推广部。同年，冯玉祥又下令调整了教育款产管理处，裁撤各县契纸发行所，使各县契税局职权得到统一，教育基金得以保证和平均分配。1928年10月冯玉祥的指示划定教育经费金额的10%-20%专用作办社会教育。这使社会教育在经济上得到保证。由于采取这些措施，不仅保证了教育款项专款专用，而且使教育经费逐年增加，由每年收入六七十万元，增加到八九百万元，从而促进了河南文化教育事业的发展。 二、社区图书馆是冯玉祥普及文化教育的主要举措 在军阀混战时期，当局很难顾及社会教育。民众的教育与图书馆事业的发展是分不开的。图书馆是对于平民教育不可分离的组成部分。开封是当时河南的省会城市，原有的公共图书馆仅河南图书馆一处，且规模较小。冯玉祥他认为，当时的公共图书馆已远不能满足社会的需要。于是就以“开封居民繁多，非有大规模之图书馆，不足以符市民读书之用”为由，专门令省财政厅拨洋5万元，作为河南图书馆的扩充经费。在他的主张下，又新建了开封平民图书馆、中山图书馆、金声图书馆、开封市民图书馆等图书馆。这些图书馆均由政府有关部门具体管理，按月拨给经费，一定规模。尤其是冯玉祥主持设立的平民图书馆，掀起了各区民众的读书热潮，各街、区也先后设立平民图书馆，以供民众学习新知识，接受新思想，开阔眼界，促进良好社会风气的形成。关于平民社区图书馆实践，具体情况如下： 1927年12月，冯玉祥下令把开封中山市场西厢房改建为平民图书馆。馆内放置书柜十余个，阅报桌二张、报架四个、办公桌二张、阅书桌椅数十套，有书籍数百种、报纸数份，关于公民应看的书籍及设施无不齐备。与此同时，在开封各区、街边也先后设立多处平民图书馆。比如在教育厅街、财政厅街、东区白衣阁、北教径胡同等处，设有五个平民图书馆;在学院门、山货店街、南区袁公祠处，设有三个平民图书馆;在南关区王母庙观音堂等处，设有南关区两个平民图书馆;在省政府街、小衙门街、大厅门、后营门、西区烈士祠、中山中街设有八个平民图书馆;在贡院街、无量庵、东棚板街、建设厅街、刷绒街、老府门、法院街、北区三元宫、北仓等处，设十个平民图书馆。这些数目繁多的图书馆，虽然条件相对简陋，但是由于有政府拨发的专门经费，购置有一定数量的图书，报刊及相关设施，也是规模相当，生命力极强的。 冯玉祥主豫时，把平民图书馆(室)建立在开封的各街、区。这些具有社区图书馆形式的“平民图书馆”与现代的社区图书馆在规模上也许相差甚远，但它们的建立初衷与教育功能却惊人地相似。可以说“平民图书馆”就是现代意义上的社区图书馆。这平民图书馆的创办，标志着当时在开封已经形成了初步的基层社区图书馆网络。 三、民国时期创办社区图书馆的意义 在开封的历史上，冯玉祥可以说是图书馆事业之父，在他主豫期间开封的图书馆事业在二三十年代进入了一个鼎盛时期，冯玉祥为河南的图书馆事业创造了一个传奇。在他的大力提倡和支持下，不但把开封原有公共图书馆进行进一步扩充，而且在各社区新建了一大批平民图书馆，使社区图书馆事业进入空前繁荣时期。当时建立众多平民图书馆，是中国图书馆史上的伟大创举，具有突出的历史性贡献。 (一)体现了老一辈革命家普及知识的远见思想 冯玉祥主张把平民图书馆建立在开封的各个街区，初步形成了基层社区图书馆网络。他的图书馆进社区实践，比当代主政者提出“图书馆进社区”理论早了半个世纪之多。可见，冯玉祥将军是多么有远见。社会中的教育观念是那个社会的价值观的反映，一个人的教育观念是一个人本身的价值反映。冯玉祥的教育观念体现了他崇尚民主，崇尚人人平等的思想。他对图书馆事业的一贯热爱与支持，这与他个人的学识、眼界与修养是分不开的。冯玉祥眼界开阔，提倡科学，重视文化教育，关注平民教育。在他的支持下所创办的平民图书馆，对于传播新知识新思想，提高民众素养等方面有不可磨灭的贡献。在活跃群众生活，密切邻里关系，增强社区活力，满足社区居民崇尚文明、健康娱乐、增长知识等方面发挥了积极作用。 (二)为当代社区图书馆发展提供了历史借鉴 看一个城市是否具有吸引力，是否具有竞争力，很重要的一点是看其文化资源、文化氛围、文化发展水平。