东北亚研究院是一个集东北亚政治、经济、人口、历史、文化等多学科的综合研究单位,在东北亚问题的研究方面具有非常雄厚的研究实力和研究基础。已经形成了以东北亚区域经济、政治、历史、人口为优势的学科体系。主要有日本经济、俄罗斯经济、朝鲜与韩国经济、 区域经济理论、 区域经济开发战略、东北亚区域政治、人口社会学、人口经济学、人口资源与环境、资源与环境经济学、经济社会与可持续发展、日本文学、中日关系史、俄国史等研究方向。2000-2009年,东北亚研究院围绕日本、朝鲜、韩国、俄罗斯以及东北亚区域合作问题,出版了多部著作、译著,在国内外刊物上发表了大量的论文,提交了多篇研究报告(有的已经被国家有关部门所采纳),充分发挥了为国家决策部门提供咨询意见、服务于地方经济建设的作用。共出版各类著作46部,其中著作38部、译著5部、工具书等其它著作3部;共发表论文542篇,共提交各类研究报告109篇,有16项科研成果分别获得了优秀著作、论文类奖项(其中,教育部级奖1项,省级奖7项,市级奖8项)。2000-2005年,东北亚研究院共承担各类项目94项,其中教育部211工程重点学科建设项目1项,国家社科基金项目14项(其中重大项目1项),教育部人文社会科学重点研究基地重大项目8项,教育部其它项目14项,横向项目18项,吉林省社科基金项目10项(其中重大项目1项),吉林大学社科项目29项,共获资助经费计1000多万元。