梁方仲在清华大学经济系读书时，就以财政学为主修课程，以田赋问题为研究中心，进行学习和研究。进入社会科学研究所后，在挚友吴晗的鼓励和帮助下，决心专攻明代田赋史。此后一直沿着研究中国社会经济史的学术道路不断前进，不断扩大研究领域。在研究生时代，他就努力写作论文。1933年在《清华周刊》和《地政月刊》分别发表了《明代田赋初制定额年代小考》和《明代鱼鳞图册》的论文。后文运用了正史、实录和许多地方志的资料，论述了鱼鳞的由来，内容和作用，并阐明它与黄册的关系。论文发表后，便得学术界的好评。日本东京帝国大学东洋文化研究研究员仁井田升，称它为这方面研究的代表作。 1934年2月，入中央研究院社会科学研究所，仍以明代田赋制度为研究课题。同年5月，与吴晗等人在北京组成史学研究会，并出版《中国社会经济史集刊》，梁方仲任《集刊》主编。他组织发表了一批以新方法研究经济史的具有相当高学术水平的经济史论文，表现了当时研究经济史的进步倾向。他于1935年在《集刊》发表长篇论文《明代户口、田地赋税统计》，运用经济计量学方法研究明代社会经济史；1936年又发表了对明代田赋史带有总结性的论文《一条鞭法》，该文被译为日文、英文，在日、美发表，受到国内外学者的重视。1937年6月，梁方仲到日本进行学术考察；1944～1947年又到美国、英国去研究和考察，被哈佛大学聘为专职研究员。在这期间，他逐步形成一整套研究中国社会经济史的独特看法。他认为，社会经济史发展的总趋势是：一方面分工越来越细；另一方面各学科间互相渗透，需要进行多学科的综合研究，才能发现社会经济发展的规律。他后来回国研究中国社会经济史，虽着眼于某一具体经济史专题，却是把历史学、经济学、社会学、统计学等学术研究冶为一炉，进行综合的多学科的研究。 1950年后，梁方仲开始以马克思主义为指导，重新分析所掌握的史料，进一步深入研究一条鞭法。1951～1952年连续发表了《明代一条鞭法的论战》、《明代一条鞭法年表》、《易知由单研究》、《明代粮长制度》等论文和专著，基本上完成了以一条鞭法为中心的明代田赋制度的科学研究。以后，他在汤明檖的具体帮助下，全力编著《中国历代户口、田地、田赋统计》一书，1962年完成交上海人民出版社，后因“文化大革命”的干扰，至1980年才出版发行。这本七十六万字的巨著，是中国自前汉迄清末二千一百多年历代人口、田地、田赋的大型历史统计专书。他从中国的正史、政书、方志、文集、笔记和档案等两百多部文献史料中，搜剔出历代户口、田地、田赋的大量数据，加以科学的考核测算，综合编辑制成二百四十二个统计表格和六个统计图表，使读者一目了然，获得国内外专家的高度评价。
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