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在论文中添加参考文献引用的方法有以下几种：1. 直接插入法：在论文正文中引用文献时，可以直接在引用处插入文献信息。例如：“根据Smith的研究（2010），……”，其中“Smith的研究（2010）”即为直接插入的文献信息。2. 括号法：在论文正文中引用文献时，也可以使用括号将文献信息括起来。例如：“……（Smith, 2010）指出，……”，其中“（Smith, 2010）”即为使用括号的文献信息。3. 上标法：在论文正文中引用文献时，也可以使用上标标注。例如：“根据Smith的研究[1]，……”，其中“[1]”即为使用上标的文献信息。4. 脚注法：在论文正文中引用文献时，也可以使用脚注进行标注。例如：“根据Smith的研究^[1]，……”，其中“^[1]”即为使用脚注的文献信息。需要注意的是，在添加参考文献引用时，需要确保文献信息的准确性和完整性，同时需要遵循所在领域或期刊的引用规范和要求。在撰写论文时，需要仔细查阅相关的学术规范和要求，并按照规范进行引用。同时，也需要在参考文献列表中列出所有被引用的文献，以便读者查阅原文和验证论文的来源。
大学毕业的话，是需要写论文的，那么，想要借鉴书中的内容又不算抄袭的话，那么我觉得你可以把它引用成自己的例子
导读参考文献是论文的一个构成部分，其引用原则是，用你自己的语言来总结其他作者的研究 发现，然后注明引用的出处。在一篇论文中，引用参考文献论证自己的观点或者理念是十分必要的。对于别人已经研究过的内容，我们便不需要重复的实验研究，通 过参考文献的引用，便能简要的体现我们想要表述的内容。但并非一篇论文的内容都由参考文献堆积便可，正确的选用参考文献至关重要。那么，我们在写作论文时参考文献怎么引用才合理？我们又该如何正确选用参考文献呢？一、参考文献怎么引用才合理（1）参考文献的类型
大学生在大四的时候需要写毕业论文，大家要想不被系统认定是超级的话，在借鉴输出内容时，一定要读懂整篇文章的内容，然后再融入自己的理解，用自己的语言来总结一下，这样就不会出现大段抄袭的问题。如果照抄文章的话，绝对会受到老师的批评。
一、要善于总结，不仅要了解表面意思，也要了解深层含义
现在论文的查重率也比较严格，因为之前的一起事故的发生，为了防止大家的论文出现意外情况，老师们的检查也是特别严格的，老师的查重系统和学生的查重系统也会存在一些差异，他们的更全面一些，所以查重率也会相对高一些，所以为了保险起见，大家在借鉴文章内容时，千万不要直接抄袭，不要将老师当成傻子。所以平常要了解这段语言的表面意思，同时也要了解生存含义，再经常总结将观点写在自己的论文当中。
二、用自己的话描述书中的内容
大学生在写作文时也会特别痛苦，因为大家需要查找很多文献，但是在写完论文之后也需要进行查重处理，如果在系统的判定之下大家的查重率比较高的话，也很难能够被老师接送，甚至有的学生会重新书写，这会浪费大家的时间，尤其是那些已经参加工作的人，根本没有太多时间去重新完成一份新的论文。 所以大家可以用自己的语言来描述书中的内容，因为有些书里的文章内容比较正式，语言比较精炼，但是通过自己的话来讲述一下，就会发现容易很多。
三、结束语
写论文时要切记焦躁，在引用别人文献之后，也要在论文到最后标注清楚。要自己写，不要总是请求别人的帮助，只有自己深刻理解整篇论文的内容，才能够在答辩的时候顺利通关，如果回答不上老师的问题，你也很难能够毕业。
根据学术堂的了解，在动手书写学位SCI医学论文之前，首先要在头脑里详细构思SCI医学论文的整体结构，多参考其他的SCI医学论文的写法，列出详细的提纲，并尽可能的详细，这样在动笔开始写作以后就不会脱题。建议作者在序言部分参考外文期刊所发表的 SCI医学论文的序言部分，要充分认识到序言部分的难度和重要性。因为每个研究者对于自己的研究技术方案、技术路线、实验过程、技术成果等很熟悉，心中一般都有数，容易表现出来。而序言部分要概括、总结和分析他人的工作，还要论述自己的观点，难度相当大。国内刊物发表的SCI医学论文，一般不太注重序言部分，学位SCI医学论文的序言也是相互搬迁的较多。因此，要提高SCI医学论文质量和水平，一定要在认真参考外文期刊文章的基础上，充分思考，可以先尽量写详细，然后根据需要再精简。不要开始简单，后来再修修补补，就难以形成系统性。还需要注意的是SCI医学论文摘要是SCI医学论文的意义、内容、特点的高度概括，500字左右的摘要应该简明扼要。还有，SCI医学论文要尽可能多的利用图形、表格、公式、数据表达意思，说明原理、方案等，有助于读者理解内容。SCI医学论文在评论他人的研究工作时，一定要客观，避免引起纠纷。特别是谈论其不足和缺点时，一定要慎重，没有把握时，且不可凭感觉或印象随意发表评论。参考文献中列出的文献，应尽可能的标注在SCI医学论文中。另外，一般对SCI医学论文的创新性没有特别的要求，但特点总应该有的，即使利用现成的方法、原理、工艺解决了生产或研究中的某个问题，也算有实用的特点。作者应尽力将研究工作的特点或创新点暴露给读者，有的研究生为了显示SCI医学论文的重要性，也不管是不是特点和创新点，列出一大串的特点和创新点，而有的根本不是特点和创新点。实际上，作为SCI医学论文，只要选题有一定的意义和工作量，作者能够独立完成，没有错误，有特点就符合基本要求，创新点或特点有2-3个就相当不错了。
医学论文格式范文
无论在学习或是工作中，大家总少不了接触论文吧，论文写作的过程是人们获得直接经验的过程。那么问题来了，到底应如何写一篇优秀的论文呢？以下是我为大家收集的医学论文格式范文，仅供参考，希望能够帮助到大家。
1引言（前言）
