必须达到清华大学的录取分数线。2002年9月教育部、卫生部两部领导签署了清华大学与中国协和医科大学紧密合作，共建“清华大学北京协和医学院”的协议，中国协和医科大学进入“211”和“985”工程建设项目。2006年9月，根据清华大学和中国协和医科大学签署的《清华大学和中国协和医科大学关于落实两部协议的实施意见》，中国协和医科大学更名为北京协和医学院（清华大学医学部），英文名称为Peking Union Medical College, Tsinghua Uninversity。按照教育部卫生部2007年协议 ，中国协和医科大学正式更名为“北京协和医学院”；鉴于与清华大学紧密合作办学的需要，同时使用“北京协和医学院—清华大学医学部”的名称。中国协和医科大学与清华大学合作办学，但两校并未合并。“北京协和医学院-清华大学医学部”中的“北京协和医学院”部分来自中国协和医科大学，北京协和医学院-清华大学医学部”中的“清华大学医学部”部分来自清华大学医学院。
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