申请考核更注重论文发表方面的成果；统一考试是注重研究所需的基础知识和基本技能考核。二者的目的是相同的，但侧重点不同而已。
申请考核是指由考生个人提出申请，提交相关材料，通过初审、综合考核，按照择优录取原则进行录取的招考方式，与此相应的是，参加“申请审核”制选拔的考生，不再参加学校组织的博士入学初试。
申请考核制的考生需要提交一系列材料，这些材料除了基本的个人信息外，主要涉及外语、科研等综合能力方面的要求，比如很多学校规定英语六级必须考多少分（或者托福、雅思等成绩替代）、发表以第一作者发表SCI学术论文几篇等。此外，也有部分院校在招生简章中明确，申请人的硕士毕业学校必须是双一流高校（985院校／211院校等）。
对于以同等学力身份进行报考的考生也提出了更高的要求，如清华大学则是个别获学士学位后有八年以上实际工作经历的优秀人；南开大学只允许个别科研能力强、导师推荐的同等学力者报考；有的高校招生导师甚至直接写明不招同等学力或者跨专业的学生。
总体来看，对于申请人的综合素质要求更高，不再是过去初试成绩的优秀便可进入复试，甚至最终的总成绩也很靠前，现在则是如果能力达不到院系要求，就无法进入复试阶段。
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