（1）中国生物医学文献数据库（CBM）：收录1978以来1600余种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录770余万篇，全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理。年增文献40余万篇，每月更新。部分论文可直接链接到维普中文科技期刊全文库获取全文。
（2）中国医学科普文献数据库：收录2000年以来国内出版的医学科普期刊近百种，文献总量近25万篇，重点突显养生保健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营养等与医学健康有关的内容。每月更新。可浏览全文。
（3）北京协和医学院博硕学位论文库：收录1981年以来协和医学院培养的博士、硕士研究生学位论文9700余篇，学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相关专业，内容前沿、丰富,可在线浏览全文。每季更新。可以在线浏览和下载文摘信息。在题录页面点击“原文阅读”可以在线阅读全文。提示：全文不提供下载！
（4）西文生物医学文献数据库（WBM）：收录目前世界各国出版的7200余种重要生物医学期刊文献题录2286万余篇，其中协和医学院图书馆馆藏期刊4800余种，免费期刊2400余种。部分期刊可回溯至创刊年，全面体现协和医学院图书馆悠久丰厚的历史馆藏。年增文献60余万篇，每月更新。
（5）英文文集汇编文摘数据库：收录协和医学院图书馆馆藏生物医学文集、汇编以及能够从中析出单篇文献的各种参考工具书等240余种/册，文献量共计38700余篇。报道内容以最新出版的文献为主，部分文献可回溯至2000年。每月更新。
（6）英文会议文摘数据库：收录2000年以来世界各主要协会、出版机构的60余种生物医学学术会议文献，部分文献有少量回溯，文献量共计16540余篇。每月更新。
（7）俄文生物医学文献数据库：收录1995年以来俄国出版的俄文重要生物医学学术期刊30余种，部分期刊有少量回溯，文献量共计10420余篇。每月更新。
（8）日文生物医学文献数据库：收录1995年以来日本出版的日文重要生物医学学术期刊90余种，部分期刊有少量回溯，文献量共计76240余篇。每月更新。
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