是医学论文开篇的一段短文，主要介绍本文的背景、理论依据、论文的范围目的与工作的收获、结果、意义等。可根据论文的需要或长或短。要求言简意赅，点明主题。如“我院内科1992年2月至1995年10月应用盐酸纳络酮治疗镇静催眠药急性中毒48例，与同期未用纳络酮治疗的42例对照比较，疗效满意，报告如下。”不可言过其实，尤其是诸如国内外罕见，未见报道，无先例，属最新水平之类，必须有充分证据，否则一般不用。
2临床资料（资料与方法）
是论著的主要内容，包括实验对象、器具、采用什么方法、多少病例（男多少、女多少）、如何分组、诊断手断、依据、治疗方法（用药）、疗效标准、观察及随访时间等等。应说明资料来源的时限、年龄、性别、职业的可比性。在此需要特别提醒注意的是说明疗效或某种方法时需设对照组，条件同等、随机分组、用药或检测采用双盲法对照。共同的是使读者具体了解该研究的具体内容，一方面便于理解和评价，另方面便于验证和仿行。任何科学成果，必须能够在方法同样条件下重复出同样结果，方能得到公认。因此，描述材料和方法以使读者能进行重复为度，过分简略固然不行，过分详尽也无必要。
资料中如数字较多可用统计图表表示。统计表应有表题和序号（一个表不用序号，列为附表）。统计表应按统计学原则制作，表格两端开口，不用纵线，只用一条纵线说明主语与谓语，表格左上角不用斜线。表格内避免繁杂，更不能与正文重复。
3结果
医学论文的中心部分。即实验研究、临床研究、分析观察、调查的各种资料和数据，进行分析、归纳，经必要的统计学处理后所得的结果。这是决定论著质量是否严谨，数据是否准确可靠，要求高度真实和准确，实事求是的撰写。失败就是失败，成功就是成功，不要人为地夸大成功率，且要消灭统计方面的误差。
4讨论
即将所得结论或研究结果，从理论上进一步认真分析。科学的推论和评价，证实所得结果的可靠性，阐明具有科学性、先进性的论据，从而取得大家的公认。通常讨论的'问题有：阐述该文研究的原理与机制；说明该文材料与方法的特点及其得失；分析该文结果与他人的异同及优缺点；根据该文结果提出新假设、新观点；对各种不同学术观点进行比较和评价；提出今后探索的方向等等。当然，一篇文章通常只讨论其中的某些方面，不可能面面俱到。重要的是，讨论必须紧紧扣住该文的研究结果，突出自己的新发现与新认识。有的医学论文讨论部分只是重复过去的文献，甚至抄袭某些专著和教科书的内容，这就失去了讨论的意义。
讨论的深浅、正确与否，很大程度上取决于掌握文献的多少和分析能力。因此，必须了解本专业的近况及动向，才能比较客观的得出正确的结论。
5医学论文的参考文献
只限于自己阅读过并引用的文献（必须是公开发行的刊物），按文内引用顺序排列写在文后，文内按1、2、3……顺序在引用处标出右上角码，如在右上角标注[1]或[1—3]或[1，4]最好是着重引用近年的（3—5年）期刊文献。医学论文参考文献的书写格式多采用温哥华式。
刊物：作者（两位作者可一并列上，中间加逗号；三位作者或以上，可只写第一作者，后加逗号及等），文题列于作者后（有的刊物略去文题），然后顺序列出刊物名称、年份、卷（期）：起迄页。
例杨亚辉。国内外胸心血管外科进展临床医学1995；15（6）：36
杨亚辉，等。国内外胸心血管外科进展临床医学1995；15（6）：36一38
书籍：依次顺序为作者，书名，版次，出版地：出版社，年份：起页～迄页
例张学礼主编，怎样撰写医学论文第一版，北京：中国医药科技出版社，1990：82—90
外文资料西文只用姓，不用全称，其它顺序同期刊。
参考文献不宜过多，论著8条、综述20条以内为宜。引用的文献必须具有价值，引用的论点必须准确无误。取其精华，引用部分要恰到好处，宁少勿滥。
医学论文参考文献引用的技巧经验
引用高质量的论文文献，在一定程度上反映了该论文学术水平的高低，从总体上体现了该论文的科掌性、实用性和先进性。
为了更好的论述自己论文的观点，论文作者就要使用到参考文献。参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴。征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。通过权威、高质量的参考文献内容论证自己的言论让更多的读者信服。
由于参考文献是编辑对论文进行学术鉴审的重要依据，因此，著录参考文献是否得当，直接关系到科研论文能否顺利发表，综述文章尤其如此。要想提高投稿命中率，引用和著录参考文献时一定要注意以下几个方面：
(1)引用新颖的论文文献。
引用文献是否新颖，在某种程度上体现了论文的先进性。太过陈旧的文献虽然也能论证自己得论点，但是却因为过于陈旧或被引用次数过多而导致文献本身的权威价值降低。因此，撰写科研论文应尽可能引用最新的文献。当然，在本领域有开创性贡献的旧文献也可适当引用，但绝对不宜过多。文献计量学研究结果表明，多数期利普赖斯指数(即期刊引用5年以内的参考文献数量占引用参考文献总数的百分比)在50%以上。因此作者撰写论文时要尽可能多地引用5年以内的文献，且至少不低于50%。这样才能符合一篇学术论文需要具备的新颖的特点;
(2)引用高质量的论文文献。
引用参考文献质量的高低在一定程度上反映了该论文学术水平的高低，从总体上体现了该论文的科掌性、实用性和先进性。这就要求作者平时注意阅读、积累权威医学期刊文献和权威专家的文献。高质量的文献就好比铁一般的事实，在论证自己的论点事，强而有力的论据便是支撑自己论文的最有效支点，所以我们在文献引用上要使用高质量文献，同时高质量的文献也是体现论文作者全面的阅读量和对该领域研究的了解程度;
(3)引用全面的论文文献。