可以说，在一定程度上，城市以文化论输赢。社区是城区的基本组成单位，社区文化建设是城市综合实力的体现，也是社会文明的一个重要内容。社区图书馆作为民众一生继续教育的手段，是平民教育取得进步的重要保证。冯玉祥提倡图书馆进社区，主张“凡认识文字者，均可来馆自由阅览”，此举深受百姓欢迎。他的图书馆进社区的方针举措，是中国图书馆学方面的可贵财富。他的普及文化知识的教育理念，是科学而前卫的。由于冯玉祥主豫时期大力发展社区图书馆，使开封形成了良好的社会文化氛围，这对当代社区图书馆建设具有积极的借鉴意义。 (三)冯玉祥是和谐社会建设的先驱之一 冯玉祥主豫时期通过图书馆这样一个社会大学，培养、引导人们用宽容的态度看待和处理各种问题，进而形成尊重劳动、关爱他人、维护公平、相互关爱、团结互助的社会风尚。这与当代和谐社会、学习型组织的建设思想不谋而合。和谐社会要求人与社会之间高度协调，人与人之间团结友爱。构建社会主义和谐社会就是通过对各种利益关系、社会矛盾的调整和处理来实现社会的和谐与融洽。实现这个目标，必须有一个学习型社会做保障。在当时来说，社区图书馆是冯玉祥重视文化教育理论与实践相结合的产物。社区图书馆可以发挥引导民众积极学习、努力向上，提高其政治文化素质的作用。社区图书馆是社区居民更新知识、学习新技术的精神家园，是建立学习型社会的基础。冯玉祥是和谐社会建设的先驱之一，他的社区图书馆实践，为我们留下了一份宝贵的文化遗产，必将对现代图书馆事业的发展产生深远影响。 (四)为建立学习型社会提供历史素材 多数西方人是虔诚的__徒，他们主张“活到老，学到老”。《圣经》里说，每一个基督徒，无论贫穷或富裕，健康或多病，都应日日坚持修行和学习。无论谁都应该受教育，学校教育只是教育制度的一种，社会教育是一个人终身不断的事业，人人都有学到老和做到老的权利与义务。目前我们国家和社会也在呼吁建立学习型社会，国家对于教育的重视程度加深，投资力度加强。对个人来说，每个人对接受教育重要性的认识日益增强，都深知获得知识的重要性。终身学习接受教育已成为各界人士的共识。而在冯玉祥主豫时期，学习型社会的风貌已初见端倪。由于冯玉祥的积极呼吁，图书馆雨后春笋般地建立起来。几年之后，人们对于书籍的热爱逐渐培养起来，阅读习惯逐渐形成。随着设施的日趋完备，图书馆在文化教育功能结构中占有一席之地，不再是为设立而存在，而是变成民众本身的一种自主需求了。大量阅读图书对于民众的民主意识、创新观念、求是精神等等方面，都起到了一定的促进作用。 开封图书馆的长足发展是在冯玉祥主政河南之后才得以实现的。他为省会开封及河南各县市的平民图书馆建设方面做出了积极的努力。开封众多的平民图书馆逐一建立并免费向公众开放。逐渐满足了那些无法得到图书，但对知识充满渴望的人的需求。随后，信阳、漯河、南阳等城市纷纷步其后尘，建立平民图书馆。因此，平民图书馆已成为研究冯玉祥本人及教育思想体系中的重要组成部分。当然，由于时代所限，冯玉祥不可能明确提出当今意义上的社区图书馆建设思想，但是，冯玉祥对于河南社区图书馆的形成和影响永远不可忽视。 参考文献： [1]冯玉祥.冯玉祥 日记 [M].南京：江苏古籍出版社，1992. [2]李暖.冯玉祥主豫时期开封公共图书馆发展[J].黑龙江史志，2009(6). [3]屈春山，张鸿声.老开封[M].郑州：河南人民出版社，2005. [4]开封市图书馆.开封图书馆志[Z].1988. [5]李元俊.冯玉祥在开封[M].开封：河南大学出版社，1995. [6]高兴亚.冯玉祥将军[M].北京：北京出版社，1982. [7]陶善耕.河南图书馆事业冯玉祥时代[J].黄河科技大学学报，2006(2). [8]崔红莲，张嘉路.冯玉祥督豫期间的开封图书馆事业[J].河南图书馆学刊，1997(3). [9]冯南星，王卫东.河南公共图书馆事业50年[J].河南图书馆学刊，1999(2).
