毕业论文中的参考文献一般不需要进行专门的查重,因为参考文献是来自于其他已发表的文献,是已有的知识产权。然而,如果你在参考文献中存在抄袭或者剽窃的情况,那么就需要进行查重。现在查重软件都可以过滤格式化的东西不参与查重,比如目录,脚注,目录,参考文献等。此外,有些学校或机构可能会对参考文献进行检测,以确保学生没有抄袭或剽窃他人的研究成果。在这种情况下,你需要严格遵守学术规范,正确引用和注明参考文献,并避免抄袭或剽窃其他人的研究成果。如果发现你的参考文献存在问题,可能会导致严重的学术后果,甚至会影响你的学位授予。