引用参考文献一定要全面，尽可能全面地引用国内外相关研究成果。单独的全文引用中文文献或者外文文献都只能片面的说明，在国内或者国外的某些地方，这样的论点是存在的，或者成立的。所以便要求我们，在引用参考文献时要兼顾中文文献与外文参考文献，并以外文参考文献为主。然而，在引用大量外文文献的同时.也不能忽略国内某些相关研究的重要文献。尽管我国医学研究的总体水平较低，但仍有一些学者在国内乃至国际医学研究领域做出了开创性或重大贡献，这些国内知名专家学者往往被聘为相关专业期刊的编委和审稿人。因此，在大量引用国外文献的同时，适当引用这些专家学者的文献，对论文顺利通过审稿是十分有利的。除此之外，对文献的引用在内容上也要求具有全面性，只针对每个地方，或者某些特定条件下所撰写的论文文献，则需要根据自身论文的内容范围做出适当的选用;
(4)提高自引文献量。
文献的'引用，很大程度上是被认为引用别人的文献，但其实对自己文献和自身投递期刊文献的引用也是十分重要的。自引文献除了字面上理解的引用自己的文献之外，还有另外一种。其实自引文献分两种，其一为作者自引，其二为期刊自引。作者自引是指作者引用了自己以前发表的文章作参考文献，期刊自引是指该期刊引用了该刊以前发表的文献。如某作者在《中华内科杂志》发表的某篇文章中，引用的所有《中华内科杂志》的文献均为期刊自引。作者自引至少能向编辑和审稿人表明，该作者在本领域的研究已形成了系列化，而且越来越深入，易取得编辑和审稿人的信任，对论文发表将十分有利。期刊被引用次数多少是评价期刊质量及实用性的一个方面，也是衡量期刊社会效益及文献情报价值的重要指标。因此，编辑喜欢编发引用本刊文献较多的论文，作者欲向哪个期刊投稿，一定要重视引用该刊的文献。当然，这并不表示说可以不在乎自身论文的论点而胡乱的引用该期刊的文献，这样的文献堆积只是让自己的论文显得赘余，而且没有科学性;
(5)多引期刊文献，少引书籍文献。文献计量学研究成果表明，期刊文献被引次数最高，占被引文献总数的70%~80%以上。期刊文献是跟随期刊的刊发时间而定的，实时跟新是期刊最大的特点。期刊文献最典型的特征是内容新，科研价值高，而书籍文献，尤其是教材，其理论观点趋于成熟而固定，但内容陈旧，无太大的科研价值。毕竟一套书籍文献刊发之后，重新根据新技术跟新动态做出修改的速度十分的缓慢，甚至于未曾修改过书籍的内容。因此撰写医学论文一定要尽可能多地引用期刊文献，少引或不引书籍文献。但这并不表示就完全不适用书籍文献，某些有重大学术价值的专著也可引用，但也不宜过多。注意适当引用最新的专利文献和学位论文。
医学论文参考文献著录原则与格式
原则上，所有必要的参考文献，作者都应该引用，并进行标注。参考文献是指为撰写或编辑论著而引用的有关图书资料。引用参考文献时应按其在文内首次出现的顺序，依次以阿拉伯数字在文前文后标注。
引用的参考文献应该经过挑选
随着医学科学事业的不断发展和进步，医学文献的数量和种类不断增加。作者在选用参考文献的时候需要经过筛选，需要用自己的知识和鉴别能力、，从众多的相关文献中挑选出科学的、有说服力的、有代表性的文献。如国不严格筛选，可能会得出错误的结果，不仅误了自己，也可能会误导读者。
按照循证医学()的思想，汇总分析(metaInalysis)的证据等级是很高的。即便如此，如果没有严格的综述(review)设计，汇总的是众多设计不严密、结果不可靠的文献，结果很可能事与愿违。因此，作者参考和引用文献时，需选择，不可随意引用。
引用的参考文献应该仔细核对
对拟选用的参考文献要什细核对，以免出差错。不仅在文字和著录格式上要核对，在内容上;也要与原文核对。作者对选用的参考文献，应逐一阅读.以正确理解作者的本意。
笔者曾经处理过一篇综述，文后大约有20余条英文参考文献，经上网核查，其中18条有差错。差错的种类大致如下：①作者姓名引用错误：按照医学期刊一般的要求，应光标国外作者的姓，再标其名字的首字母、如BillClinton，应标为“Clinton B”。有些作者常把国外作者的名和姓颠倒了。②单词拼写错误这种差错多为作者粗心大意，或者因没有与原文核对，而是通过转引所致。③页码有误，或者只标起页未标止页。④增刊没有显示出来。5则书籍未标出版社的地址等。
以上例子说明，作者对引用的参考文献进行认真核对是十分必要的，是对读者负责，也是对自己负责。
引用的参考文献要忠实于原文
因为是引用别人的文献，作者无权更改原作者的本意，只需向读者介.介绍原作者使用的方法、得出的结果和结论等。作者可以对原作者使用的方法、得出的结果和结论等发表看法，但不能肆意更改，不管是故意的，还是无意的。
要想忠实于原文，最好的`办法就是用之前仔细阅读原文，正确理解作者的本意，尽量不要转引，以免以讹传讹，损害原作者、读者，还有自己。
应注意参考文献的著录格式
因参考文献的著录格人各刊不尽 相同，投稿前作者应注意杂志稿约的有关规定，至少得先看看有关期刊发表的论文的参考文献是如何标注的，以了解有关期刊的参考文献的著录格式，以免出错。
很遗憾，在实际工作中笔者发现，有不少作者投来的稿件书写格式包括参考文献的著录格式与杂志所要求的不同。坦率地讲，编辑和审稿专家也是人， 工作中多少也有感情因素。如果拿到手中的是一篇书写格式不合要求的文章，别的暂且不论，就书写格式不规范这一条，就足以给编辑留下不好的印象，甚至让编辑做出退稿的决定。就算最后没有被退稿，此类稿件较书写格式规范的稿件被录用的可能性大大降低。
其实作者犯的是一个很低级的错误，让编辑很自然地联想到，该作者不太尊重期刊，还有期刊的编辑以及审稿专家。因此，作者在投稿前一定要注意期刊参考文献的著录方式，以免产生不必要的负面影响。其实，并不复杂，只要，稍稍留意即可。
附：中华医学会系列杂志参考文献的著录格式
中华医学会系列杂志有固定的参考文献著录格式，但即便是同一种期刊，不同种类的参考文献的著录格式不相同。下面列出作者经常使用的发表在期刊和书籍中的文献的著录格式。
书籍
1.专著：需注明作者、书名、出版社及其地址、出版年份和起止页码等。
例1(中文)：戴自英，刘欲昆，汪复。主编实用抗菌药物学.第2版上 海科学技术出版社，～78.