首先要认真研究本单位的职称文件。，然后对症下药，根据单位的职称文件对期刊的要求，选择适合自己的期刊。现在发表论文有多种渠道，如果自己的文章质量足够高，可以自己直接投给杂志社，但是这样审稿的周期比较长出版的周期也比较长，而且录用率比较低。如果文章质量不是太好，单纯为了评职称，可以通过中介，但是这样价格可能会高一些，而且可能会，所以如果走中介方式建议擦亮双眼。
发图书馆类期刊最好，如果没有图书馆类期刊，发一些文科的综合类的期刊也可以。看单位的要求。如果你想发表图书馆类的文章，可以去淘淘论文网看下，那上面有几个期刊质量还不错，我之前发过。
前期文章：
在上一篇文章中我们解读了，CRISPR-Cas9基因编辑诱导DSB（DNA双链断裂）并最终导致人多功能干细胞死亡的内容。其中最关键的是 Cas9造成的DSB，激发野生型P53反应，P53激活后将细胞引入凋亡之路 。话不多说，直接看下图：
想象一下这个过程：
（1）一个 sgRNA-Cas9复合体 在细胞核内游走， Cas9蛋白在DNA序列上快速的扫描PAM序列 ，合适的停顿一会儿，DNA解链， sgRNA尝试互补配对 。配对失败，此处不留爷自有留爷处！匹配成功，请看下一点。
（2）Cas9识别到NGG的PAM序列后， sgRNA配对成功，Cas9蛋白切割PAM序列下游第三个碱基处 （说是这么说，总也有切偏的时候）， 产生DNA双链断裂（DSB） 。
（3） DSB发生在WT-P53（野生型P53）的细胞中 ，P53激活诱导该细胞走向：周期阻滞、衰老甚至凋亡。由于人多功能干细胞对DSB十分敏感，其P53反应也十分激烈，容易走向凋亡。这就是上一篇文章的主要发现。
（4）而当 DSB发生在mutant-P53（突变型P53）的细胞中 时，也有几种情况：（A）该细胞有 双链P53突变 ，则毋庸置疑， P53功能缺失，不再诱导凋亡，细胞得以存活 ；（B）该细胞有一条链为WT-P53，另一条链为mutant-P53，当这个细胞足够倒霉的时候，它的 mutant-P53链产生的mutant-P53蛋白，不仅自己不起功能，还反而抑制另外一条WT-P53起作用 ！简直坏透了！此时无论如何，细胞仍然不会有正常的P53反应，细胞得以存活，且这些 mutant-P53可能会继续传递给后代 ，mutant细胞群不断壮大！
综上所述，显而易见， CRISPR-Cas9技术俨然成为一个筛选mutant-P53细胞的筛选因子 。长此以往，mutant-P53群落越来越大。P53自己突变就算了，关键是当其他的DNA损伤或者基因突变发生时， P53不再执行其“基因卫士”的功能，使得这些DNA损伤或者突变得以传递给后代，当DNA突变积累足够多/巧的时候，肿瘤可能会发生 。这就是CRISPR-Cas9技术应用的风险。想想有了前面那样一篇文章，那么后面这篇文章的出现是不是可以理解。
文章发表在2020年的 Nature Genetics 杂志
经过2018年 Nature Medicine 的文章，该文就是 明确指出DSB激活P53信号 ，同时他们做的 P53 mutant pool在CRISPR-Cas9编辑中能存活 ，也指示CRISPR-Cas9的mutant-P53富集作用。 是不是别人无法再做类似甚至相同的内容了呢？但这篇文章又缘何可以发这么高分？
背景： Cas9通常被投入到细胞系中，以实现CRISPR-Cas9介导的基因组编辑。 问题： Cas9表达本身所造成的后果未知。（个人思考：角度非常好，Cas9其实作为一种外源蛋白是否会引起免疫反应？Cas9是否会不依赖sgRNA直接切割，就如同一些核酸内切酶的星号活性一样？）
目的： 研究Cas9表达本身是否会引起基因组或者转录组的变化，其后果如何
补充背景： 中性基因编辑/操作（人为而非自然选择）可导致细胞系的遗传和转录多样化。例如人为的过表达或者敲除某些基因都会改变细胞系的遗传和转录多样化。然而，目前还不清楚引入特定的“中性”基因是否会对特地基因进行富集或筛选。尤其是Cas9这样常常使用的工具蛋白。
L1000测序+GSEA分析（如下图）： 首先作者找到了165对Cas9过表达细胞及其亲本细胞，分别进行L1000测序。L1000测序即对987个landmark基因进行测序，以推测余下11350个基因的表达（就是测重要基因表达）。这里的技术重复不是我们在RNA-seq中常见到的3个，而是高达16个。经由L1000测序后发现有87个差异基因且差异在2倍以上，经由GSEA分析对比。证明Cas9过表达本身对遗传背景有扰动。
数据分析（如下图） ：（1）左图c表示， P53 WT细胞上，可见Cas9过表达细胞群有P53相关基因上调 。而在P53 mutant组，Cas9组和对照组的P53相关基因无差别（自然了，都突变了还能有下游基因变化么）。（2）右图g表示，在40个P53 WT的细胞中，有相当一部分细胞在Cas9过表达后表现出P53相关激活基因富集的现象。因此， Cas9激活P53得到了直接证据，同时Cas9激活P53这个现象大部分发生在P53 WT组上 。原文中有相应的统计表格可查。
注意：这里仅仅是列举了部分代表性结果，作者还做了P53、P21的WB、PCR验证，同时还测试通过免疫荧光提供了Cas9诱导DNA损伤的证据。
基于上述结果：P53WT组，Cas9导致--细胞DNA损伤--P53激活--细胞生长被抑制、死亡。那Cas9相当于变相的筛选富集P53 mutant细胞。
