第一周刊为“药房与药事”专题，主要栏目包括：药业专论、药事管理、实验研究、药房管理、制剂与工艺、药品检验、药师之友、药店与执业药师、综述讲座等；第二周刊为“药房与临床”专题，主要栏目包括：药物警戒与干预、药物经济学、用药分析、临床药学、药物与临床、不良反应监测、药学服务、药师与临床等；第三周刊为“药房与中药”专题，主要栏目包括：中药论坛、中药研究、中药工艺与制剂、中药临床、中药分析与鉴定、中药资源与栽培、中药视窗等；第四周刊为“药房与基本药物”专题，主要栏目包括：药物政策、基本药物论坛、药品价格、药品招投标、基本药物配送、基本药物应用、医疗器材、基层医药等。 《中国药房》杂志的影响因子、总被引频次等指标，多年来在《中国科技论文统计源期刊引证报告》药学类刊物中名列前茅，在美国《化学文摘》（CA）2008年引文频次最高的1000种期刊列表中名列第69位（位居中国（含港、台）期刊的第2位）。《中国药房》杂志拥有全球编委350余名，其中包括钟南山、孙燕、张礼和、刘昌孝、郭应禄、陆道培、刘耕陶等多名中国科学院或中国工程院院士，李伯伟、黎奕生、周大为、蔡春玉等香港、澳门、台湾地区的药学专家20余名，以及大陆的药学教授（主任药师）200余名。
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