例 2英文)： Guyatt G， Rennle D。 Users’guides to the medical literature-Chicago： AMA PrCss，。400。
3.专著中析出文献：例1(中文)：蔡映云.湿化治疗与雾化治疗.见罗慰慈，主编北京：人民军医出版社，1997362～365.
例 2(英文)： LIVOTffiofO DM;Williams of actionand mechanisms of bacterlal ：LOflapV， ：Will。flains&Wilkins，。578.
期刊
1.期刊不分卷：只需列出作者、题、刊名、发表年份、期序和起止页;即叮。如： Turanl， WredmarkFellander-TsalL. Arthroscoplc ankle athrodesls In rheumatoid . Orthop，1995，(320)：110。114.
2.期刊分卷，连续编页码;除了作者、文题、刊名、发表年份和起止页码外，还要标卷，但无须标期。如;邓伟吾。走出应用抗菌药物治疗误区。中华结核和呼吸杂志，2002，25：705～706
3.期刊分卷，每期单独编页码：需要同时标注卷和期。如汪国华，马进季适东，等.急性出血坏死性胰腺炎的手术治疗.中级医刊， 1995， 30( 8)：22～25.
4.期刊无卷和期：无法标注卷有期，只标年份、如 Browed DA， status of the cancerPatients and the effects of blood transfu-slon on ， 1993：325～333.
5.卷的增刊：需在卷后标注“增刊”(中文)或“SPPPI"(英文)字样。如： Clyde WA Jr. Clinical overview oftyplcalMycoplasma pneomonlae infections Clin Infect Dis，1993，17 Suppl l：532～536.
6.期的增刊：需在期后标注“增刊”(中文)或“SUpd”(英文)字样。如 Pnyne DK， Sullivan MD， Massie ’s psychological reactlons to Oncol， 1996，23(ISuPPIZ)：89-97
7.卷中分部：需在卷后标注分部。如： Ozben T， Nacitarhan S， Tuncer and unne slallc acid In non-Insu-lin dCpendent diabetes mellitus Ann ClinBiochem， 1995， 32(Pt3)： 303。306。
8.期中分册：需标注分册。如：Poole GH， Mills SM. One hundred con-secutive cases of flap lateraDons ofthelegin aging patients N Z Med J，1994，107(986Ptl)：377。 378.
医学论文从结构上，要分为4个部分：前言、方法、结果和讨论，即我们通常所说的IMRAD结构。这些个部分也是一篇医学论文的主体，而要撰写出一篇高质量的医学论文我们就需注意以下几个方面：一、引言引言也称前言，前言的写作应注意简洁明确地阐明研究的主旨和目的和想要回答的问题，同时就该问题向读者进行简介并给出必要的文献。就一篇5000字左右的论文而言，前言一般为150～200字最佳。前言部分的主要内容应该是告诉读者你为何要进行该项研究，从而使读者相信该研究的重要性。第一句话中应几乎包含均成说的所有内容，努力阐明与以前研究的不同之处，最好的引言也应包括对以前所有的相关研究的系统回顾，并证实该研究的必要性。不应使用让读者产生困惑的缩略语，要给出研究的设计而不是结论，同时不要涉及本研究中的数据，要谨慎地使用文学写作技巧。二、题目医学论文的题目是一篇论文核心内容的高度概括，是眼睛一般的存在，应尽量简明并概括主题。三、材料和方法材料和方法部分的写作，应当按照逻辑顺序来描述研究的设计，详细叙述研究的步骤或给出有关文献，给出对所得资料进行分析的方法。研究设计应包括：对其进行简洁的描述，告知读者如何进行随机化，应注意“独立、平行、配对、自身对照”等词语的使用，最好引用原始报道该设计和方法的论文、在叙述研究是如何进行的过程中，应告知读者如何选择研究对象，给出剔除对象的原因;准确而详尽地描述所使用的材料，给出所用药物的精确剂量，告知确切的治疗方式。在写作时，同时要注意医学研究中所涉及的伦理学问题，以人为对象的实验报告，应表明实验过程是否符合《赫尔辛基宣言》的标准。文章中不使用病人的姓名、缩写名或医院中的各种编号，若刊用人像应有病人的许可或采取遮蔽法。在分析资为附，应使用P值以证实无效的假设，对该研究的可信度进行评估，给出统计学分析所用的确切检验，避期时业阻液用缴作专门术语，还应指明所用的通用计算机程序。四、结果结果是论文的核心。是该研究所获得的数据经统计学处理或验证后得出的主要发现。该部分应回答在前言中提出的问题，采用文字、图、表并用的方式，说明与对照组比较的结果，也应告知意想不到的结果。当研究对象不足100例时，应避免使用百分数，10例以下时应使用分数表示。涉及结果时应给出样本数、范围、均值及标准差或可信区间，若涉及变异，应给出其自由度和F值。
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2011-07-24 回答医学论文一般有几种类型：综述、个案报道、病例分析、临床研究、科研课题论著、学位论文等等。医学论文的撰写要看你的经历和年资，这决定了您对问题理解、了解的深度和广度，也就是能力，简要建议如下：1、在校学生，一般只能写综述等理论探讨型的论文；2、低年资者，综述、病例个案报道、回顾性病例分析等。3、高年资者哪一种类型的论文都可以。至于怎么写医学论文，以下步骤供参考：结合自己平时的工作和学习，借助数据库查找相关的参考资料，大量参阅相关文献，筛选自己喜欢的、熟悉的内容，找出具有科学性、实用性的论点，着手撰写。以下内容供参考：医学论文的基本格式及写作方法（一）标题（title）标题要求：1.阐述具体、用语简洁：一般不超过20个字。2.文题相称、确切鲜明：标题体现内容，内容说明标题。3.重点突出、主题明确：突出论文主题，高度概括，一目了然。