Deep (283×) targeted exon sequencing for 447 cancer genes ：于是作者找到4 2对P53WT状态 的细胞及其Cas9过表达株，对这些细胞进行447个癌症相关基因的深度测序。经分析后发现 Cas9过表达细胞相对于WT细胞有更多的非同义突变 （下图a）。同时突变累积TOP3为：SETBP1（与DNA复制相关）、SLC25A13（线粒体载体家族基因）以及TP53基因。 这里有一个疑问，TP53不是Top1呀，为啥不研究Top1呢？注意后文有回答 。
补充背景： 深度测序是指对一个基因组区域进行多次测序，深度可达数百次甚至数千次。这种测序可检测到只占原始样本1%的罕见克隆类型、细胞或微生物。深度测序对癌症、微生物学和其他涉及 罕见细胞群分析 的研究很有帮助。例如，深度测序可识别肿瘤中的突变，因为在癌症样本中通常包含有许多正常细胞，且肿瘤本身可能包含多种亚克隆。因此 本文选用深度测序，可识别到微量的基因突变，从而区分不同基因突变的亚群 。
从深度测序结果来看，不止TP53突变在Cas9过表达株中富集。那么Cas9富集基因突变细胞是没有bias还是特定富集TP53突变。为了解决这个问题，作者设计了以下实验：
细胞竞争实验 ：作者将TP53 -null细胞用GFP标记，将P 53-null细胞和WT-P53细胞按照1:6混匀 ，并分组处理：（1）无处理组NIC；（2）空载组EV；（3）Cas9过表达组Cas9。经分组处理后使用流式细胞仪检测GFP细胞占比变化，如下图b所示， Cas9组的TP53-null细胞在14,21天培养后群体壮大，而ARID1A-null、FBXW7-null细胞则没有变化 （下图c）。因此 Cas9只特异性富集TP53突变细胞 ，于是回答了中我们提到的问题。
以上是本文的主要内容，当然后续作者还对CRISPR-Cas9导致TP53突变富集的机制进行了研究和分析，说是在TP53-WT细胞中，cas9诱导的DNA损伤增加了对功能性DNA修复机制的依赖，也做了一系列实验验证，感兴趣的小伙伴需要回原文查看。最后该文提供了一个使用Cas9进行研究的工作流程图，我想这是该文的另一精髓：
（1）首先思考使用的Cas9过表达细胞是否有是WT-P53。如果不是，则无需太但又P53对功能实验的影响；如果是，则需要检查P53通路的激活状态，可选用WB, RT-qPCR试验等。
（2）若Cas9细胞有一定的P53通路激活，则：在后续实验中考虑p53活性的基础水平；尽量避免过多传代Cas9细胞，以免TP53 mutant细胞富集。
（3）即使Cas9细胞有P53活性基础水平，但仍需是否混有TP53 失落亚型细胞：可通过DNA测序鉴定。
（4）鉴定Cas9过表达细胞株的DNA损伤水平，在后续实验中监控DNA损伤水平的变化，定期检测TP53突变状态。
这篇文章使用了多种测序技术，实验设计巧妙，虽不多但都在刀刃上，是一篇很好的干湿结合文章，值得一读，且文末讨论简洁而精彩。 上文讲的是CRISPR-Cas9诱导DSB导致细胞死亡，这篇讲的是CRISPR-Cas9无法使得TP53 mutant细胞死亡，简直是天生一对 。那么 CRISPR-Cas9是依赖DNA修复的技术 ，TP53是DNA修复的上游信号，是否CRISPR-Cas9对DNA修复功能也有影响呢？下一次， 我们将解读一篇关于CRISPR-Cas9技术应用中，TP53状态和DNA修复之间的纠缠 。
TP53是一个热门IP，过了这么多年仍然有大量的好文章发表，关于TP53和CRISPR-Cas9之间关系的好文章不仅仅这两篇，我们希望能在这段时间把这类型的经典文章读一遍，加深我们对CRISPR-Cas9技术的理解。感谢大家阅读，再次期盼反馈交流！
Single-cell landscape of immunological responses in patients with COVID-19
影响因子： ： 32788748 期刊年卷：Nat Immunol 2020 09;219(9) 医学一区 免疫学 Q1 3/155
DOI：
这篇文章和上一篇文章思路、设计、方法基本一致，甚至结论也有相似之处，通讯作者都是院士，但是为什么发的分值相差距大呢？除了文章发表先后顺序外，在样本量和数据分析方面做得更细致一些，亚群分析更细致一些，另外图表也比上一篇美观，这些问题都值得我们反思！
作者实施了单细胞RNA测序（scRNA-seq），观察了中度至重度症状的COVID-19患者外周血单核细胞（PBMC）的免疫反应。作者的研究描绘了COVID-19疾病发展过程中血液免疫细胞的高分辨率转录组图谱，这将有助于更好地了解该疾病的保护性和致病性免疫反应。
在由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染引起的冠状病毒疾病2019（COVID-19）中，疾病严重程度与宿主免疫反应之间的关系尚未完全了解。在这里，作者对5位健康供体和13位COVID-19患者（包括中度，重度和恢复期患者）的外周血样本进行了单细胞RNA测序。通过确定免疫细胞的转录谱，并结合组装的T细胞受体和B细胞受体序列，作者分析了免疫细胞的功能特性。COVID-19患者中的大多数细胞类型均表现出强烈的干扰素-α反应和整体急性炎症反应。此外，高度细胞毒性效应T细胞亚群如CD4+ effector-GNLY (granulysin), CD8+ effector-GNLY and NKT CD160与中度患者的康复有关。在重症患者中，免疫系统的特征是干扰素反应紊乱，免疫力衰竭，T细胞受体组成偏向，T细胞广泛扩散。这些发现说明了疾病进展过程中免疫反应的动态性质。
