南开大学自2005年开始开设药学专业，是具有适度规模、国内一流、具有南开特色的药学院。
药学院由一个本科专业和四个研究所组成。本科专业为药学专业，强调加强基础和专业基础培养，能适应多方面需求，同时又有从事专门研究方向的训练，符合培养高级研究型人才的需求。四个研究所为生物技术药物研究所、药物设计与合成研究所、复方药物研究所和药物制剂与临床药学研究所。
创建研究型大学和有特色的现代药学专业，联合办学，利用资源优势积极申报硕士点和博士点，初步形成研究型大学人才培养的层次结构。
学科目标：
重点建设药物化学、微生物与生化药物、生药学三个二级学科。争取一至二年申请一个博士点和一级学科硕士点，三至五年建成一级学科博士点，五年后申请一个重点学科，十年后再申请一至二个重点学科，争取实现药学一级学科的重点学科。
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