不足以概括论文内容时，可加副标题（破折号、括号或加序码）。（二）作者署名（author）1.作者署名的意义(1)明确论文责任：文责自负(2)获得应有的荣誉：载入科技发展的史册(3)文献检索的需要：著者检索(4)明确著作权：人身权和财产权2.作者署名的原则署名的个人作者，只限于选定研究课题和制定研究方案，直接参加全部或主要部分研究工作并做出贡献，以及参加撰写论文并对内容负责的人。(GB7713-87《科学技术报告、学位论文和学术论文的编写格式》)3.作者署名的要求(1)分为集体署名和个人署名。(2)第一作者应是论文课题的创意者、设计者、执行者，是论文的执笔者。(3)多人合写时，主在前，次在后；多单位合写时，用脚注标明。(4)作者人数不易过多，一般不超过6人。(5)指导、协作、审阅者可列入致谢中。（三）摘要（abstract）1.摘要内容和格式一般格式：(1)目的（objective）：说明论文要解决的问题及其起源、由来。(2)方法（methods）：说明研究时间、参加完成研究的患者或受试者的人数和研究的主要方法。(3)结果（results）：说明研究内容中主要结果，包括数据和统计学检验结果。(4)结论（conclusions）：说明主要结论，包括直接的临床应用。其它格式(1)目的（objective, purpose, aim, background）：论文要解决的问题及其起源、由来、研究背景。(2)设计（design）：论文基本研究设计。(3)地点（setting）：研究地点、单位、等级。(4)对象（subjects, patients）：论文研究的时间、参加完成研究的患者或受试者的人数和研究的主要方法。(5)处理（intervention）：论文的临床治疗和其它处理方法。(6)检测（measures）：论文为评定结果而进行的主要测试项目。(7)结果（results）：说明研究内容中主要结果和数据。(8)结论（conclusions）：说明主要结论，包括直接的临床应用。2.摘要的写作要求(1)连续写出，不分段落，不加小标题，不举例证。(2)格式规范化。(3)简短、完整，一般占全文文字的10%左右。(4)文字性资料，不用图、表、化学结构式。(5)内容基本一致的英文摘要。（四）关键词（key words）关键词是表达科技文献的要素特征，是具有实际意义的词或词组。主题词是规范化的关键词，关键词是具有灵活性和广泛性的自由语言。现阶段关键词和主题词都作为检索语言使用。由于关键词是自然语言，同义词、近义词、多意词未统一，造成检索误差，故目前多采用从医学主题词表（MeSH）中选择。1.关键词格式3-8个词或词组，之间空一格书写，不加标点符号。外文字符之间可加逗号，除专有名词的字首外，余均小写。2.选择关键词的方法(1)可从标题、摘要和全文内容中选择，以从标题中选择最常用。(2)要严格筛选，充分、准确、全面地反映文章的中心内容。(3)查阅医学主题词表确认。（五）引言（introduction）1.引言的基本内容(1)简要叙述研究此项工作的起因和目的(2)研究此项工作的历史背景(3)国内外对研究此项工作的研究现状和研究动态(4)强调此项工作的重要性、必要性和研究意义(5)适当说明研究此项工作的时间、材料和方法2.引言的写作要求(1)简明扼要，重点突出：一般为200-500字，约占全文的1/8-1/10。(2)实事求是、客观评价：不能蓄意贬低前人，切忌妄下断言。(3)少用套话：水平如何，自有共论。(4)勿与摘要相同，避免与正文重复：不涉及结果或结论。(5)一般不写“引言”字样标题。（六）材料与方法（materials and methods）1.材料与方法的主要内容(1)实验对象：①动物：名称、品种、数量、来源、年龄、性别、分组标准与方法。②微生物或细胞：种、型、株、系、培养条件和实验室条件。③临床病例：来源、数量、性别、年龄、病因、病程、病理诊断、分型标准、选择标准。(2)实验仪器：仪器设备名称、生产厂家、型号、操作方法、改进之点。(3)实验材料：药品和试剂的名称、成份、规格、纯度、来源、出厂时间、批号、浓度、剂量、给药方法、途径、用药总量。(4)实验方法与条件：①临床病例：观察方法、指标、治疗方法、药物名称、剂量、使用方法、疗程。②手术与标本：手术名称、术式、麻醉方法、标本制备过程。③实验室：实验与记录手段、观察步骤、指标、注意事项、方法改进及依据。（5）统计学方法：（七）结果（results）结果是论文价值所在，是研究成果的结晶。全文的结论由此得出，讨论由此引发，判断推理和建议由此导出。1.结果的内容(1)数据：不用原始数据，要经统计学处理。(2)图表：用于显示规律性和对比性。(3)照片：能形象客观地表达研究结果。(4)文字：对数据、图表、照片加以说明。2.结果的写作要求(1)按实验所得到的事实材料进行安排，可分段、分节，可加小标题。(2)解释客观结果，不要外加作者的评价、分析和推理。(3)结果要真实性，不可将不符合主观设想的数据或其它结果随意删除。(4)因图表和照片所占篇幅较大，能用文字说明的问题，尽可能少用或不用图表或照片。（八）讨论（discussion）讨论是论文的重要主体部分，是作者对所进行的研究中所得到的资料进行归纳、概括和探讨，提出自己的见解，评价其意义。1.讨论的内容(1)对实验观察过程中各种数据或现象的理论分析和解释。(2)评估自己结果的正确性和可靠性，与他人结果比较异同，并解释其原因。(3)实验结果的理论意义及对实践的指导作用和应用价值。(4)作用机制或变化规律的探讨。(5)同类课题国内外研究动态及与本文的关系。《如何写作和发表医学论文》写作和发表归纳为二十步，可供大家参考。信息来源：创 新 医 学 网（1)所写论文能否用一简单句子说明信息，其实亦即初步的主题。(2)是否值得写？以前有无类似的报道，这样一方面可避免重复，另一方面又可从以往作者的报道中有所借鉴，如表格的设计等。(3)论文的重要性。作者在论文中能否提出某些新论点或实践经验，供争论或参考。(4)根据所投杂志，写作时宜限定读者对象。(5)仔细浏览拟投稿杂志内容，了解该杂志性质，是否国外发行。(6)检索文献，通常从近5年开始，如资料不足，可再往前找5年，直到满意为止。(7)考虑参与本论文写作的作者名单。(8)分头收集、整理原始资料。9)仔细阅读稿约，这是动手写作前的重要步骤，务必符合其规则，所谓投其所好。(10)论文基本结构，是属论著、病历报告抑或综述。(11)列出原始草稿提纲。(12)写出草稿原文。(13)推敲、修改稿件至满意为止。(14)用准确、简练和流畅的文体书写。(15)应符合科学性要求。(16)选用适当的图表。(17)重修底稿以达到刊出要求。(18)复印留底，论文附介绍信寄编辑部。(19)答复编辑部来函的有关问题，修正后迅速寄出。(20)对将刊出的稿样细心、认真、逐字校对后（所谓校红）寄回编辑部，静候佳音。