scRNA-seq（10X基因组学）研究了13例患者和5例健康供体（HD）的PBMC的转录组谱（图 1a ）。将13例COVID-19患者分为三种临床情况：中度（ n = 7），重度（ n = 4）和恢复期（conv； n = 6，其中4例与中度病例配对）（图 1a， b ，还对每个受试者进行了单细胞T细胞受体（TCR）和B细胞受体（BCR）测序。经过统一的单细胞分析流程（请参阅 方法 ），从所有样本的PBMC中的122,542个细胞中获得了约6亿个独特的转录本。在这些细胞中，22,711个细胞（占％）来自HD，37,901个细胞（占％）来自中度状态，24,640个细胞（占％）来自严重状态，而37,290个细胞（占％来自恢复状态）状况。将所有高质量细胞整合到完整且可比较的数据集中，并在校正读取深度和线粒体读取计数后进行主成分分析（补充图 2a，b ）。
图1：HD和COVID-19患者的PBMC的研究设计和单细胞转录谱。
使用基于图的统一流形近似和投影聚类（UMAP），作者根据规范基因标记的表达捕获了14种主要细胞类型或亚型的转录组（图 1c-e 和补充图 2a，b ）。外周血中细胞亚群的组成
(naive-state T (naive T) cells (CD3+CCR7+), activated-state T (activated T) cells (CD3+PRF1+), mucosal-associated invariant T (MAIT) cells (SLC4A10+TRAV1-2+), γδ T cells (TRGV9+TRDV2+), proliferative T (pro T) cells (CD3+MKI67+), natural killer (NK) cells (KLRF1+), B cells (MS4A1+), plasma B cells (MZB1+), CD14+ monocytes (CD14+ mono; LYZ+CD14+), CD16+ monocytes (CD16+ mono; LYZ+FCGR3A+), monocyte-derived dendritic cells (mono DCs; CD1C+), plasmacytoid dendritic cells (pDCs; LILRA4+), platelets (PPBP+)
为了揭示三种情况（中度，重度和转化）中细胞组成的差异并与HDs进行比较，作者根据scRNA-seq数据计算了每个人的PBMC中14种主要细胞类型的相对百分比（图 2a–d ）。活化的T细胞簇的相对百分比在中度患者中达到峰值，甚至在恢复期也没有恢复到正常水平。值得注意的是，幼稚T细胞，MAIT细胞和单DC的相对丰度随着疾病的严重程度而降低，后来在conv患者中这些种群得以恢复（图 2d ）。相比之下，在conv患者中，pro T细胞，血浆B细胞，CD14 +mono和血小板的相对百分比随着疾病的严重程度而增加，后来又下降了。 2d ）。重症患者中CD14 + mono的大量增加是根据最近的一项研究表明，病原性T细胞诱导的炎性单核细胞在COVID-19中引发了炎性风暴（参考文献 22 ）。
图2：疾病状况的细胞组成差异。
接下来，为了研究SARS-CoV-2感染期间的抗病毒和病原体免疫反应，作者评估了两种重要途径的表达水平（基因本体论（GO）生物学过程术语：对干扰素（IFN）-α的反应和急性炎症反应）。跨四个条件的主要细胞类型。作者发现，在COVID-19患者的PBMC中，所有主要细胞类型中对IFN-α的反应均一且显著上调，并且在严重患者中，除血浆B细胞外，几乎所有主要细胞类型中对IFN-α的响应值均最高，其中中度患者的IFN-α反应最大（图 2e ）。另外，除pro T细胞外，急性炎症反应在所选细胞类型的各种条件下均表现出一致且显著的差异。几种细胞类型显示出与疾病严重程度大致对应的急性炎症反应趋势，包括活化的T细胞，γδT细胞，NK细胞和CD16 + mono（图 2e ）。此外，在严重患者中，血浆I型IFN，IFN-γ和其他炎性细胞因子水平最高（补充图 2c ）。这些结果表明，在COVID-19患者中有很强的总体促炎反应（图 2e ）。
为了进一步研究SARS-CoV-2感染后先天免疫细胞的转录组变化（图 3a，b ），作者比较了CD14 +和CD16 +单核细胞中度或重度条件与HD条件的表达模式。作者发现COVID-19患者的IFN反应，髓样白细胞活化，细胞因子产生和核因子（NF）-κB信号通路均涉及显著差异表达的基因（DEG）（图3c，d）。作者发现COVID-19患者的IFN反应，髓样白细胞活化，细胞因子产生和核因子（NF）-κB信号通路均涉及显著差异表达的基因（DEG）（图 3c，d ）。 此外，严重条件下单核细胞中更多的DEG富含分子代谢和分解代谢过程以及细胞因子分泌（补充图 3a ）。对于NK细胞，与单核细胞相似，与IFN反应，细胞因子产生，NF-κB信号通路和白细胞细胞毒性相关的DEGs在COVID-19患者中显著丰富（图 3e，f ），表明先天免疫细胞具有一致的反应感染SARS-CoV-2。此外，与中度患者相比，重症NK细胞的DEGs，例如 ITGB2， CCL5 和 CXCR2 ，与迁移相关的过程更为紧密相关（补充图 3b，c ）。
**图3：在四个条件下个体的先天免疫细胞的特征。 全尺寸图片
与DEG富集结果一致，作者发现SARS-CoV-2感染后单核细胞和NK细胞均显示出明显的IFN和急性炎症反应，特别是在严重患者中（图 2e ）。与HD条件相比，单核细胞和NK细胞中细胞凋亡和迁移的水平也被上调（图 3g ）。与单核细胞和NK细胞中相当的凋亡水平不同，重度患者的先天免疫细胞比中度患者更容易迁移（图 3g 和补充图 3c ）。这些结果表明，在患有COVID-19的患者中，大多数先天免疫细胞类型均表现出强烈的IFN反应。
