毕业论文总字数不算摘要和参考文献，指从第一章到最后一章。
按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。然而，按照GB/T 7714-2015《信息与文献 参考文献著录规则》"的定义，文后参考文献是指:"为撰写或编辑论文和著作而引用的有关文献信息资源。
根据《中国学术期刊(光盘版)检索与评价数据规范(试行)》和《中国高等学校社会科学学报编排规范(修订版)》的要求，很多刊物对参考文献和注释作出区分，将注释规定为"对正文中某一内容作进一步解释或补充说明的文字"，列于文末并与参考文献分列或置于当页脚地。
2007年8月20日在清华大学召开的"综合性人文社会科学学术期刊编排规范研讨会"决定，2008年起开始部分刊物开始执行新的规范"综合性期刊文献引证技术规范"。
该技术规范概括了文献引证的"注释"体例和"著者-出版年"体例。不再使用"参考文献"的说法。这两类文献著录或引证规范在中国影响较大，后者主要在层次较高的人文社会科学学术期刊中得到了应用。
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