1、论文题目：要求准确、简练、醒目、新颖。2、目录：目录是论文中主要段落的简表。（短篇论文不必列目录）3、提要：是文章主要内容的摘录，要求短、精、完整。字数少可几十字，多不超过三百字为宜。4、关键词或主题词：关键词是从论文的题名、提要和正文中选取出来的，是对表述论文的中心内容有实质意义的词汇。关键词是用作机系统标引论文内容特征的词语，便于信息系统汇集，以供读者检索。 每篇论文一般选取3-8个词汇作为关键词，另起一行，排在“提要”的左下方。主题词是经过规范化的词，在确定主题词时，要对论文进行主题，依照标引和组配规则转换成主题词表中的规范词语。5、论文正文：（1）引言：引言又称前言、序言和导言，用在论文的开头。 引言一般要概括地写出作者意图，说明选题的目的和意义, 并指出论文写作的范围。引言要短小精悍、紧扣主题。〈2）论文正文：正文是论文的主体，正文应包括论点、论据、 论证过程和结论。主体部分包括以下内容：a.提出-论点；b.分析问题-论据和论证；c.解决问题-论证与步骤；d.结论。6、一篇论文的参考文献是将论文在和写作中可参考或引证的主要文献资料，列于论文的末尾。参考文献应另起一页，标注方式按《GB7714-87文后参考文献著录规则》进行。中文：标题--作者--出版物信息（版地、版者、版期）：作者--标题--出版物信息所列参考文献的要求是：（1）所列参考文献应是正式出版物，以便读者考证。（2）所列举的参考文献要标明序号、著作或文章的标题、作者、出版物信息。
测序行业的蓬勃发展，带来微生物组学日新月异的变化。目前，单一组学的文章不断“贬值”，前沿研究的目光从单一组学逐步拓展至多组学对贯穿分析，即结合多个组学的分析角度，从多个层面阐述生物学机制。
微生物多组学贯穿分析策略十分丰富：如常见的16s与宏基因组贯穿分析，可以验证物种的特征、丰富功能的探究；而16s与代谢组的贯穿分析思路同样常见于高分文章中，通过16s探究不同处理/环境下菌群的物种组成变化，结合代谢组对应的代谢物的变化，进而找到不同处理/环境下引发细菌丰度差异最终导致代谢表型差异的机制。参考阅读《选好思路和方法，给自己一篇多组学高分文章 》
在16s与代谢组贯穿分析中，相关性热图是一个重要的分析手段，主要用于逐一呈现细菌物种与代谢物间的相关性高低，是筛选潜在关联的物种与代谢物的主要途径，对于下游的实验起到指导意义。此类相关性热图在高分文章中频繁出现，足见其重要性（图1、图2）。
图1 物种代谢物热图（2015，Cell Host& Microbe，IF= ）[1]
图2 物种代谢物热图（2018，NatureMedicine，IF=）[2]
那么，该如何画出此类高分文章中的相关性热图呢？这里，以16s与代谢组的数据为例，向大家分享如何使用R语言进行两个组学数据的相关性计算、绘制相关性热图。
1.加载R包
library(psych)
library(pheatmap)
library(reshape2)
2.读入数据
phy <(file = "", sep = "t", header = T, 1)
图3 微生物丰度信息表格
met <(file = "", sep = "t", header = T, 1)
图4 代谢物丰度信息表格
3.计算相关性、p值
cor <(phy, met, method = "pearson",adjust= "none")
cmt <-cor$r
pmt <- cor$p
head(cmt)
head(pmt)
4.数据保存
<-cbind(rownames(cmt),cmt)
( "",sep= "t",)
图5 相关性系数表格
<-cbind(rownames(pmt),pmt)
( "",sep= "t",)
图6 p值表格
df <-melt(cmt, "cor")
df$pvalue <- (pmt)
head(df)
(df,file= "",sep= "t")
图7 关系对信息
5.绘制显著性标记
if(!(pmt)){
ssmt <- pmt<
pmt[ssmt] <- '**'
smt <- pmt > pmt <
pmt[smt] <- '*'
pmt[!ssmt&!smt]<- ''
} else{
pmt <- F
}
6.绘制相关性热图
mycol<-colorRampPalette(c("blue","white","tomato"))(800)
pheatmap(cmt,scale = "none",cluster_row = T, cluster_col = T, border=NA,
display_numbers = pmt,fontsize_number = 12, number_color = "white",
cellwidth = 20, cellheight =20,color=mycol)
图8 R语言绘制的物种+代谢物相关性热图
pheatmap(cmt,scale = "none",cluster_row = T, cluster_col = T, border=NA,
display_numbers = pmt, fontsize_number = 12, number_color = "white",
cellwidth = 20, cellheight = 20,color=mycol，filename= "")
参考文献
[1]Kostic AD, Gevers D, Siljander H, et al. The dynamics ofthe human infant gut microbiome in development and in progression toward type 1diabetes. Cell Host Microbe. 2015;17(2):260–