为了表征个体在四种情况下个体T细胞亚群的变化，作者从PBMC中亚群化T细胞，并根据典型T细胞标志物的表达和分布获得12个亚群（图 4a，b ）：
CD4 + T细胞的6种亚型（CD3E + CD4+）， CD8 + T细胞的3种亚型（CD3E + CD8A +） NKT细胞的3种亚型（CD3E + CD4 – CD8A –TYROBP +）
图4：T细胞亚群的免疫学特征
源数据
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CD4 + T细胞簇的六个亚型 naive CD4+ (CD4+ naive) T cell (CCR7+SELL+), memory CD4+ (CD4+ memory) T cell (S100A4+GPR183+), effector memory CD4+ T cell (S100A4+GPR183+GZMA+) regulatory T (Treg) cell (FOXP3+IL2RA+) 亚型，
两种effector CD4 + T亚型： CD4+ effector-GZMK and CD4+ effector-GNLY。CD4+ effector-GNLY簇的特点是与细胞毒性，包括相关联的基因的高表达NKG7，GZMA，GZMB，GZMH和GNLY，而CD4+ effector-GZMK 簇显示出的高表达GZMK基因（图4b和补充图4a，b）。此外，CD4+ effector-GNLY细胞表现出高表达的TBX21，表明它们是1型辅助性T（T H1）样细胞（补充图4c）。相反，CD4+ effector-GZMK和effector memory CD4+ T cell具有高表达GATA3的2型辅助T（T H 2）细胞样特征（补充图4c）。
CD8 + T细胞簇的三个亚型
CD8+ (CD8+ naive) T cell subset (CCR7+SELL+) and two effector CD8+ T cell subsets (CD8+ effector-GZMK and CD8+ effector-GNLY)，它们都具有高表达的GZMA和NKG7。 CD8+ effector-GZMK独特表达GZMK，而CD8+ effector-GNLY显示出相对高的表达水平GZMB / H和GNLY（图4B和补充图4A，B）。
NKT细胞簇的三个亚型被定义为 NKT (NKT naive) cells (CCR7+SELL+), CD56+ NKT (NKT CD56)，CD160+ NKT (NKT CD160) （图 4a，b ）**。
为了深入了解T细胞亚群中的特征，作者评估了每个簇在四个条件下的分布（图 4c 和补充图 4d，e ）。值得注意的是，与HD相比，COVID-19患者的effector T cells （CD4+ naive, CD4+ memory, CD4+ effector memory, Treg, CD8+naive and NKT naive subsets）的比例下降（图 图4c 和补充图 4D ）。即使在转化条件下，CD4+ naive, CD8+ naive and Treg 的比例簇没有恢复到HD的水平（图 4c 和补充图 4d ）。相反，COVID-19患者的CD4+ effector-GNLY, CD8+ effector-GNLY, NKT CD56 and NKT CD160子集的活跃状态T细胞子集的比例增加，这些细胞毒性子集甚至以高比例存在在conv患者中（图 4c ）。特别要注意的是，HDs中几乎不存在CD4+ effector-GNLY 亚群，但在中度，重度和转化性患者中高度丰富。此外，与中度患者相比，重度患者的NKT CD160亚群的丰度显著降低。
然后，作者评估了在四种情况下不同效应子状态T细胞亚群的细胞毒性和衰竭评分（图 4d 和补充图 4f ）。CD4+ effector-GNLY, CD8+ effector-GNLY, NKT CD56 and NKT CD160子集显示出比其他子集更高的细胞毒性评分。在这些高度细胞毒性的簇中，HDs的细胞毒性评分最低，而中度状态则显示最高的细胞毒性状态，但CD4+ effector-GNLY亚群除外（图 4d，e 和补充图 4f ）。同时，CD4+ effector-GZMK, CD8+ effector-GZMK and NKT CD160 亚群显示出比其他亚组更高的疲劳评分。在这些精疲力竭的亚组中，HDs的精疲力竭评分最低，而重症患者表现为最精疲力竭状态（图 4d，e 和补充图 4f ），这与先前检查重症患者CD8 + T细胞的功能研究一致并发现疲惫不堪的状态和功能受损 23 。
为了进一步研究SARS-CoV-2感染后T细胞中差异转录组的变化，作者比较了中度或重度之间的效应T细胞（排除CD4+ naive, CD4+ memory, CD8+ naive and NKT naive）的表达谱。HD条件。作者观察到，在COVID-19患者中上调的DEG参与了以下过程，包括IFN反应，细胞因子产生，细胞杀伤，白细胞-细胞粘附和细胞骨架组织（图 4f，g 和补充图 4i ）。此外，使用凋亡和迁移评分系统，作者观察到严重患者的T细胞可能经历了迁移和凋亡（图 4h，i 和补充图 4g，h ）。在重症患者的PBMC中的细胞死亡和迁移途径的活化显著表明，细胞死亡和淋巴细胞迁移可以与淋巴细胞减少，在患者中观察到严重COVID-19的常见现象（参考文献相关联 18 ， 19 ， 24 ）。
