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论文投稿期刊审核流程通常会有三审：初审-复审-终审。
初审、收到文章后一般会有征稿/执行编辑（managing editor）对论文进行格式与材料等初审。初审主要简单审核稿件是否符合本刊要求，审核作者资历和单位信息，然后看作者的信息是否完整，文章格式是否符合要求。
复审、初审通过后会发给主编，主编看过后会进行评估，如果认为文章达到本社的基本要求就再把稿子递给领域相近的编委。编委会根据论文主题来邀请审稿人（同行评审），一般审稿人国内就2-3人左右，SCI期刊也就最多5人左右（质量越高的刊，审稿人越多且专业权威）。
审稿专家返回审稿意见后，编委会给主编作出建议（主编一个人是看不完所有文章的，所以一般都会采纳编委的意见）。总体来说，越好的期刊审稿人数越多，也越容易被拒稿。
审稿速度缓慢可能有种种因素：期刊编辑指导不够清晰；同行评审速度慢；来稿量增多；每篇论文的数据量增加等等。复审时，如果遇到社内有提出审稿意见，会将稿件退给作者修改，修改达到要求后进行录取，修改达不到要求就做退稿处理了。
终审、一般到了这一步，没有什么大问题的话基本不会退稿的。总编对标题、版式、内容审核后提出修改意见或批清，投稿者就按照杂志社的要求最后改改就好了。要求一般是将文章内的图片，表格等源文件发送给编辑，便于排版等等。
学校除了对论文的重复性有要求外，还会规定论文的格式，一篇合格的论文需要符合以下两个方面的要求。所以，当我们进行论文查重的时候，格式是否会影响检测结果呢？
1、影响论文查重的结果
论文查重系统在检测论文时，会根据论文的格式对内容进行分割，将论文分成大小不同的片断进行查重，不计算重复率的内容在检测时会自动剔除。若论文的格式不正确，则论文查重系统可能会将一些原本不算重复的内容判定为重复，导致重复率过高。
2、影响检测报告
论文格式正确，查重系统能自动识别目录、参考文献等内容，并将这些内容排除在外，论文查重报告更清晰、更准确地显示各部分的重复率，有利于我们以后的论文修改。相反，如果格式不对，会导致论文查重报告中的数据混乱甚至丢失。
3、影响论文的字数
论文的格式错误会导致论文查重系统无法准确地识别文章内容，从而无法准确地计算论文字数，在计算重复率时，会出现字数过多，导致查重结果不准确。
4、影响引用率
论文中引用的参考文献一般不计算重复率，但这是在论文格式正确的前提下，若有错误，查重系统将无法区分引用与正文。这就产生了两种情况，一是引用率低，但重复率很高；二是引用率高，重复率也很高。
论文格式排版会影响论文查重。 论文格式排版会影响： 1、对论文查重报告总字数的影响 word排版很可能影响论文查重报告的总字数，因为如果排版正确，系统将自动识别目录，参考文献等将自动排除在文本检测之外，从而影响知网查重报告的总字数。 2、对论文查重引用的影响。 word文档排版是正确的，引用写规范的情况，那么参考内容就可以根据引用来识别，并且可以检测到文章的引用率。 3、对论文查重章节查重结果的影响 word排版规范，目录是自动生成的目录，系统会根据目录的规格划分为各章进行检测，这样就可以得到每一章的重复信息，这更有利于我们对报告进行分析。更加内容让我们去了解论文。 4、对知网查重总结果的影响 word排版是不规范的，那么目录、参考资料等都有可能被检查为文本，从而标记为红色，这样总文本的重复率就会增加。造成这一后果的主要原因是，参考文献的格式不标准，而引用的格式是以插入的形式输入的。
论文格式不会影响论文查重的结果，主要的是你论文的内容才会起到最主要的影响。