[2]Hoyles, Lesleyet al. “Molecular phenomics and metagenomics of hepatic steatosis innon-diabetic obese women.” Nature medicine vol. 24,7 (2018):1070-1080. doi: 原文
转自医学方
2019-07-4 Alexander
流行病学或者医学论文中，对研究对象基本情况的描述通常以表格的形式进行，并且放在结果部分的开头，即Table 1，主要内容是研究对象一般情况和研究变量或协变量的分组展示。
前几天文章修回过程中，花了两天时间分析数据，修改文章，其中有近1天的时间都在手动录入数据（从R studio里把分析结果整理到Excel或者word），这样除了花费时间外，还非常容易出错。之前一直想找时间通过R markdown把制作表格的过程程序化，可是效果并不理想。
这次痛定思痛，先从table 1开始，发现了几个不错的方法。其中一种个人觉得可读性和可编辑性都比较强，于是学习了一下，作为一个非常实用的工具分享给大家。
这里主要参考一篇博客Fast-track publishing using knitr: table mania，对细节进行了加工和注释。
1 数据的准备
数据主要来自于boot包的melanoma。加载后，看下数据的基本结构。
接下来对数据进行简单的整理，为后续分析做准备；
将分类变量定义为因子型并设置标签（这里建议设置一个新的变量，仅用于table 1的制作，不影响后续的分析）；
2 安装和加载R包 Gmisc
后面两个包是加载“Gmisc”时要求加载的。
3 自定义函数、制作表格
根据已有函数自定义函数，并制作表格。定义一个函数，输入数据集的变量并得到该变量的统计结果：
函数定义完成后，建立一个空的列表，以储存每个变量的分析结果，并进行分析，将结果储存在列表中：
将所有结果merge到一个矩阵中，并建立rgroup（table1第一列的变量名） 和 （table 1第一列每个变量的行数）：
结果如下：
当然，有些情况下，需要多加一个分组标题栏（column spanner），该怎么加呢？
如下：
结果如下：
4 导出结果
在R studio viewer窗口点击白色按钮，即可在浏览器中打开，然后复制粘贴到word可以进一步加工修饰。
是不是很刺激呢。 应该还有其他的导出方法，不过这个已经很方便了。
拓展功能选
⒈ 二分类变量只显示一个（比如男性和女性）。只要在getDescriptionStatsBy的"show_all_values"参数设置为FALSE即可；
⒉ 显示缺失值。getDescriptionStatsBy的"useNA"参数设置为"ifany"，表示如果有缺失值就显示缺失值情况；如设置为“no”，表示始终不显示缺失值情况；“always”则表示无论是否有缺失值都显示缺失值情况；
⒊ Total一列是可以去掉的，getDescriptionStatsBy的"add_total_col"参数设置为FALSE即可。
不足之处
⒈ 差异性检验是采用非参的方法，虽然没有错，但是一般符合参数检验条件的数据还是要使用参数检验的方法，这里可以自行检验后再修改P-value；
⒉ Mean (SD)的展示形式有个括号感觉有点别扭，还不知道怎么去掉，有方法的小伙伴欢迎分享交流。
另外有一些其他的制作table 1的R包，比如table 1（R包的名字）包，tableone包，还有其他生成表格的R包（plyr等），个人浏览下来感觉这个最容易理解和掌握，其他包的功能有兴趣的可以再自行挖掘对比。
原文链接：
科学论文是科研成果的主要产出形式。撰写科学论文是一个科学工作者必须具有的基本功。学习撰写科学论文是每一个研究生的必修课，但必须通过实践才能学好。下面上学吧论文查重分析一下sci论文写作技巧，欢迎查看。什么是sci论文?sci(scientific citation index)是美国科学信息研究所(isi)编辑出版的引文索引类刊物，创刊于1964年。分印刷版、光盘版和联机板等载体。印刷版、光盘版从全球数万种期刊中选出3300种科技期刊，涉及基础科学的100余个领域。每年报道60余万篇最新文献，涉及引文900万条。进入sci这一刊物的论文即为sci论文。sci选录刊物的依据是文献分析法，即美国情报学家加费尔德提出的科学引文分析法。该分析法以期刊论文被引用的频次作为评价指标，被引频次越高，则该期刊影响越大。在一定时期(通常是前两年)内，某一刊物发表的论文，被已经进入sci刊物的论文所引用的总次数，除以该刊物这一时期内的论文总数，即为该刊物的影响因子。isi对全球的自然科学刊物进行考察，凡影响因子大于某一临界值的刊物，则可以进入sci系统。进入sci系统的刊物分为两类，即内圈和外圈，前者的影响因子高于后者，前者称为sci刊物，后者称为scisearch刊物。sci刊物还分为影响因子高区(大于)、中区(在和之间)和低区(小于)3类。衡量期刊特性的，除了影响因子外，还有及时指数(immidiacy index)和被引用半衰期(cited half life)。及时指数是指一种期刊当年发表的文献在当年被引用的次数与当年的文献总数之比。此指标表示期刊论文所述的研究课题在当前的热门程度。被引用的半衰期是指一种期刊各年发表的文献，在当年被引用次数逐年累计达到被引用总数的50%所用的年数。被引用半衰期反映期刊论文研究题目的延续时间，即期刊论文时效性的长短，或知识更新的快慢。在选择投稿的刊物时，可以综合考虑以上各个指标。sci论文的重要性：随着全球化，科学研究也日益全球化，sci论文是进行国际科学交流的重要方式，也是使国际同行了解我们的主要渠道发表sci论文，可以向世界显示我国基础研究的实力，提高我国在世界科学界的地位。在世界著名刊物如nature和science上发表一篇重要文章，对于某一学科而言，其意义不亚于在国际比赛中取得一块金牌。发表sci论文的多少和论文被引用率的高低，是国际上通用的评价基础研究成果水平的标准，是招聘、提升、考核、评奖的重要指标。就基础研究而言，在什么样档次的刊物上发表的论文，便具有什么样档次的水平，一目了然，一般不再需要鉴定。如果成果不是在国际知名的sci刊物上发表，便很难被认为是国际水平的。