接下来，为了深入了解各个T细胞之间的克隆关系以及在四个条件下V（D）J基因的使用，作者从TCR测序中重建了TCR序列（补充表 2 ）。简而言之，除了三个NKT子集外，所有子集中具有匹配的TCR信息的细胞超过70％（图 5a，b ）。首先，与HDs相比，COVID-19患者和恢复期患者的克隆扩增明显（图[5c–e]( ）。在中度和慢性条件下的克隆扩增程度高于严重条件下的克隆扩增程度。同时，在严重的情况下，没有大的克隆扩增（克隆大小> 100）（图 5e ），表明严重的患者可能缺乏效应T细胞的有效克隆扩增。作者观察到T细胞亚群之间不同程度的克隆扩增（图 5c，d ）。效应T细胞亚群CD4 +效应子GNLY，CD8 +效应子GZMK和CD8 +效应子GNLY表明克隆细胞（图的高比例 5a中，d 和补充图 5A ）和包含簇间克隆细胞的高比例（图 5f ），提示效应子T细胞经历了动态状态转变（图 5a，f ）。
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为了研究COVID-19和HD患者中TCR的动力学和基因偏好，作者比较了四种情况下V（D）J基因的使用情况（图 5g–i 和补充图 5b ）。在四个条件下，前10个互补决定区3（CDR3）序列不同（图 5h ）。中度和转化条件共享一些CDR3序列，因为来自这些条件的四个样本已配对。与其他三个条件相比，HD条件下前10个CDR3序列的使用百分比更低且更均衡。值得注意的是，作者发现在COVID-19患者中V（D）J基因的不同用法具有降低的多样性，这在 TRA 基因中更为明显（图 5i ）。作者还确定了 重度患者与中度和 慢性患者相比 TRAJ39 和 TRAJ43的 过度表达 （图 5g ）。 重症患者首选的TRBJ基因是TRBJ1-1，而中度和转化性患者首选TRBJ2-1（图 5i ）。 **V（D）J基因的选择性使用表明不同的免疫优势表位可能驱动T细胞反应的分子组成，并且可能与SARS-CoV-2特异性感染相关。
为了追踪不同B细胞亚型的动态变化，作者根据规范B细胞标志物的表达和分布将B细胞分为六个子集（图 6a，b 和补充图 6a ）。 naive B subset (MS4A1+IGHD+), memory B subset (MS4A1+CD27+), intermediate transition memory B subset (intermediate memory B; IGHD+CD27+), germinal center B subset (MS4A1+NEIL1+) and two plasma subsets, plasma B (MZB1+CD38+) and dividing plasma B (MZB1+CD38+MKI67+) .
图6：B细胞亚群的免疫学特征。 全尺寸图片
值得注意的是，与HD相比，COVID-19患者的活动状态B子集（germinal center B, plasma B and dividing plasma B subsets）的比例增加。相反，与HD患者相比，COVID-19患者的memory B cells比例下降（图 6c-e ）。
为了进一步研究SARS-CoV-2感染后B细胞的差异转录组变化，作者比较了中度或重度条件下HD的B/plasma cells的表达谱。在COVID-19患者中最丰富的DEG参与了与IFN反应相关的基因（图 6f，g 和补充图 6c ）。此外，重症患者中的DEG与蛋白质合成，成熟和运输相关的生物学过程有关（补充图 6b ）。这些结果揭示了COVID-19患者B细胞亚群的转录组特征。
作者还从BCR测序中重建了BCR序列（补充表 3 ），并分析了BCR克隆扩增的状态。简而言之，每个簇中BCR的检出率均超过75％（图 7a，b ）。作者发现来自重症患者的B细胞显示出比其他三种情况明显的克隆扩增（图 7c 和补充图 6d ），这表明重症患者的B细胞活性和体液免疫反应被强烈激活，这让人想起先前的观察较高的抗体滴度与更差的临床结果相关联 25 ， 26 ， 27 。这引起了这样一种担忧，即病原体导向的抗体可以促进疾病病理，导致抗体依赖性增强，类似于SARS 28 中观察到的增强。
图7：扩展的BCR克隆和V（D）J基因的选择性使用 全尺寸图片
接下来，作者分别评估了中度，重度和转化条件下每位患者中IgA，IgD，IgG和IgM的分布（未检测到IgE）。在大多数患者中，IgM是主要的免疫球蛋白（图 7d，e ）。**与HD相比，COVID-19患者的IgG含量增加，而IgM降低。在恢复期患者中，IgG和IgM的水平恢复到与HDs相似的水平。
为了研究BCR的偏向V（D）J重排，作者比较了四种条件下V（D）J基因的使用情况（图 7f，g 和补充图 6e ）。与其他三种情况相比，作者发现在重症患者中使用了更多的特定V（D）J，这表明重症患者的B细胞可能经历了独特而特定的V（D）J重排（图 7g ）。 作者还发现IHDJ4在所有HD和患者中得到了综合利用（图 7f ），但与其他三种情况下的患者相比，重症患者中IGHJ4的IGHV配对IGHV基因却有所不同（图 7g ） 。 作者观察到IGHV3-7的过度表达在严重患者中（图 7f ）。此外，重症患者中前两个配对的VJ频率为IGHV3-7 / IGHJ4和IGKV3-15 / IGKJ3（图 7g ）。 总体而言 ，严重患者的B细胞克隆性增加以及 IGHV 和 IGKJ 基因的偏斜使用表明SARS-CoV-2感染与宿主B细胞中的V（D）J重排有关。值得注意的是， 在重症患者中选择性使用显性IGV基因，尤其是IGHV3-7和IGKV3-15，可能有助于疫苗的设计。