上传重检论文。毕业论文二稿忘记给导师看了，上传学校系统导师审核通过了可以直接上传重检论文即可覆盖原检测论文，上传后导师和学院还需再审核一次，审核通过后才能进行重检。
可以退回，重新修改查重。任何时候在进行论文查重检测都要全面考虑问题，论文查重检测后是可以再次进行修改调整的，也是可以根据自身实际情况不进行修改调整。当教师选择了“退回修改”，则学生重新修改论文，重新提交，教师重新审核（退回修改\允许查重）。
最好是更改过来，不会影响学位证书的，只是可能会抽查检查，如果出现问题就不好了，导师也会受牵连的。
硕士毕业论文为硕士研究生所撰写的学术论文，具有一定的理论深度和更高的学术水平，更加强调作者思想观点的独创性，以及研究成果应具备更强的实用价值和更高的科学价值。共分为12大类。
硕士学位论文注意事项：
1、摘要中应排除本学科领域已成为常识的内容；切忌把应在引言中出现的内容写入摘要；一般也不要对论文内容作诠释和评论(尤其是自我评价)。
2、不得简单重复题名中已有的信息。比如一篇文章的题名是《几种中国兰种子试管培养根状茎发生的研究》，摘要的开头就不要再写：“为了……，对几种中国兰种子试管培养根状茎的发生进行了研究”。
3、结构严谨，表达简明，语义确切。摘要先写什么，后写什么，要按逻辑顺序来安排。句子之间要上下连贯，互相呼应。摘要慎用长句，句型应力求简单。每句话要表意明白，无空泛、笼统、含混之词，但摘要毕竟是一篇完整的短文，电报式的写法亦不足取。摘要不分段。
4、用第三人称。建议采用“对……进行了研究”、“报告了……现状”、“进行了……调查”等记述方法标明一次文献的性质和文献主题，不必使用“本文”、“作者”等作为主语。
5、要使用规范化的名词术语，不用非公知公用的符号和术语。新术语或尚无合适汉文术语的，可用原文或译出后加括号注明原文。
6、除了实在无法变通以外，一般不用数学公式和化学结构式，不出现插图、表格。
硕士论文外审不过关是因为整体框架存在比较大的问题。论文写的像报告，不像硕士论文。研究方向有问题，或者不够严谨。一般来讲，只要没有以上这三个问题，外校老师打得分数不会低于60分的。
论文写作一开始就必须严格按照教务处论文的模板来，从封面、摘要、正文一直到参考文献，以及页脚注释的所有格式，都必须一模一样，否则到了后面再修改会有很多格式问题发现不了。
论文整体以三章为普通，第一章提出问题，第二章分析问题，第三章解决问题。也可以有四章或者是五章，但是如果再多的话就说不过去。
以上内容参考 百度百科-硕士论文
硕士论文盲审一般不过的情况有：细节性和规范性错误、学术观点和逻辑方面的硬伤、抄袭问题等。
1、细节性和规范性错误
主要集中：错字、病句、注释、引文环节。这类错误，在导师们看来，都是最明显、最低级的错误，背后反映出的是一个写作态度是否认真和端正的问题，水平不够比较容易得到谅解，但是涉及态度不端正则是一个很容易被导师们放大的问题。
2、学术观点和逻辑方面的硬伤
基本主要集中在逻辑不通、理论和研究对象两张皮、选题太偏三个方面。一般来说，论文都要遵循一个提出问题、分析问题、解决问题的逻辑来论证。但有些论文的逻辑明显是错乱颠倒的。理论是理论，现象是现象，两者高度分离，没有很好交融。选题太偏主要表现为与本专业距离过远。
3、抄袭问题
硕士论文被否决的情况还有抄袭，但鉴于现在硕士盲审之前普遍都会有论文查重环节，所以这个环节可以忽略不计。
论文中，不乏中规中矩、精致的平庸之作（符合学术规范，研究对象较为明确，论证逻辑较为清晰合理），缺乏从选题、方法、到观点的让人眼前一亮的论文。如果自我期许很高，可以朝着后者努力，如果自我期许不高，仅仅是为了毕业就业，前者是底线。
