1970年,组织上要王正国负责组织对冲击伤的研究。冲击波损伤是核武器损伤的重要伤类,平时的爆炸事故中冲击伤也屡见不鲜。有人劝他不要接受这一任务,理由是:冲击伤没有什么研究价值,因为“重伤治不了,轻伤不用治”。还有就是要改变研究方向,难度太大。王正国认为,如果能研究出有效的防治措施,一定能降低危重冲击伤病人的死亡率。而且,我们这么大的国家,这么大的军队,难道不需要一个冲击伤研究单位吗?他接受了上级交给的任务,多次到核试验场、化爆试验场及事故现场进行动物实验和现场调查,取得了丰富的第一手资料。在此基础上,他提出了对冲击伤的预防、诊断、治疗的措施,出版了专著《冲击伤》。受到国内外专家的好评和重视。1978年,国际上已召开了三届创伤弹道学会议,也曾邀请中国参加,有关部门的回答是:中国没有进行这方面的研究,故不参加会议。王正国听到这一消息后,受到很大刺激。创伤弹道学是研究投射物击中人体后在体内的运动规律、致伤原理的一门科学,是指导火器伤救治的理论基础,也是野战外科学的一个重要内容。然而,我国从事野战外科学研究的人,确实尚未做这方面的研究。为了军事医学建设的需要,王正国在轻武器所马玉媛教授和本所刘荫秋教授等人的共同努力下,从零开始,开展了创伤弹道学的系列实验研究工作。1982年12月,王正国以英语考试川东第一名的成绩,通过了世界卫生组织的出国考试,以访问学者的身份赴美国费城宾夕法尼亚大学进行客座研究。在一年的时间里,王正国夜以继日地在实验室工作,他的勤奋和才气,赢得了美国同行的钦佩,伴随着课题研究的重大进展,这位中国讲师被破格任命为宾夕法尼亚大学的教授会成员。1983年,王正国谢绝了美国一些科研单位的挽留,按期回国。这一年,他从讲师破格提升为研究员。1988年,第六届国际创伤弹道学会议在重庆市第三军医大学大坪医院野战外科研究所召开,王正国任大会秘书长。中国代表提交论文一百余篇,占与会论文的70%。国外学者一致赞扬中国同行所做的工作,在短短十年中,中国的创伤弹道研究从一片空白发展到与会代表公认的与美国、瑞典并列三强之一。20世纪80年代末期,王正国率领学生孙立英、刘宝松博士等率先组建了国内第一家大型的交通伤(撞击伤)实验室,并进行了动物模型、量效关系、致伤机制方面的研究。同时,王正国还在《创伤杂志》上撰写述评,呼吁加强交通事故伤的研究工作。组织召开了两届全国交通事故伤学术会议,在中华创伤学会下组建了交通伤学组(对外交流称为交通医学学会)。他还先后五次出席了国际交通医学会议,介绍了中国交通伤研究的成果。国际交通医学理事会一致通过,第16届国际交通医学会在重庆召开,并委任王正国为大会主席,此外,还约请王正国担任《国际交通医学》杂志的副主编。1997年他主编出版了我国第一部约150万字的专著《交通医学》。