发表sci或ssci论文是与资源所基础研究领域博士生取得博士学位的必要条件。也是联系出国深造时使国外导师了解自己的最好方式。好文章的起码要求：clear: 思路清晰、概念清楚、层次清楚、表达清楚complete:内容完整、结构完整匀称，切忌虎头蛇尾，有始无终correct：科学内容正确(不出错)、资料数据正确(数据可靠、可信)、语言正确(无语法错)concise：论述深刻、充分揭示其科学内涵、使用定量方法怎样撰写向sci刊物投稿的科学论文?据估计，属于语言和写法方面的原因而退稿的，占30-40%;属于实质性内容的原因而退稿的，占60-70%。为了有的放矢，应该首先分析向sci刊物投稿命中率低、退稿率高的原因：无新意，重复他人工作(国际刊物最欢迎的是具有原始创新性的工作);有新的发现，但未能很好地提炼、升华并上升到理论的高度;单纯的定性描述，缺乏定量的、理论的分析;仅仅是区域性(local)的工作，而不是具有普遍意义、可以推广到其他地方的的工作(general)，即仅仅是国外方法在中国某一地区的应用，而不是提出新的方法;文章组织得不好，文字功夫欠佳，国外审稿人难以看懂。怎样使研究工作具有新意?采用新技术、新仪器对自然过程进行观测，取得新资料;对新资料进行分析，提出新概念;在新概念的基础上建立新理论。用新的思路、理论或方法对前人取得的观测资料进行分析，得到新的结论。立足于我国特有的自然条件(如黄土高原、黄河、青藏高原、喀斯特地貌等)，发现新的自然现象和自然规律。对前人建立的模式或理论提出质疑，建立修正的模式。怎样对观测资料进行提炼、升华?以新的理论、概念为指导。如地貌学的临界理论、复杂响应理论。建立模型：经验统计模型;有物理基础的模型;模糊模型;系统动力学模型;灰色系统模型;分形模型;人工神经网络模型等。在资料分析的基础上，提出新概念、新方法、新理论。在gis平台上进行研究成果的集成与表达。怎样进行文章的组织?文章的结构语言图表提要：研究的主要科学问题和目的、方法，主要发现、结果、结论。应具有自明性。关键词：准确、规范、不要太偏(否则会影响文章的引用)前言：提出问题介绍论文的背景，本领域的前人研究与现状，尚有哪些问题有待解决，进而提出本文研究的问题和目标。方法(理论或观测技术)所取得的资料(资料是如何取得的，对资料精度的分析)分析与结果(逻辑推理、理论推导、建立模型、模型的验证);结论。语言：使用严格的科学术语，不使用未经定义的似是而非的说法，对于自己首次提出的概念要给出明确的定义;语言要准确，少用语言，切忌将科学术语生硬地译回到中去，使国外审稿人不知所云;要有较强的逻辑性，推理要由充足的理由(已知的原理或事实的依据)，不要做大跨度的跳跃。可以看一点逻辑学的书，包括数理逻辑，以提高思维的严密性。写出地道英语论文的窍门：多读，多记，多背，不妨采用小学生学作文的方法，多背一些句子甚至段落。当语言掌握到一定程度时，可直接写出英文，而不要先写中文，再逐句甚至逐词。只有能用英语思维的人才能写出好的英文。多投稿，国外审稿人常会对语言进行修改，与你的写法对照，会有很大收获。图表：地图是地理学家的特殊语言，是地理研究成果的结晶。用相关图、变化曲线、分布图来表示所取得的成果，比语言叙述要直观得多，而且也更加具有定量意义。如果还是有不懂的可以去上学吧论文查重，里面有更多的相关知识
r语言在生物医学领域的应用如下：
R语言在医学科学研究中应用广泛，典型的应用包括：机器学习技术可以帮助研究人员构建和改进机器学习模型，建立影响治疗效果的变量；统计学分析可以帮助研究人员确认实验结果是有意义的或不可信的；R语言支持高级图形，可以帮助研究人员清楚地表达结果。
此外，R语言还提供数据预处理、建模和分析的工具和框架，从而使得研究者能够更有效地运用自己的精力和时间，以更快的速度完成研究。
总的来说，R语言是一种实用的软件，可以帮助研究人员快速进行医学研究，从而更快地获得结果。R语言的优势在于涵盖的范围较广，提供的功能较强，可扩展性强，而且可以免费使用。因此，建议研究人员在研究过程中尽可能多地使用R语言，以更好地实现研究目标。
我们日常所说的R语言，R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。R是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的S语言的一个分支。可以认为R是S语言的一种实现。
根据学术堂的了解，在动手书写学位SCI医学论文之前，首先要在头脑里详细构思SCI医学论文的整体结构，多参考其他的SCI医学论文的写法，列出详细的提纲，并尽可能的详细，这样在动笔开始写作以后就不会脱题。建议作者在序言部分参考外文期刊所发表的 SCI医学论文的序言部分，要充分认识到序言部分的难度和重要性。因为每个研究者对于自己的研究技术方案、技术路线、实验过程、技术成果等很熟悉，心中一般都有数，容易表现出来。而序言部分要概括、总结和分析他人的工作，还要论述自己的观点，难度相当大。国内刊物发表的SCI医学论文，一般不太注重序言部分，学位SCI医学论文的序言也是相互搬迁的较多。因此，要提高SCI医学论文质量和水平，一定要在认真参考外文期刊文章的基础上，充分思考，可以先尽量写详细，然后根据需要再精简。不要开始简单，后来再修修补补，就难以形成系统性。还需要注意的是SCI医学论文摘要是SCI医学论文的意义、内容、特点的高度概括，500字左右的摘要应该简明扼要。还有，SCI医学论文要尽可能多的利用图形、表格、公式、数据表达意思，说明原理、方案等，有助于读者理解内容。SCI医学论文在评论他人的研究工作时，一定要客观，避免引起纠纷。特别是谈论其不足和缺点时，一定要慎重，没有把握时，且不可凭感觉或印象随意发表评论。参考文献中列出的文献，应尽可能的标注在SCI医学论文中。另外，一般对SCI医学论文的创新性没有特别的要求，但特点总应该有的，即使利用现成的方法、原理、工艺解决了生产或研究中的某个问题，也算有实用的特点。作者应尽力将研究工作的特点或创新点暴露给读者，有的研究生为了显示SCI医学论文的重要性，也不管是不是特点和创新点，列出一大串的特点和创新点，而有的根本不是特点和创新点。实际上，作为SCI医学论文，只要选题有一定的意义和工作量，作者能够独立完成，没有错误，有特点就符合基本要求，创新点或特点有2-3个就相当不错了。