会不通过。论文缺少新意：论文外审环节当中会对论文的原创性进行审查。实验论点复制别人已发表的文献，或经过简单推理就能从已知的论文文献中推理得到的，或复制他人成果的论文常被拒稿。分析不到位：在外审环节中论文虽有新的发现，但是没有提炼升华并上升到理论的高度。只有单纯的定性描述，缺乏定量的、理论的分析也常常会被拒稿。只要盲审2个专家通过，或者外审的2个专家通过就取得答辩权利，答辩委员会不包括外审专家，要半数通过就能够毕业。
会不通过，以下是原因：
1、文章创新性不够，创新性是一篇学术论文的灵魂，期刊级别越高，对文章的创新性要求就越高，如果文章中缺乏新观点新理念，只是一些别人已经研究发表过的论点论据，文章必然难以通过外审。
2、文章中的专业内容有误，或者实验方法有问题，这是一点致命错误，之所以请外部专家来完成外审就是因为这些专家能精准的发现文章中存在问题的专业内容，专业内容有误说明作者的知识储备不够扎实，学术态度也不够严谨。
3、文章中的数据、文献不充分，也就是文章中的论据还不足以支撑论点，这一点问题相对容易解决，作者只需要按照专家的建议补充一些必要的数据文献资料即可。
3、文章的新颖度没有达到标准。这一点是外审专家非常在意的一点，文章的新颖度非常重要，如果你的文章没有新颖度甚至研究的都是别人已经研究过的点，基本就会被淘汰。
4、文章的专业度必须强。外审专家如果发现你的文章存在专业性的问题是非常致命的错误，专业度表现了你专业知识的牢固和学术态度的严谨。
5、参考文献和数据准备不充分。参考文献是这篇稿件价值的参考依据，因此文章的文献要补充完整。
总结而言，其实无论如何都离不开文章的核心内容，所以大家在外审时遇到这些问题需要及时进行调节，把控好文章的专业内容，科学合理且严谨，就是提高外审通过率的关键所在。
硕士论文公式格式有问题外审很可能不过。 正常来说研究生毕业论文要求还是比较严格的，如果书写方面比较多的错误最好还是订正一下，不然很可能通不过。
硕士：
硕士研究生，即攻读硕士学位的研究生，简称硕士生，人们日常生活中所说的考上了硕士，读硕士等，正是指硕士研究生。硕士研究生是本科之后的深造学历，与本科生相比研究生教育更注重培养学生的研究问题和分析问题的能力，特别是该学科科研教学的能力。硕士是一个介于学士及博士之间的研究生学位（Post-Graduate），拥有硕士学位者通常象征具有基础的独立的思考能力。
关于论文数据有错误的后果如下，论文数据有非常大的错误，明显是不对的，结果那么盲审基本是不会被通过的。因为数据能够从侧面反映出论文中的实验是否成功，是否按照标准来做。 当然如果说数据只是细微的差错，那也无关紧要，盲审也会让过的
不好过，盲审肯定会比一般审查严格一些。
盲审是指一种组织专家组评审的制度，就是匿名送审，意味着评阅导师不知道论文作者是谁。所以在好又多论文网看来，硕士论文盲审通过的问题，还是应该回到本质上，提高你硕士毕业论文的质量。某些学校20%以上30以下可以修改再答辩，但部分学校20%-30%直接延期一年毕业。
按学科分布来说，盲审通过率最低的是工学，通过了为，其次为哲学，通过率为，低于80%的学科还有艺术学，农学，教育学，法学达到平均值，通过率最高的是医学，为97%，经济学，理学的通过率也比较高。
问题关键在于，一般的审查是自己学校的老师审查，因为是自己学校，导师之间也熟悉，可能会容易过一点。盲审是送到其他学校，由其他学校的老师来审查（有可能是几个不同学校的老师组成一个审查组），会更严一些，所以不要赌概率，准备充分才好。