学术不端对学校的危害有：有损于高校形象、导致信用崩塌、影响教育公平等等。
一、有损于高校形象
在以往几起涉及高校学者的学术风波中，要么当事人沉默以对，回避质疑，要么高校方面三缄其口，明哲保身，最后问题仍然不清不楚，事件也就不了了之。这种情形，不仅不利于端正学风，而且有损于高校形象。
个中原因之一，就在于查处学术不端的责任主体不明，或有关机构态度暧昧，不积极主动介入。例如，在一起涉及清华大学、复旦大学等名校学者的学术质疑风波中，高校是否介入竟然全凭一己主观判定，缺乏基本的学术规则。
二、导致信用崩塌
抄袭与学术不端，本质上是一种欺，也是一种偷盗，这种行为，相当于把别人的心血偷来，给自己的私利添砖加瓦。
对于一个靠偷盗与拼贴完成创作，并以此换取名声、金钱与成就的作家而言，用“欺世盗名”形容其学术不端行为可谓毫不过分。正如任何建筑都不可能矗立于流沙之上，靠着欺与偷盗得来的成就，也支撑不起任何谬赞与虚名。
三、影响教育公平
教育公平问题是社会普遍关注的热点问题之一。作为教育主管部门，维护教育公平应该高度自觉，必须始终警惕任何有违教育公平的学术不端等问题，保持零容忍，发现一起查处一起，严惩不贷。
应该特别强调的是，对于以违法手段严重破坏教育公平造成恶劣社会影响，乃至触犯刑律的，要坚决绳之以法。
学校应肩负打击学术不端的主体责任：
这也意味着，一旦有人举报，或者发生公众质疑，高校相关机构就有必要进行相应调查，公布调查结果。话说回来，这仍属于被动介入的情形。平时，高校更须积极主动地加强学风建设，构建学风建设长效机制，这既是防范于未然，也是高校职责所系。
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