张林琦博士毕业于北京师范大学生物系，毕业后即被英国爱丁堡大学选收为分子遗传学系博士研究生。张林琦博士现任清华大学艾滋病综合研究中心常务副主任、教授，中国医学科学院/北京协和医学院病艾滋病研究中心主任，美国艾伦.戴蒙德艾滋病研究中心（Aaron Diamond AIDS Research Center）研究员。目前工作主要集中在加强中美双方在HIV/AIDS领域的基础与临床研究合作。张林琦博士二十多年来主要从事AIDS的基础和临床研究，先后获得美国国立卫生研究院（NIH）等科研机构的研究资助8项，973项目首席科学家，科技重大专项“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治-创新型粘膜疫苗”首席科学家。作为第一和第二申请人获得的资助经费达1047万美元。他在国际上率先与何大一教授一起从HIV-1病毒学、宿主免疫学、遗传学（如基因突变和多态性特点）等方面，阐述了HIV-1感染和发病机制，而且建立了动态模型并提出了艾滋病的客观评价指标，对临床疗效和预后的判断作出了重要贡献。1993年起在何大一教授领导的美国艾伦.戴蒙德艾滋病研究中心（Aaron Diamond AIDS Research Center），主要从事 HIV感染者治疗前后体内病毒学基因变异、宿主基因多态性和免疫学特征等课题的研究。首先报道了人体不同细胞中HIV-1协同受体CCR5和CXCR4的分布特点，发现T淋巴细胞群表面协同受体的表达水平最高。同时指出HIV-1病毒亚型与协同受体CCR5和CXCR4之间相互结合的关系，提出了是病毒表型而不是病毒基因型决定了病毒与协同受体CCR5或CXCR4结合。此外他在何大一教授指导下，通过长期观察抗病毒治疗的艾滋病患者体内的静止细胞中储藏的残留HIV的动态过程，提出了病毒复制及其动态变化的模型，为彻底改进抗艾滋病的药物治疗的方针策略提供了科学的依据。研究论文分别发表在临床医学权威杂志New England J. Medicine、Nature等，连续五年被SCI检索为引用频次为国际上最高的前五名论文之列。1998年张林琦博士被洛克菲洛大学校长任命为副教授和高级研究员，承担多项重要研究课题。由于胸腺是体内产生T淋巴细胞的主要器官，对胸腺在HIV感染过程中的研究就显得格外地重要。他和他的同事利用实时PCR的方法，在世界上首次定量出体内胸腺的活性，并对HIV对胸腺活性的影响进行的初步的研究。这个省时、高效、高精确度的定量方法直接可以从病人的血液中得到胸腺活性的指标。更重要的他发明了多种病毒学及免疫学定量指标和方法，特别是通过胸腺细胞中RTEs基因产物的研究，提出了RTEs基因产物减少与艾滋病患者CD4 T细胞降低的速率相关的学说。这些成果为目前广泛推广的艾滋病抗病毒治疗后的免疫重建模式奠定了可靠的定量依据。同时对进一步的开展药物治疗与免疫治疗相结合的治疗方案提供了科学的线索。这些病毒学及免疫学定量方法，对于HIV/AIDS临床治疗有着直接的指导意义。近年来他分别在国际上最著名的杂志（如：Nature Medicine、Nature、J Clin Invest、Lancet、New England J Med, Science和）发表论文，被SCI收录83篇。检索其中的31篇在近五年来被引用1891次。影响因子高达293目前，张林琦教授多次被国际会议和国内大学邀请作学术报告和合作研究，是艾滋病领域年富力强的实力派科学家。2008年张林琦博士全职回国，现任清华大学基础医学系主任，清华大学病毒研究所所长，清华大学艾滋病综合研究中心常务副主任、博士生导师，长江特聘教授。
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