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Figure里面的图片主要包括 位图 和 矢量图 两种。 1. 位图 ，一般是由显微镜、照相机等等直接获取的实验图像，其特征是放大之后，图片会模糊；图片像素越高，文件越大。例如常见的细胞免疫荧光图片、电镜图片等。处理位图一般使用 Photoshop 等软件。 2. 矢量图 ，又称为向量图形，一般由作图软件作出，以线条和颜色块为主。矢量图大小一般在100K左右，且无论如何放大都不会失真。 处理矢量图一般采用 Illustrator 、CorelDRAW等软件、。 并且，制作完整的Figure在组图的时候一般使用使用illustrator（Photoshop也可以用来组图和标注，但是操作复杂，效率不高；PPT也是一种用来组图的常用工具，然而其简单的功能使其很难产生非常精美的figure），其强大的功能、高效率的操作、快速的标注和注释能力，一旦小伙伴们掌握它，在画Figure的时候就有一种飞一样的感觉了。 上面讲了SCI论文的Figure的构成，那么这些图片的格式是什么呢？哪些才能符合杂志的要求呢？ 众所周知，图片的格式有多种多样，JEPG、JPG、PDF、PNG、Tiff、Ai、EPS等等，每一种图片格式都有优缺点，因此，在不同的领域可能采用的图片格式有所不同。 但是，对于SCI文章发表而言，尤其是生物医学领域， 大多数杂志都是要求最后的Figure必须是Tiff格式 （有部分杂志JEPG和Tiff格式都可以）。 因此，最保险的做法就是把Figure存储为Tiff格式。 其中，Figure里面的 位图可以存为JEPG或者Tiff ，里面的 矢量图一般存储为Tiff 。 最后导出整张Figure的时候，最保险的做法就是存储为SCI文章通用的Tiff格式。 分辨率， 基本上要求 300 or 300 dpi以上 ，我们在 使用illustrator或者Photoshop导出Figure的时候把分辨率设置成300dpi ，基本上大多数杂志的要求都能够满足。 图片大小 ，大多数的SCI杂志都要求最好把 Figure的大小控制在10MB以内 。图片若是太大的话，一是投稿上传Figure的时候会比较慢，二也不符合杂志要求。若是Figure太大，超过了10MB，就需要将图片进行压缩。无论是Tiff格式的Figure，还是图中的位图还是线图， 均可以通过LZW无损压缩方式对文件体积压缩 。 图片压缩的时候最常使用的软件是Photoshop。采用PS将Figure打开，然后另存为文件，PS就会打开一个窗口，其中在“图像压缩”这里点击 LZW ，然后保存就可以了。 图片的格式一般有RGB和CMYK两种。 大部分SCI期刊都接受 RGB 颜色模式的插图文件，少数期刊要求作者在出版印刷前提交CMYK颜色模式的插图文件，颜色模式的转换建议在PS等位图编辑软件上进行。 同时，一般尽量避免出现红色与绿色，色盲的人看不出差别；不要用色彩相近的颜色标识图，并且避免使用灰度。当然，现在一般对Figure中的红色与绿色也不作要求，毕竟生物医学领域诸多荧光显色、生信领域的不少图片都是红绿色。 SCI文章的Figure文件名一般在投稿上传图片的时候需要注意，可以命名为如下样式： 、…、…Figure 、Figure (多个图片拼合成一张的，是算做一个图的)。 必须要注意的是： 一张图由几个部分组成的，应算作一张图，应在PS软件或者AI软件中合并为一张图片文件进行提交， 切忌不要提交诸如Figure 1A、 Figure 1B、 Figure 1C、 Figure 1D的情况， 除非杂志社有要求。 SCI文章的Figure的长和宽都是有要求的。目前SCI文章插图的排版按照Figure的宽度分成三种形式进行排版： ①半版（8cm）；②2/3版(14cm)；③整版（17cm） 。 ①半版图（宽度为8cm） Figure的总宽度为8cm，高度最高不可超过20cm ，过高会导致很难排版。图片左右需留少量边。必须注意的是，不管某张figure内容再少，其宽度最少也应该设置为8cm，而最好不要设置成小于8cm的尺寸。 ②2/3版图（宽度为14cm） Figure总宽度为12-15cm（最佳14cm），高度最高不可超过20cm ，图片左右需留少量边。图片中每个部分用a、b、c等标注。有的杂志要求使用大写的A、B、C等标注。 ③整版图（宽度为17cm） Figure总宽度为17cm（最佳14cm），高度最高不可超过20cm ，图片左右需留少量边。 整版图对于数据量比较大的Figure是比较常用的。图片中每个部分用a、b、c等标注。有的杂志要求使用大写的A、B、C等标注 SCI文章的Figure的字体一般采用英文的Arial或Times New Roman字体 ，若是采用Times New Roman，那么所有的Figures都需要统一为Arial格式；若是若是采用Arial，那么所有的Figures都需要统一为Times New Roman格式。 字体的大小一般为尽量使用7-12号字 ，最好不要小于6号字体，也最好不要大于14号字体。推荐使用7号字体，做出来的图比较美观。 SCI文章的Figure中的线形图或者柱形图的 线条粗细在之间 ，整个Figure的线条粗细需要统一，比如采用粗细，基本上所有的figures的线条均统一采用粗细。另外需要注意的是 线条一般采用黑色，尤其是坐标轴 。